Libellé préféré : SARS-CoV-2; 
Synonyme CISMeF : coronavirus 2 du syndrome respiratoire aigu; 
Lien Wikipédia : https://fr.wikipedia.org/wiki/SARS-CoV-2; 
UNII : txid2697049; 
         
         
            Identifiant d'origine : D000086402; 
CUI UMLS : C5203676; 
Alignements automatiques CISMeF supervisés
                  
                  
                
               
Alignements automatiques exacts (par équipe CISMeF)
                  
                
               
Alignements manuels CISMeF
                
               
Concept(s) lié(s) au record
                
               
Concepts Supplémentaires MeSH en relation
                
               
Correspondances UMLS (même concept)
                  
                  
                  
                
               
Est un principe actif de la ou du
                
               
Liste des qualificatifs affiliables
                  
                  
                  
                  
                  
                  
                  
                  
                  
                  
                  
                  
                
               
Type(s) sémantique(s)
                     - virus [Type sémantique UMLS]
 
                  
                
               
Voir aussi
                
               
Voir aussi (proposés par CISMeF)
                
               
Voir aussi inter- (CISMeF)
                
            
          
         
         
         
         
N2-AUTOINDEXEE
De l’Origine du SARS-CoV-2 aux risques de zoonoses et de manipulations dangereuses
            de virus
https://www.academie-medecine.fr/de-lorigine-du-sars-cov-2-aux-risques-de-zoonoses-et-de-manipulations-dangereuses-de-virus/
Cinq ans après le début de la pandémie de COVID-19, l’origine du virus SARSCoV-2 reste
            une énigme. L’hypothèse de l’origine naturelle est opposée à celle d’un virus manipulé
            dans un laboratoire à Wuhan en Chine, point de départ de la pandémie. Connaître l’histoire
            de la pandémie permet une analyse des risques. Les risques zoonotiques restent majeurs
            et persistent voire augmentent ; il est donc nécessaire d’établir des recommandations
            en matière de surveillance épidémiologique. Les risques liés aux manipulations génétiques
            de virus sont également croissant et il faut sensibiliser les chercheurs et les étudiants
            face à leurs responsabilités scientifiques et éthiques liées à la finalité de leurs
            travaux et face aux risques d’accidents/incidents de laboratoire. Le contexte actuel
            de développement technologique en biologie incluant l’IA peut induire de graves conséquences
            en l’absence de contrôle et de réflexion sur leurs impacts possibles, notamment sur
            en matière de biosécurité.
2025
Académie Nationale de Médecine
France
rapport
manipulation
Virus
zoonoses
zoonose
virus
risque
manipulation psychologique
SARS-CoV-2
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N3-AUTOINDEXEE
Stratégies de surveillance génomique : expérience du SARS-CoV-2 et applications aux
            pathogènes émergents
https://www.santepubliquefrance.fr/maladies-et-traumatismes/maladies-et-infections-respiratoires/covid-19/documents/rapport-synthese/strategies-de-surveillance-genomique-experience-du-sars-cov-2-et-applications-aux-pathogenes-emergents
La crise du Covid-19 en France a nécessité de mettre en place rapidement un système
            de surveillance génomique à l'échelle nationale et régionale afin d'évaluer son impact
            en santé publique : le consortium EMERGEN (consortium de surveillance et de recherche
            sur les infections de pathogènes EMERgents via la GENomique microbienne). Les activités
            de Santé publique France concernant ce consortium ont été financées par différentes
            sources, dont le projet SEQ4EPI (Sequencing pathogens for epidemiology). Fort de l'expérience
            avec le SARS-CoV-2, le consortium EMERGEN a permis de bâtir une infrastructure robuste
            de séquençage, intégrant une base de données génomique nationale (EMERGEN-DB), des
            outils bioinformatiques, et un réseau de laboratoires de séquençage. Initialement
            focalisé sur le suivi des variants du SARS-CoV-2, ce modèle prouve en 2024 sa capacité
            à s'adapter à d'autres agents pathogènes, notamment le virus monkeypox (Mpox) et l'influenza
            zoonotique. Ce document explore les stratégies de surveillance génomique des pathogènes
            émergents, en tirant parti des leçons apprises lors de la pandémie de COVID-19. Il
            propose un cadre méthodologique pour étendre ces outils à d'autres pathogènes prioritaires,
            en intégrant une approche  One Health  pour coordonner la santé humaine, animale et
            environnementale. Ce mémento synthétise les enjeux critiques : élaboration d'outils
            décisionnels pour les professionnels de santé publique, structuration des collaborations
            interdisciplinaires, et développement d'approches standardisées pour répondre rapidement
            aux urgences sanitaires. En se basant sur des scénarios réels, il propose une méthodologie
            adaptable à toute émergence. En conclusion, ce document souligne l'importance d'une
            coordination étroite entre épidémiologistes, microbiologistes et acteurs internationaux
            pour anticiper les menaces sanitaires globales. Il offre un guide pratique pour intégrer
            la génomique dans la surveillance de pathogènes émergents, tout en garantissant un
            équilibre entre efficacité opérationnelle et le respect des règles européennes concernant
            la protection de données.
2025
SPF - Santé publique France
France
rapport
organisation et administration
SARS-CoV-2
attention
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N2-AUTOINDEXEE
Recommandations relatives aux indications de l’utilisation des tests quadriplex (virus
            influenza A/B, RSV et SARS-CoV-2) et des tests multiplex étendus pour le diagnostic
            des viroses respiratoires dans le contexte hospitalier et établissement de soins
https://www.sfmu.org/fr/vie-professionnelle/outils-professionnels/consensus//recommandations-relatives-aux-indications-de-l-utilisation-des-tests-quadriplex-virus-influenza-a-b-rsv-et-sars-cov-2-et-des-tests-multiplex-etendus-pour-le-diagnostic-des-viroses-respiratoires-dans-le-contexte-hospitalier-et-etablissement-de-soins/con_id/561
Ce présent document porte sur l’utilisation des tests quadriplex (virus influenza
            A/B, RSV et SARS-CoV-2) et tests multiplex étendus pour le diagnostic des viroses
            respiratoires dans le contexte hospitalier et établissement de soins. Il n’évalue
            pas la place des tests antigéniques rapides « simplex » ou « multiplex » dans le contexte
            du dépistage des infections respiratoires virales, ni les tests multiplex très élargis
            dit « sur prélèvements bas », incluant en plus, les déterminants de résistance aux
            antibiotiques et la recherche d’un large panel de bactéries extra-cellulaires. Le
            diagnostic spécifique des viroses respiratoires doit être réalisé préférentiellement
            par une technique de biologie moléculaire sur un prélèvement naso-pharyngé qui est
            la technique de référence (éventuellement sur un prélèvement oro-pharyngé en cas de
            contre-indication du prélèvement naso-pharyngé). Pour mémoire, la composition des
            panels dépend des fournisseurs et peuvent comprendre, partiellement ou en totalité,
            en plus des principaux virus (virus influenza A et B, RSV et SARS-CoV-2), les métapneumovirus,
            les virus parainfluenza, les rhinovirus/entérovirus, les adénovirus, les coronavirus
            saisonniers (HCoV-229E, HCoV-HKU1, HCoV-NL63 et HCoV-OC43) et les bocavirus. Certains
            panels peuvent détecter également des bactéries atypiques (telles que Mycoplasma pneumoniae,
            Chlamydia pneumoniae, Bordetella pertussis et Bordetella parapertussis).
2025
SFMU - Société Française de Médecine d'Urgence
France
recommandation professionnelle
hôpital
utilisation hors indication
maladies virales
indication de
Soins
Virus
laisse entrevoir
diagnostic
hôpitaux
établissement de soins
virus de la grippe A
virus de l'influenza
aucun diagnostic
SARS-CoV-2
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N3-AUTOINDEXEE
Rapport d’activité 2024 du Laboratoire National de Référence : SARS-CoV-2 dans les
            eaux usées et les boues de stations d’épuration
https://www.anses.fr/fr/content/ra-lnr-sars-cov-2
2025
ANSES
France
rapport
eaux usées
rapport de recherche
SARS-CoV-2
rapport de laboratoire
eaux d'égout
laboratoires
eaux usées
---
N2-AUTOINDEXEE
Quels sont les bénéfices et les risques des interventions sur le lieu de travail visant
            à réduire le risque d'infection par le SARS-CoV-2 en dehors du secteur de la santé
            ?
https://www.cochrane.org/fr/CD015112/OCCHEALTH_quels-sont-les-benefices-et-les-risques-des-interventions-sur-le-lieu-de-travail-visant-reduire-le
Principaux messages - Nous n'avons pas trouvé de données probantes de haute qualité
            sur la meilleure façon de prévenir l'infection par le SARS-CoV-2 sur le lieu de travail.
            Nous avons trouvé une seule étude présentant des résultats, et ceux-ci sont très incertains.
            - Des études de plus grande envergure et bien conçues sont nécessaires pour mieux
            comprendre les bénéfices et les risques des différentes interventions sur le lieu
            de travail. Introduction au sujet de la revue La COVID-19 est une maladie infectieuse
            respiratoire qui s'est répandue dans le monde entier. Les personnes infectées par
            le SARS-CoV-2 (coronavirus du syndrome respiratoire aigu sévère 2), le virus responsable
            de la COVID-19, peuvent développer des maladies graves et risquer de mourir, en particulier
            les personnes âgées et celles souffrant de pathologies sous-jacentes. Différentes
            interventions visant à prévenir ou à réduire l'exposition des travailleurs au SARS-CoV-2
            sur le lieu de travail ont été mises en œuvre pendant la pandémie.
2024
Cochrane
Royaume-Uni
revue de la littérature
résumé ou synthèse en français
coronavirus du SARS
Santé
Lieu de travail
produits dangereux
effet secondaire associé avec une infection
lieu de travail
Risques et bénéfices
risque d'infection
quel mois est-ce maintenant ?
Appréciation des risques
Risque
infection
SARS-CoV-2
métier
---
N2-AUTOINDEXEE
Détection des génomes du virus de la grippe A et B, et du SARS-CoV-2 par RT-PCR dans
            un contexte d’exposition à risque à un virus influenza zoonotique
https://has-sante.fr/jcms/p_3520845/fr/detection-des-genomes-du-virus-de-la-grippe-a-et-b-et-du-sars-cov-2-par-rt-pcr-dans-un-contexte-d-exposition-a-risque-a-un-virus-influenza-zoonotique
Objectifs de l’évaluation L’objectif de ce travail était de :  définir la place de
            la détection des génomes des virus Influenza A et B de la grippe et du SARS-CoV-2
            par RT-PCR dans la stratégie diagnostique d’un cas suspect de grippe humaine due à
            un virus influenza d’origine zoonotique ;  évaluer les performances diagnostiques
            de la RT-PCR détectant la grippe A et B saisonnière pour la recherche d’un virus influenza
            A d’origine zoonotique chez les patients présentant des symptômes compatibles avec
            une infection par le virus SARS-CoV-2 ou une infection respiratoire hivernale, dont
            la grippe, dans un contexte d’exposition à risque à un virus influenza zoonotique
            ;  préciser les conditions de prélèvements respiratoires chez les cas possibles d’infection
            due à un virus influenza porcin ou aviaire. Ce travail a été mené en vue d’une extension
            d’indication d’un acte déjà pris en charge, en période de co-circulation du virus
            SAS-CoV-2 et des virus grippaux, par le système national d’assurance maladie en France.
            La prise en charge de cet acte dans cette indication s’étendrait à toute l’année.
2024
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false
false
HAS - Haute Autorité de Santé
France
évaluation technologique
grippe
SARS-CoV-2
cercopithecine herpesvirus 1
exposition à
exposition à
RT-PCR
Génome
coronavirus du SARS
grippe
génome
virus de l'influenza a
enquêteur
virus de la grippe A
herpèsvirus simien
génome viral
grippe humaine
virus influenza B
contexte d'application
RT-PCR
Exposition
Génome
Génomique
détection
risque
Virus
virus de la grippe A
---
N2-AUTOINDEXEE
Quelle est la fiabilité des tests de routine en laboratoire pour prédire la mortalité
            et la détérioration vers une forme grave ou critique de la COVID-19 chez les personnes
            atteintes du SARS-CoV-2 ?
https://www.cochrane.org/fr/CD015050/INFECTN_quelle-est-la-fiabilite-des-tests-de-routine-en-laboratoire-pour-predire-la-mortalite-et-la
Que sont les tests de routine en laboratoire ? Les tests de routine en laboratoire
            sont un ensemble d’analyses du sang couramment effectuées qui fournissent des informations
            sur l'état de santé d'un patient. Ces tests peuvent être utilisés pour identifier
            une maladie ou surveiller l’état de santé. Que voulions-nous découvrir ? Il est important
            d'identifier les patients qui se présentent à un rendez-vous médical dans un service
            ambulatoire ou au service des urgences qui présentent un risque élevé de développer
            une maladie grave due à la COVID-19 ou de mourir. Ceci peut aider les cliniciens à
            décider si les patients ont besoin d’être hospitalisés. Nous voulions savoir si les
            tests de routine en laboratoire étaient suffisamment fiables pour prédire la mortalité
            et la détérioration chez les patients atteints de SARS-CoV-2 confirmé. Comment avons-nous
            procédé ? Nous avons recherché des études évaluant la capacité des tests de routine
            en laboratoire de prédire la mortalité et la détérioration de l'état de santé des
            patients atteints d'un SARS-CoV-2 confirmé. Nous avons inclus des essais de tout schéma
            d'étude et conduits dans tout lieu du monde. Les patients de tout âge ou sexe ont
            été inclus.
2024
Cochrane
Royaume-Uni
revue de la littérature
résumé ou synthèse en français
COVID-19
analyse de laboratoire
personnes
COVID-19
mortalité
sévère
études d'évaluation comme sujet
SARS-CoV-2
maladie
Personna +
laboratoires
---
N3-AUTOINDEXEE
Quelle est la précision des tests moléculaires de laboratoire alternatifs (à la RT-PCR
            avec extraction/purification préalable de l'ARN) pour identifier les personnes infectées
            par le SARS-CoV-2 ?
https://www.cochrane.org/fr/CD015618/CENTRALED_quelle-est-la-precision-des-tests-moleculaires-de-laboratoire-alternatifs-la-rt-pcr-avec
Principaux messages : * Les tests d’amplification médiée par la transcription (TMA)
            et les tests de transcription inverse par réaction en chaîne de la polymérase (RT-PCR)
            disponibles dans le commerce et spécifiquement conçus pour omettre/adapter l'extraction/purification
            de l'ARN semblent suffisamment précis pour remplacer la méthode de RT-PCR avec extraction/purification
            préalable de l'ARN (molécule essentielle à la plupart des fonctions biologiques) pour
            identifier les personnes infectées par le coronavirus 2 du syndrome respiratoire aigu
            sévère (SARS-CoV-2), en particulier lorsque l'alternative serait de ne pas avoir accès
            au test. Toutefois, ces constatations doivent être interprétés et utilisés avec prudence
            en raison de plusieurs limites dans les données probantes. * La précision des autres
            types d'alternatives moléculaires de laboratoire à la RT-PCR est inférieure aux normes
            recommandées par l'Organisation mondiale de la Santé (OMS) ou ne dispose pas d'un
            volume de données probantes suffisant pour tirer des conclusions fiables. * L'extrapolation
            des données d’exactitude des tests évalués à toute autre marque(s) de test utilisant
            les mêmes techniques sera difficile puisque les principales catégories sont surreprésentées
            par des marques de test individuelles très précises. Une évaluation plus poussée de
            ces tests dans des scénarios de pratique clinique réelle est requise.
2024
Cochrane
Royaume-Uni
revue de la littérature
résumé ou synthèse en français
ARN
acide ribonucléique
RT-PCR
maladie infectieuse
Personna +
laboratoires
analyse de laboratoire
identifié
SARS-CoV-2
personnes
---
N2-AUTOINDEXEE
Orientations sur la sécurité biologique en laboratoire en rapport avec le SARS-CoV-2
            (COVID-19)
https://iris.who.int/bitstream/handle/10665/376333/WHO-WHE-EPP-2024.3-fre.pdf
L’objet de ce document est de fournir des orientations provisoires sur la sécurité
            biologique en laboratoire applicable à l’analyse d’échantillons cliniques issus de
            patients qui répondent aux critères de la définition des cas de maladie à coronavirus
            2019 (COVID-19) ainsi qu’aux travaux de recherche utilisant le SARS-CoV-2, le virus
            responsable de la COVID-19. Cette version met à jour les orientations provisoires
            et contient des recommandations révisées relatives aux travaux de recherche et aux
            procédures d’expédition. Il est important de noter que des vaccins sont disponibles
            et protègent contre les cas graves de la maladie. Ce document d’orientation est le
            reflet de l’état actuel des connaissances scientifiques.
2024
OMS - Organisation Mondiale de la Santé
Suisse
recommandation de santé publique
orientation
biologie
renvoi
biologique
coronavirus du SARS
rapport de laboratoire
biologie
Biologie
SARS-CoV-2
COVID-19
Sécurité
confinement de risques biologiques
Direction
orientation
Référer à
laboratoires
COVID-19
agents biologiques
orientation
rapport de recherche
COVID-19
---
N2-AUTOINDEXEE
Utilisation des services de santé par les personnes qui ont eu une infection confirmée
            par le SARS-CoV-2 et celles sans preuve documentée de l’infection
État des pratiques
https://www.inesss.qc.ca/publications/repertoire-des-publications/publication/utilisation-des-services-de-sante-par-les-personnes-qui-ont-eu-une-infection-confirmee-par-le-sars-cov-2-et-celles-sans-preuve-documentee-de-linfection.html
Sondage portant sur l’État des pratiques : Utilisation des services de santé par les
            personnes qui ont eu une infection confirmée par le SARS-CoV-2 et celles sans preuve
            documentée de l’infection Sondage portant sur le Coup d'œil: Utilisation des services
            de santé par les personnes qui ont eu une infection confirmée par le SARS-CoV-2 et
            celles sans preuve documentée de l’infection L’infection par le coronavirus 2 du syndrome
            respiratoire aigu sévère (SARS-CoV-2) peut être asymptomatique ou donner lieu à la
            maladie à coronavirus 2019 (COVID-19). De plus, elle peut mener à l’exacerbation ou
            l’aggravation de conditions préexistantes qui étaient connues ou non auparavant, à
            l’apparition de complications ou de séquelles de l’épisode aigu ainsi qu’au développement
            d’une affection post-COVID-19. Les répercussions à long terme de l’infection par le
            SARS-CoV-2 sur les personnes atteintes sont encore peu connues et aucune donnée ne
            permet d’apprécier leur impact sur le système de santé et de services sociaux québécois
            au-delà de la phase aigüe de l’infection. L’INESSS a donc réalisé un état des pratiques
            qui vise à comparer l’utilisation des services de santé des personnes qui ont eu une
            infection confirmée par le SARS-CoV-2 et de celles sans preuve documentée de l’infection
            au cours des deux premières années de pandémie.
2023
INESSS - Institut national d'excellence en santé et en services sociaux
Canada
rapport
Utilisation des services
maladie infectieuse
SARS-CoV-2
Infection
Services de santé
services d'aide à domicile
Pratique
personnes
Personna +
---
N3-AUTOINDEXEE
L’infection par le SARS-CoV-2 confère-t-elle une protection contre une réinfection
            ?
https://minerva-ebp.be/FR/Article/2342
Analyse de COVID-19 Forecasting Team. Past SARS-CoV-2 infection protection against
            re-infection: a systematic review and meta-analysis. Lancet 2023;401:833-42. DOI:
            10.1016/S0140-6736(22)02465-5 Question clinique Quel est le niveau de protection contre
            une nouvelle infection par le SARS-CoV-2 après une infection précédente, en tenant
            compte du variant et du délai après l’infection précédente ? Conclusion Cette revue
            systématique actualisée, qui a été menée correctement, montre que le degré de protection
            contre la réinfection par le SARS-CoV-2 après une primo-infection par un variant pré-Omicron
            est élevé, mais diminue avec le temps. La protection est plus faible contre la réinfection
            par un variant Omicron. De plus, la protection contre la réinfection avec des sous-variants
            Omicron est plus élevée après une primo-infection avec un variant Omicron qu’avec
            les variants pré-Omicron. Pour tous les variants, la protection conférée par une primo-infection
            est robuste contre l’hospitalisation et contre le décès.
2023
Minerva - Revue d'Evidence-Based Medicine
Belgique
lecture critique d'article
quel mois est-ce maintenant ?
réinfection
Intimité
SARS-CoV-2
effet secondaire associé avec une infection
maladie infectieuse
coronavirus du SARS
réinfection
réinfection au COVID-19
---
N3-AUTOINDEXEE
Lymphocyte T, SARS-CoV-2 et Macrophage alvéolaire : le bon, la brute et le truand
            dans les poumons ?
https://www.srlf.org/article/lymphocyte-t-sars-cov-2-macrophage-alveolaire-bon-brute-truand-poumons
Circuits between infected macrophages and T cells in SARS-CoV-2 pneumonia. Grant RA,
            Morales-Nebreda L, Markov NS, Swaminathan S, Querrey M, Guzman ER, et al. Nature.
            2021 Feb 1;590(7847):635–41. Lien Texte Question évaluée Ce travail explore l’immunopathologie
            du développement du SDRA au cours de l’infection par SARS-CoV-2. L’approche était,
            sans hypothèse mécanistique préconçue, mais partait de l’idée simple que les cellules
            en première ligne de l’infection, en particulier les macrophages alvéolaires et les
            cellules épithéliales, devaient jouer un rôle clé dans l’amplification de la réponse
            immunitaire pulmonaire. Type d’étude Il s’agit d’une étude translationnelle se basant
            sur les données cliniques et les échantillons biologiques obtenus dans le cadre d’une
            cohorte prospective incluant des patients atteints de pneumonie sévère (cohorte monocentrique
            du Northwestern Memorial Hospital à Chicago).
2023
SRLF - Société de Réanimation de Langue Française
France
lecture critique d'article
macrophages alvéolaires
poumon
Ostéonécrose associée aux biphosphonates
lymphocyte t
Lymphocyte T
Macrophage alvéolaire
coronavirus du SARS
SARS-CoV-2
lymphocytes T
macrophage alvéolaire
quel mois est-ce maintenant ?
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N2-AUTOINDEXEE
Recommandations relatives aux indications de l’utilisation des tests quadriplex (virus
            influenza A/B, RSV et SARS-CoV-2) et tests multiplex étendus pour le diagnostic des
            viroses respiratoires dans le contexte hospitalier et établissement de soins
https://www.sfm-microbiologie.org/2023/12/22/recommandations-indications-utilisation-tests-quadriplex-multiplex/
Dans le contexte de la circulation du SARS-CoV-2 parmi les autres virus respiratoires
            (le RSV et les virus influenza en particulier) et du fait de l’impossibilité de faire
            un diagnostic clinique ou radiologique étiologique (hors cluster), il est recommandé
            de détecter d’emblée au moins les 4 principaux virus respiratoires, c’est-à-dire le
            SARS-CoV-2, les virus influenza A et B et le RSV, à la fois chez l’enfant et l’adulte.
            Le Groupe de travail « virus respiratoires » du Réseau de virologie et pharmacologie
            médicale de l’ANRS-MIE et un représentant de la SFM se sont réunis afin de lister
            les indications du dépistage et du diagnostic des infections par les virus respiratoires
            en milieu hospitalier par utilisation des tests permettant le diagnostic simultané
            des virus influenza A et B, du RSV et du SARS-CoV-2 (test quadriplex), ainsi que pour
            recommander le positionnement de ces tests par rapport à un panel virus respiratoires
            plus étendu (tests multiplex). Pour mémoire, la composition des panels dépend des
            fournisseurs et peuvent comprendre, partiellement ou en totalité, en plus des principaux
            virus (virus influenza A et B, RSV et SARS-CoV-2), les métapneumovirus, les virus
            parainfluenza, les rhinovirus/entérovirus, les adénovirus, les coronavirus banals
            (HCoV-229E, HCoV-HKU1, HCoV-NL63 et HCoV-OC43). Certains panels peuvent détecter également
            des bactéries atypiques (tel que Mycoplasma pneumoniae, Chlamydia pneumoniae et Bordetella
            pertussis) ou Legionella spp.
2023
SFM - Société Française de Microbiologie
France
recommandation de santé publique
indication de
signe du système respiratoire
virus du sarcome de rous
contexte d'application
Soins
SARS-CoV-2
virus respiratoire syncytial humain
hôpitaux
Système respiratoire
coronavirus du SARS
virus de la grippe A
étude diagnostique
Virus
virus de l'influenza
aucun diagnostic
virus influenza C
utilisation
Structure de soins
diagnostic
établissement de soins
maladie
maladies virales
virus du sarcome aviaire
hôpital
utilisation hors indication
laisse entrevoir
virus respiratoires syncytiaux
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N3-AUTOINDEXEE
Hésitation vaccinale et vaccinoscepticisme concernant les vaccins contre SARS-COV
            2
https://dumas.ccsd.cnrs.fr/dumas-04386119
L’hésitation vaccinale, c’est-à-dire l’acte d’abstention ou de report d’une vaccination
            a été classé en 2019 par l’OMS parmi les 10 principales menaces pesant sur la santé
            à l’échelle mondiale. En France, la pandémie de Covid-19 a montré que malgré un contexte
            d’urgence sanitaire, l’obtention d’une couverture vaccinale étendue était difficile.
            Au moyen d’une revue bibliographique attentive, nous nous sommes proposés, après un
            rappel des éléments contextuels de déterminer la prévalence de ce phénomène en France,
            d’en rechercher les déterminants et de confronter ces données à celles de la littérature
            afin de discuter de leur pertinence de façon critique. Nous avons ainsi pu constater
            qu’environ 35% des français se déclaraient comme hésitants vis-à-vis des vaccins anti-Covid,
            de même qu’environ un quart des professionnels de santé, malgré des évaluations de
            terrain favorables en termes d’efficacité et de sécurité. Nous avons toutefois souligné
            le fait que les caractéristiques de ces vaccins ne répondent que de façon incomplète
            aux objectifs fixés par les institutions sanitaires compétentes. La lutte contre l’hésitation
            vaccinale constitue un enjeu de santé publique qui devra à l’avenir impliquer une
            meilleure formation des professionnels de santé sur la vaccination et la communication
            associée car ils sont des acteurs cruciaux de l’adhésion thérapeutique de leur patientèle.
2023
DUMAS - Dépôt Universitaire de Mémoires Après Soutenance
France
thèse ou mémoire
vaccination
vaccination
vaccination; médication préventive
vaccin
coronavirus du SARS
vaccine
SARS-CoV-2
vaccins
vaccins
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N3-AUTOINDEXEE
Pandémie COVID et personnes âgées en France : impact de la pandémie sur le profil
            des personnes âgées admises pour infection grave à SARS-CoV-2 en réanimation en France
https://dumas.ccsd.cnrs.fr/dumas-04342814
Contexte : la population générale vieillit, ainsi de plus de plus de personnes âgées
            sont admises en réanimation. La période COVID a bouleversé nos pratiques. Les moyens
            limités que nous avions nous ont amené à réfléchir d’autant plus sur nos critères
            d’admission en réanimation. Nous pouvons nous poser la question des conséquences possibles
            de la pandémie COVID 19 sur la prise en charge et sur le profil des personnes âgées
            admises en réanimation en France. Nous allons ainsi comparer les caractéristiques
            des personnes âgées de plus de 80 ans admises en réanimation en France pour insuffisance
            respiratoire aiguë sur infection à SARS-CoV-2 versus insuffisance respiratoire aiguë
            d’étiologie autre, avant la pandémie COVID, comparer également la survie et les décisions
            de limitations et d’arrêts des thérapeutiques actives.  br Méthodes : nous avons comparé
            deux cohortes issues de deux études internationales étudiant les personnes âgées hospitalisées
            en réanimation avant le COVID (VIP2) et les personnes âgées admises pour détresse
            respiratoire sur infection à SARS-CoV-2 (COVIP), en extrayant les personnes de plus
            de 80 ans et uniquement les données françaises. Les caractéristiques initiales de
            chaque cohorte ont été répertoriées, ainsi que les modalités de suppléance d’organe,
            la durée de séjour, la survie et les limitations et arrêts de thérapeutiques actives.
            Nous avons réalisé également une analyse appariée selon l’âge ( -2 ans), le genre,
            le SOFA score ( - 2) et le score CFS de fragilité ( - 1) selon un ratio 1 : 2 (1 COVID
            pour 2 non COVID) br Résultats et conclusion : 440 patient·es de 80 ans et plus admis·es
            en réanimation en France ont été inclus·es dans cette étude : 123 issu·es de la cohorte
            COVIP et 317 de la cohorte VIP2. Dans cette étude comparative, parmi les personnes
            âgées de 80 ans et plus en France incluses, le groupe COVID est constitué de plus
            d’hommes, de personnes moins âgées, d’un score de fragilité plus faible ainsi que
            d’une évaluation de l’autonomie plus élevée que dans le groupe non COVID. La cohorte
            COVID avait bénéficié de plus de ventilation mécanique par rapport à la cohorte non
            COVID, ainsi que de plus de vasopresseurs. Dans l’analyse appariée, il y a 94 patient·es
            issu·es de COVIP apparié·es avec 158 patient·es de VIP2. Ces résultats restaient significatifs
            après appariement selon les facteurs d’âge, de genre, de SOFA score et de score CFS
            de fragilité. Cette étude a montré également un taux plus élevé de limitations et
            d’arrêt des thérapeutiques actives dans le groupe COVID par rapport aux non COVID
            après appariement. Nous constatons un taux de mortalité plus élevé chez celles atteintes
            d’une insuffisance respiratoire aiguë sur infection à SARS-CoV-2 par rapport à celles
            atteintes d’insuffisance respiratoire aiguë hors COVID. (59,5 % versus 31,94%).
2023
DUMAS - Dépôt Universitaire de Mémoires Après Soutenance
France
thèse ou mémoire
PERSONNE AGEE
infection
coronavirus du SARS
personne âgée
gène CHFR
pandémies
sujet âgé
raisonnement
France
sérieux
profil
effet secondaire associé avec une infection
touble pandémique
supplément oral arginine, omega 3 et nucléotides
personne âgée
français
réanimation
SARS-CoV-2
sévère
COVID-19
réanimation
sujet âgé de 80 ans ou plus
maladie infectieuse
---
N2-AUTOINDEXEE
Recommandations relatives aux indications médicales du génotypage par séquençage des
            virus respiratoires dont le SARS-CoV-2
https://www.sfm-microbiologie.org/wp-content/uploads/2023/06/Recommandations-geenotypage-V1_2023-06-12.pdf
Dans le contexte de l’évolution de la pandémie de la COVID-19, un groupe de travail
            représenté par la SF2H, la SFM et le réseau de virologie de l’ANRS-MIE s’est réuni
            le 24/05/2023 afin de redéfinir les indications du séquençage des génomes du SARS-CoV-2
            et des autres virus respiratoires (dont grippe et virus respiratoire syncytial (VRS))
            à visée médicale. Le séquençage réalisé dans le cadre de la surveillance de l’évolution
            des virus ne sera pas abordé. Ces recommandations font suite à une demande de différents
            acteurs nationaux (laboratoires hospitaliers/ autorités de santé) de préciser ces
            indications dans un contexte général de sortie de crise. La pandémie de COVID-19 a
            permis de démocratiser le séquençage du SARS-CoV-2 et d’en apprécier les apports pour
            la prise en charge des patients. Ces données sont applicables à d’autres virus responsables
            d’infections respiratoires parfois sévères (notamment les virus de la grippe et le
            VRS).
2023
SFM - Société Française de Microbiologie
France
recommandation pour la pratique clinique
SARS-CoV-2
laisse entrevoir
directives de santé publique
Séquençages
indication de
Virus
analyse de séquence
indicateurs et réactifs
Génotypage
virus
profilage d'ADN
---
N2-AUTOINDEXEE
Le SARS-COV-2 et les organes et le matériel de corporel humain (MCH) destinés à la
            transplantation : état des lieux scientifique et directives pratiques pour les centres
            de transplantation et les établissements de MCH
https://www.health.belgium.be/fr/avis-9713-covid-19-et-transplantation-dorganes-et-mch
Jusqu'à présent, aucune transmission du COVID-19 par transplantation d'organe ou de
            tissu n'a été signalée, à l'exception des transplantations pulmonaires. Mais comme
            le SARS-CoV-2 a été détecté dans de nombreux tissus et cellules, la possibilité d'une
            telle transmission ne peut être totalement exclue. Dans le contexte épidémiologique
            actuel, l’anamnèse approfondie pour identifier les symptômes indiquant la COVID-19
            reste donc primordiale pour les donneurs vivants et le dépistage par test PCR du SARS-CoV-2
            pour les donneurs décédés. Dans son avis 9713, le Conseil Supérieur de la Santé propose
            notamment un diagramme pratique pour chaque situation (donneur d'organe vivant, donneur
            de matériel corporel humain (MCH) vivant, donneur d'organe décédé et donneur de MCH
            décédé). Cet avis peut également servir de base pour faire face à d'éventuelles futures
            pandémies.
2023
SPF - Service Public Fédéral - Santé publique, Sécurité de la Chaîne alimentaire et
            Environnement
Belgique
recommandation de santé publique
Matériaux
Organisme
Centre
transplantation
homo sapiens
Organismes
partie d'un organe
humains
transplantation
émigration et immigration
Pratique
central
corps humain
Directives
SARS-CoV-2
leadership
---
N2-AUTOINDEXEE
Avis relatif à la prise en charge du corps d’une personne décédée et infectée par
            un virus à tropisme respiratoire (incluant la mise à jour des avis publiés dans un
            contexte d’épidémie de SARS-CoV-2)
https://www.hcsp.fr/explore.cgi/avisrapportsdomaine?clefr=1315
Après avoir pris en compte l’évolution virologique du SARS-CoV-2, la situation épidémiologique
            du Covid-19, ses modes de transmission maintenant bien connus et les aspects humains,
            éthiques et juridiques dans le champ du deuil, le HCSP recommande de ne plus maintenir
            les dispositions particulières au SARS-CoV-2 pour les pratiques et rites funéraires
            sur le corps d’une personne décédée d’un Covid-19 suspecté ou confirmé. En effet,
            le SARS-CoV-2 n’est plus considéré comme un virus émergent et ne présente pas de sur-risque
            infectieux par rapport aux autres viroses respiratoires. Le HCSP recommande toutefois
            le respect des précautions universelles d’hygiène et des mesures de protection individuelle
            et collective (équipement de protection individuel…) lors de la prise en charge d’un
            défunt. Le HCSP recommande de veiller à former et à informer les personnels de santé
            et les agents des services funéraires sur l’évolution de la situation épidémiologique
            du Covid-19. Le HCSP recommande également de se conformer à son avis de 2012 s’agissant
            de la thanatopraxie comme pour toute autre pathologie respiratoire virale.
2023
HCSP - Haut Conseil de la Santé Publique
France
recommandation de santé publique
maladie infectieuse
SARS-CoV-2
Parties du corps
Personna +
Virus
Épidémies de maladies
Virus
Virus
Épidémies
virus
personnes
infections de l'appareil respiratoire
gestion des soins aux patients
Infection respiratoire
jugement
tropisme
corps humain
relations interpersonnelles
---
N2-AUTOINDEXEE
Le SARS-CoV-2 : une expérience inédite de surveillance génomique mondiale
https://interstices.info/le-sars-cov-2-une-experience-inedite-de-surveillance-genomique-mondiale/
Depuis le début de la pandémie de SARS-CoV-2, la surveillance de l’évolution du génome
            du virus avec son séquençage en continu est devenue un élément clé de santé publique.
            En effet, le génome d’un virus est par nature très dynamique, avec une évolution qui
            se manifeste par l’accumulation rapide de mutations. Disposer au fil du temps de nombreux
            génomes d’origines géographiques variées est donc nécessaire pour identifier l’émergence
            de variants, des lignées porteuses de mutations-clés susceptibles d’affecter la pathogénicité
            et la transmissibilité du virus, voire de mener à un échappement vaccinal. Ce type
            de surveillance a pu être expérimenté ces dernières années avec la grippe saisonnière,
            les virus Ebola ou Zika, et a atteint une ampleur inédite avec le suivi du SARS-CoV-2.
            Une telle tâche requiert des moyens de génération, d’analyse bioinformatique et de
            partage des données particulièrement optimisés et ambitieux. Comment cela se passe-t-il
            ?
2023
)i( interstices
France
information scientifique et technique
SARS-CoV-2
génome
génomique
organisation et administration
---
N2-AUTOINDEXEE
Coronavirus du syndrome respiratoire aigu sévère 2 (SRAS CoV-2)
https://www.canada.ca/fr/sante-publique/services/biosecurite-biosurete-laboratoire/fiches-techniques-sante-securite-agents-pathogenes-evaluation-risques/coronavirus-syndrome-respiratoire-aigu-severe-2.html
Le SRAS-CoV-2 est un virion enveloppé qui possède un génome à ARN linéaire simple
            brin. La taille des virions se situe entre 60 et 140 nm. Les pics à la surface des
            virions de coronavirus leur donnent l'apparence d'une couronne solaire, d'où le nom
            de Coronaviridae par lequel est désignée cette famille de virus. La taille du génome
            du SRAS-CoV-2 fluctue entre 29,8 kB et 29,9 kB. Il comporte 12 cadres de lecture ouverts
            qui codent 27 protéines dont quatre protéines structurelles : la protéine de spicule
            (glycoprotéine S) pour la liaison au récepteur ACE2 sur la cellule hôte, la protéine
            d'enveloppe (protéine E), la glycoprotéine membranaire (protéine M) et la phosphoprotéine
            nucléocapside (protéine N). Deux protéases du SRAS-CoV-2 sont essentielles à la réplication
            du virus.
2023
Gouvernement du Canada
Canada
information scientifique et technique
Syndrome respiratoire aigu sévère
Coronavirus
syndrome respiratoire aigu sévère
coronavirus
SARS-CoV-2
sévère
son aigu
---
N2-AUTOINDEXEE
Première vague épidémique de SARS-CoV-2 en Nouvelle-Aquitaine : facteurs associés
            à la gravité, à l’anosmie et/ou l’agueusie et à la transmission intra-foyer, mars-avril
            2020
http://beh.santepubliquefrance.fr/beh/2023/6/2023_6_2.html
Contexte – L’enquête Score 19 a été menée en Nouvelle-Aquitaine auprès des foyers
            familiaux touchés par la Covid-19 entre mars et avril 2020 lors de la première vague
            épidémique. Le second volet de cette enquête avait pour objectifs de (i) décrire les
            caractéristiques cliniques des cas de Covid-19, (ii) identifier les facteurs associés
            à une hospitalisation, à une admission en soins critiques, à la survenue d’une anosmie
            et/ou d’une agueusie et (iii) évaluer les facteurs ayant pu favoriser la transmission
            du SARS-CoV-2 au sein des foyers. Matériel et méthode – Une étude transversale a été
            menée par entretiens téléphoniques auprès des personnes ayant eu un prélèvement positif
            pour la recherche de SARS-CoV-2 entre le 1er mars et le 30 avril 2020 et de l’ensemble
            des membres de leur foyer, qu’ils aient présenté ou non des symptômes. Les caractéristiques
            cliniques des cas de Covid-19 ont été décrites. Les rapports de prévalences des facteurs
            associés à une hospitalisation, une admission en soins critiques et la déclaration
            d’une anosmie et/ou agueusie ont été estimés par des modèles de régression de Poisson.
            Pour évaluer la transmission intra-foyer, les taux d’attaque secondaires (TAS) ont
            été calculés pour les foyers de 3 à 5 personnes. Les facteurs indépendamment associés
            au TAS ont été étudiés à partir de modèles de régression ordinale.
2023
SPF - Santé publique France
France
article de périodique
Aquitaine
agueusie
mars
absence du sens de l'odorat
focal
foyer
facteur
gravitation
gravité
Anosmie
SARS-CoV-2
Agueusie
anosmie
agueusie
épidémies
Pesanteur
Transmissions
---
N2-AUTOINDEXEE
Positionnement de la SFAR sur la stratégie de dépistage covid-19 avant une chirurgie
            programmée en période de circulation du variant omicron de SARS-COV-2
https://sfar.org/positionnement-de-la-sfar-sur-la-strategie-de-depistage-covid-19-avant-une-chirurgie-programmee-en-periode-de-circulation-du-variant-omicron-de-sars-cov-2/
Les résultats de plusieurs études conduites pendant les premières vagues épidémiques
            de COVID-19 ont conduit la SFAR à préconiser un report de toute chirurgie programmée
            chez un patient ayant une PCR SARS-CoV-2 préopératoire positive d’au moins 6 semaines
            révolues, si la balance bénéfice-risque de ce report restait favorable après avoir
            tenu compte de l’indication opératoire. Cette stratégie reposait donc sur un dépistage
            préopératoire systématique de l’infection à SARS-CoV-2. Jusqu’à présent, les données
            disponibles concernant les vagues épidémiques suivantes ne justifiaient pas de modification
            de cette stratégie diagnostique préopératoire. Deux modifications épidémiologiques
            importantes sont survenues au cours de l’année 2022 : i. le déploiement de campagnes
            vaccinales contre le SARS-CoV-2 ayant permis une large couverture vaccinale de la
            population française, élément permettant une réduction de la transmission virale et
            une diminution de la sévérité clinique si une infection est toutefois contractée ;
            ii. l’émergence et la diffusion quasi exclusive à ce jour du variant Omicron (et de
            ses différentes sous-lignées) de SARS-CoV-2, présentant une plus grande contagiosité
            mais responsable de moins de formes graves.
2023
SFAR - Société Française d'Anesthésie et de Réanimation
France
information scientifique et technique
COVID-19
Dépistage
Chirurgie
Dépistage de masse
intervention chirurgicale
SARS-CoV-2
Programmes
COVID-19
chirurgie générale
Périodique
---
N3-AUTOINDEXEE
Protocole générique : étude de cohorte prospective sur les issues maternelles, néonatales
            et de la grossesse pour les femmes et les nouveau-nés infectés par le SARS-CoV-2,
            1er novembre 2022
https://apps.who.int/iris/handle/10665/365904
Lorsqu’un nouveau virus émerge, notre capacité à comprendre l’infection – ses modes
            de transmission, sa gravité, ses caractéristiques cliniques et les facteurs de risque
            qui y sont associés – est limitée au début de l’épidémie. Pour faire face à ces inconnues,
            l’Organisation mondiale de la Santé (OMS) a publié des protocoles pour la réalisation
            d’enquêtes spéciales dans différents contextes. Dans le cadre de la maladie à coronavirus
            récente (COVID-19), les données recueillies à l’aide de ces protocoles d’enquête sont
            essentielles pour affiner les recommandations relatives aux définitions et à la surveillance
            des cas, pour déterminer les principales caractéristiques épidémiologiques de la COVID-19,
            pour mieux comprendre la propagation, la gravité et le spectre de la maladie ainsi
            que ses répercussions sur la communauté, et pour formuler des orientations pour la
            mise en œuvre de contre-mesures, telles que l’isolement des cas et la recherche des
            contacts. Ces protocoles sont conçus pour permettre la collecte rapide et systématique
            des données dans un format qui facilite la comparaison entre différents contextes
            à l’échelle mondiale. Tous les protocoles de l’OMS relatifs à la COVID-19, ainsi que
            les documents d’orientation technique, sont disponibles (en anglais) sur le site Web
            de l’OMS. Ce protocole peut faire l’objet de révisions, dans l’attente de processus
            de gouvernance de la recherche.
2023
OMS - Organisation Mondiale de la Santé
Suisse
information scientifique et technique
SARS-CoV-2
études prospectives
nouveau-né
Prospectives
nouveau-né
Issue de la grossesse
Études de cohortes
grossesse
mère
maladie infectieuse
grossesse
Générations
Infection
Femmes
caractéristiques familiales
---
N2-AUTOINDEXEE
Évolution des mesures d’isolement des personnes infectées par le SARS-CoV-2
https://www.hcsp.fr/explore.cgi/avisrapportsdomaine?clefr=1271
Dans un contexte de circulation exclusive du variant d’Omicron BA.5,le Haut Conseil
            de la santé publique (HCSP) actualise le rapport du 15 juin 2022. Le HCSP prend en
            considération que les matrices décisionnelles publiées en juin 2022 en situation de
            circulation du sous-variant BA.2 restent globalement valables et pertinentes dans
            la situation actuelle de circulation exclusive et stable de BA.5 sous réserve d’ajustements
            présentés ci-après. En termes d’actualisation des mesures, le HCSP préconise de :
            Raisonner en conduite syndromique (devant des manifestations cliniques évocatrices
            d’infection respiratoire virale) et promouvoir dans la population générale de nouvelles
            règles « universelles d’hygiène respiratoire » post Covid19, en particulier en période
            épidémique hivernale, reposant sur le port du masque par toutes les personnes ayant
            des symptômes d’infection respiratoire aiguë et dans les lieux confinés et clos avec
            forte densité de personnes.  Lever les mesures d’isolement systématique et obligatoire
            chez les personnes présentant des symptômes d’infection respiratoire aiguë.  Maintenir
            l’application de l’ensemble des mesures barrières chez les personnes présentant des
            symptômes d’infection respiratoire aiguë et dans la population générale dans les lieux
            confinés et clos avec une forte densité de personnes.  Maintenir les recommandations
            figurant dans le rapport du 15 juin 2022 du HCSP pour les personnes contacts et la
            population générale.
2023
HCSP - Haut Conseil de la Santé Publique
France
recommandation de santé publique
SARS-CoV-2
Mesures
personnes
maladie infectieuse
poids et mesures
Infection
isolement
Personna +
---
N2-AUTOINDEXEE
SRAS-CoV-2 : Mesures de prévention, de contrôle et de gestion des éclosions en milieux
            de soins (excluant les milieux de soins de longue durée)
https://www.inspq.qc.ca/publications/3066-mesures-pci-eclosions-covid19
Lorsqu’un cas de COVID-19 est suspecté ou confirmé chez un TdeS ou un usager dans
            une installation ou sur une unité de soins, la rapidité d’intervention permet d’évaluer
            le potentiel de transmission, la gravité de la situation et d’instaurer les mesures
            requises afin de limiter l’ampleur de la transmission. Ce document fournit les recommandations
            pour tous les milieux de soins, soit les hôpitaux (soins de courte durée), les cliniques
            médicales (incluant les GMF, cliniques externes, cliniques de dépistages COVID-19,
            etc.), les milieux de réadaptation et les milieux de santé mentale.
2023
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INSPQ - Institut National de Santé Publique - Québec
Canada
COVID-19
recommandation de santé publique
programmes de gestion intégrée des soins de santé
Mesures
SARS-CoV-2
soins de longue durée
durée
environnement
poids et mesures
---
N2-AUTOINDEXEE
SRAS-CoV-2 : Définitions des termes en prévention et contrôle des infections dans
            les milieux de soins
https://www.inspq.qc.ca/publications/3212-definitions-pci-milieux-soins
Ce document présente un regroupement des définitions utilisées dans les différentes
            publications du Comité sur les infections nosocomiales du Québec (CINQ) pour la prévention
            et contrôle des infections (PCI) de la COVID-19 dans les différents milieux de soins
            du Québec. Ces définitions ont été retirées des publications actuelles du CINQ afin
            d’être regroupées dans ce document. Elles sont basées sur les connaissances actuelles
            de la COVID-19 et actualisées en fonction de l’évolution de la littérature scientifique
            et des documents produits par de nombreuses organisations nationales et internationales.
            Afin d’attirer votre attention, les modifications aux définitions déjà connues sont
            soulignées en jaune.
2023
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INSPQ - Institut National de Santé Publique - Québec
Canada
COVID-19
recommandation de santé publique
environnement
SARS-CoV-2
Infection
maladie infectieuse
soins
Prévention des infections
---
N2-AUTOINDEXEE
Déclaration provisoire du Groupe consultatif technique de l’OMS sur la composition
            des vaccins contre la COVID-19 (TAG-CO-VAC) relative aux vaccins contre la COVID-19
            dans le contexte de la circulation du variant Omicron du SARS-CoV-2
https://www.who.int/fr/news/item/11-01-2022-interim-statement-on-covid-19-vaccines-in-the-context-of-the-circulation-of-the-omicron-sars-cov-2-variant-from-the-who-technical-advisory-group-on-covid-19-vaccine-composition
L’OMS a créé le Groupe consultatif technique sur la composition des vaccins contre
            la COVID-19 (TAG-CO-VAC) aux fins d’examiner et d’évaluer les incidences en matière
            de santé publique que les nouveaux variants préoccupants du SARS-CoV-2 ont sur les
            performances des vaccins contre la COVID-19 et de formuler, le cas échéant, des recommandations
            à l’intention de l’OMS quant à la composition de ces vaccins.     Dans le contexte
            de la circulation du variant préoccupant Omicron du SARS-CoV-2, le TAG-CO-VAC demande
            un accès plus large à l’échelle mondiale aux actuels vaccins contre la COVID-19, tant
            pour la primovaccination que pour les doses de rappel, dans l’espoir que cela atténue
            également l’apparition et l’impact de nouveaux variants préoccupants.     Le TAG-CO-VAC
            examine les souches devant composer les vaccins contre la COVID-19 et encourage les
            fabricants de vaccins à recueillir des données à petite échelle sur l’ampleur et la
            puissance de la réponse immunitaire induite par des vaccins monovalents et multivalents
            contre les variants préoccupants. Le Groupe consultatif tiendrait ensuite compte de
            ces informations dans un cadre décisionnel plus large sur la composition des vaccins.
2022
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OMS - Organisation Mondiale de la Santé
Suisse
COVID-19
vaccins contre la COVID-19
information scientifique et technique
variants SARS-CoV-2
Cicatrisation par la technique de pression négative
vaccination
Vaccins
Techniques
vaccination; médication préventive
Techniques
Vaccins
SARS-CoV-2
vaccin
vaccine
vaccination
Techniques
COVID-19
enregistrements
Techniques
Vaccine
variants SARS-CoV-2
Organisation Mondiale de la Santé
Groupes de discussion
---
N2-AUTOINDEXEE
Positionnement de la SFAR sur la place des tests antigéniques (tag) SARS-COV-2 pour
            le dépistage pré-interventionnel
https://sfar.org/positionnement-de-la-sfar-sur-la-place-des-tests-antigeniques-tag-sars-cov-2-pour-le-depistage-pre-interventionnel/?utm_source=rss&utm_medium=rss&utm_campaign=positionnement-de-la-sfar-sur-la-place-des-tests-antigeniques-tag-sars-cov-2-pour-le-depistage-pre-interventionnel
Du fait de l’augmentation importante du nombre de cas de COVID-19 et du nombre de
            sujets dépistés observée depuis le début de la 5e vague épidémique en France, un certain
            nombre de centres connaissent des pénuries plus ou moins importantes et durables en
            réactifs de PCR. Dans ce contexte, certaines structures se sont tournées vers l’utilisation
            de tests antigéniques (TAG) pour le dépistage des patients devant bénéficier d’une
            chirurgie ou d’une procédure interventionnelle. La SFAR tient à rappeler que la littérature
            disponible, y compris la plus récente, rapporte des sensibilités relativement médiocres
            des différents tests antigéniques actuellement disponibles. La sensibilité semble
            significativement meilleure : 1) chez les patients symptomatiques par rapport aux
            asymptomatiques ; 2) chez les patients avec une charge virale élevée par rapport à
            ceux avec une charge virale plus faible ; 3) chez les adultes par rapport aux enfants.
            Ainsi la sensibilité globale varie de 35% à 95% (avec une médiane d’environ 70%) en
            fonction des fournisseurs de TAG, de la population testée et du pourcentage de patients
            symptomatiques dans cette population. Chez les patients symptomatiques, la sensibilité
            varie majoritairement entre 70% et 95% (avec une médiane d’environ 80%). Chez les
            patients asymptomatiques, la sensibilité varie majoritairement entre 35% et 75% (avec
            une médiane d’environ 50%).
2022
SFAR - Société Française d'Anesthésie et de Réanimation
France
COVID-19
recommandation professionnelle
antigène a>m<
antigène ri^a^
antigène fy^a^
antigène sc2
antigène cl^a^
antigène rb^a^
antigène sf^a^
antigène to^a^
antigène bx^a^
antigène jk^a^
antigène jo^a^
antigène do^a^
antigène xg^a^
antigène in^a^
antigène r1^a^
antigène le^s^
antigène ch^a^
SARS-CoV-2
antigène en^a^ts
antigène sw^a^
antigène le^bl^
antigène hg^a^
antigène yk^a^
antigène m^a^
antigène mi^a^
antigène s1^a^
antigène st^a^
antigène le^c^
Prairie
antigène a>3<
antigène en^a^fr
antigène lw^b^
antigène kp^a^
antigène le^a^
antigène co^a^
antigène bp^a^
antigène ht^a^
antigène sd^a^
antigène at^a^
antigène th^a^
antigène g0^a^
antigène mt^a^
antigène or^a^
antigène a>2<b
antigène mo^a^
antigène dh^a^
antigène jc^a^
antigène pr>a<
antigène a>1<b
antigène 'n'
antigène er^a^
antigène gy^a^
antigène di^a^
antigène le^ns^
antigène a.m.
antigène re^a^
antigène m1^a^
antigène zt^a^
antigène yt^a^
antigène wd^a^
antigène a>3<b
antigène le^x^
antigène
antigène cr3
antigène rg^a^
antigène lan
antigène nijhuis
Antigènes
antigène lu^a^
antigène dr^a^
antigène ok^a^
antigène kn^a^
antigène tr^a^
Dépistage
antigène jn^a^
antigène n^a^
antigènes
antigène au^a^
antigène m'
antigène es^a^
antigène en^a^fs
antigène os^a^
Dépistage de masse
antigène an^a^
antigène c
antigène be^a^
antigène lw^a^
antigène fr^a^
antigène sk^a^
antigène rh^a^
antigène ol^a^
antigène pt^a^
antigène a>x<
antigène yh^a^
antigène vr
antigène pr^a^
antigène u1^a^
antigène rh42
antigène le^b^
antigène jr^a^
antigène mcc^a^
antigène js^a^
antigène wr^a^
antigène li^a^
antigène je^a^
antigène a>2<
antigène tj^a^
antigène le^bh^
antigène en^a^kt
antigène a>1< le^d^
antigène tg^a^
antigène rd^a^
antigène le^d^
antigène chr^a^
antigène a>1> le^b^
antigène bg^a^
antigène vg^a^
antigène du groupe sanguin c
antigène ny^a^
antigène ls^a^
antigène cs^a^
antigène wk^a^
---
N2-AUTOINDEXEE
Avis relatif aux masques dans le cadre de la lutte contre la propagation du virus
            SARS-CoV-2 en rapport avec l'émergence du variant Omicron
https://www.hcsp.fr/explore.cgi/avisrapportsdomaine?clefr=1147
Le Haut Conseil de la santé publique (HCSP) a été saisi le 17 décembre 2021 par la
            Direction générale de la santé (DGS) afin de disposer d’un avis sur un éventuel renforcement
            du niveau de précaution dans la lutte contre la propagation du virus SARS-CoV-2, avec
            en particulier la question du port d’un masque FFP2 en population générale ou à risque,
            dans le contexte d’émergence et de remplacement par le variant Omicron (clusters massifs,
            contaminations en intérieur, nombreux cas secondaires à partir d’un cas infecté …).
2022
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HCSP - Haut Conseil de la Santé Publique
France
COVID-19
recommandation de santé publique
virus du SRAS
lutte
Virus
virus
variants SARS-CoV-2
SARS-CoV-2
jugement
variants SARS-CoV-2
rapport de recherche
masques
Virus
Lutte
rapport albumine/globuline
Virus
---
N2-AUTOINDEXEE
Avis relatif au port des appareils de protection respiratoire de type FFP2 par les
            professionnels de santé dans le cadre de la lutte contre la propagation du virus SARS-CoV-2
https://www.hcsp.fr/explore.cgi/avisrapportsdomaine?clefr=1148
Le HCSP examine les stratégies d’indications du port des appareils de protection respiratoire
            (APR) de type FFP2 en milieu de soins, dans le cadre de la lutte contre la propagation
            du virus SARS-CoV-2 dans le contexte d’émergence du variant Omicron. Le HCSP rappelle
            que : L’efficacité et la performance de protection (filtration) des masques, quels
            qu’ils soient, sont étroitement dépendantes de la constance du port, de l’ajustement
            au visage et de la qualité du port couvrant impérativement le nez, la bouche et le
            menton ; Le masque ne peut à lui seul réduire le risque de transmission ; il constitue
            une mesure parmi l’ensemble des mesures de protection à respecter (vaccination, hygiène
            des mains, ventilation des locaux, etc.).
2022
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HCSP - Haut Conseil de la Santé Publique
France
COVID-19
recommandation de santé publique
virus
Appareil respiratoire
SARS-CoV-2
Appareil respiratoire
lutte
dispositifs de protection
Virus
appareil respiratoire
Virus
dispositif
Appareil respiratoire
jugement
Appareil respiratoire
Virus
Santé
Lutte
virus du SRAS
infirmières administratives
---
N2-AUTOINDEXEE
Avis relatif à l’évolution de la doctrine de test et d’isolement des cas et des personnes
            contact dans le contexte de la décroissance de la diffusion du variant Omicron du
            virus Sars-CoV-2
https://www.hcsp.fr/explore.cgi/avisrapportsdomaine?clefr=1150
Dans le contexte de la décroissance de la diffusion du variant Omicron (sous-variant
            BA.1) du virus SARS-CoV-2, le HCSP actualise l’avis du 31 décembre 2021 relatif à
            la stratégie de tests à visée de dépistage et de diagnostic à mettre en œuvre pour
            les personnes infectées par le SARS-CoV-2 et les personnes contacts. Tenant compte
            des caractéristiques d’Omicron (durées d’incubation, d’excrétion virale, d’infectiosité)
            le HCSP établit les lignes directrices d’une stratégie d’allègement progressive des
            mesures avec des recommandations générales et spécifiques, pour la population générale
            et le milieu scolaire. Dans une approche de gestion des risques et de santé publique,
            les recommandations sont déployées et synthétisées dans 2 matrices décisionnelles
            d’évolution en 3 phases (intermédiaire, d’évolution favorable, de fin de l’épidémie
            liée au sous-variant BA.1).
2022
HCSP - Haut Conseil de la Santé Publique
France
COVID-19
recommandation de santé publique
diffusion
Personna +
Virus
isolement
relations interpersonnelles
personnes
variants SARS-CoV-2
Virus
virus du SRAS
casse-croute
dermatomyosite
Virus
SARS-CoV-2
variants SARS-CoV-2
jugement
virus
---
N2-AUTOINDEXEE
Avis actualisant les critères de sélection à mettre en œuvre pour les donneurs de
            produits sanguins labiles et de tissus dans le contexte de pandémie de Covid-19 avec
            circulation majoritaire du variant Omicron de SARS-CoV-2
https://www.hcsp.fr/explore.cgi/avisrapportsdomaine?clefr=1151
Cet avis fait suite à la saisine du Haut Conseil de la santé publique (HCSP) par la
            Direction générale de la santé demandant d’actualiser ses recommandations précédentes
            sur les mesures de prévention à mettre en œuvre pour les dons de sang et de tissus,
            au regard de l’évolution actuelle de l’épidémie de Covid-19. L’Etablissement français
            du sang (EFS) a alerté sur la baisse constante fin 2021 et début 2022 des stocks de
            concentrés de globules rouges qui ont atteint un seuil historiquement bas pouvant
            engendrer un possible manque sur un site de délivrance. Selon l’EFS, cette situation
            est due à un double phénomène :     une sous-fréquentation des collectes liée à une
            auto-exclusion des donneurs ou à l’ajournement de 14 jours exigé des candidats au
            don cas contact de Covid-19 ;     une offre de collecte limitée par un absentéisme
            des personnels qui ne bénéficient pas de la dérogation pour le maintien en poste des
            cas positifs pour le Covid-19, asymptomatiques ou pauci-symptomatiques.
2022
HCSP - Haut Conseil de la Santé Publique
France
COVID-19
recommandation de santé publique
pandémies
Critères de sélection
sélection de donneurs
SARS-CoV-2
donneurs de tissus
jugement
sélection de patients
COVID-19
---
N2-AUTOINDEXEE
Analyse des données disponibles sur les réinfections possibles par le SARS-CoV-2 à
            partir de la base de données SIDEP. Point au 17 février 2022.
https://www.santepubliquefrance.fr/maladies-et-traumatismes/maladies-et-infections-respiratoires/infection-a-coronavirus/documents/enquetes-etudes/analyse-des-donnees-disponibles-sur-les-reinfections-possibles-par-le-sars-cov-2-a-partir-de-la-base-de-donnees-sidep.-point-au-17-fevrier-2022
Points clés : 416 995 cas possibles de réinfection identifiés entre le 2 mars 2021
            et le 27 janvier 2022, dont 384 375 (92 %) depuis le 1er décembre 2021; 52 % des cas
            possibles de réinfection étaient âgés de 18 à 40 ans; 79 % des cas possibles de réinfection
            pour lesquels un résultat de criblage était disponible et interprétable pour l’épisode
            de réinfection avaient un résultat évocateur d’Omicron (A0C0)
2022
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SPF - Santé publique France
France
COVID-19
enquête santé
Réinfection
réinfection
disponibilité de
Analyse de données
dû à
SARS-CoV-2
bases de données comme sujet
base
Base de données
---
N2-AUTOINDEXEE
Évaluation des tests antigéniques salivaires pour la détection du SARS-CoV-2
https://has-sante.fr/jcms/p_3318231/fr/evaluation-des-tests-antigeniques-salivaires-pour-la-detection-du-sars-cov-2
Dans son avis du 23 avril 2021, la HAS a conclu à un service attendu insuffisant pour
            les tests antigéniques rapides sur prélèvement salivaire « faute d’efficacité satisfaisante,
            compte tenu d’une sensibilité inférieure aux valeurs seuils minimales fixées par la
            HAS de 80 % et 50 % respectivement chez les patients symptomatiques et les personnes
            asymptomatiques ». Cet avis reposait sur les premières données scientifiques disponibles
            dans la littérature et sur une consultation d'avis d’experts.
2022
HAS - Haute Autorité de Santé
France
COVID-19
évaluation technologique
études d'évaluation comme sujet
antigènes
antigène covas
SARS-CoV-2
Antigènes
enquêteur
---
N2-AUTOINDEXEE
Signalement d’infections à SARS-CoV-2 nosocomiales. Mars 2020 - Février 2022. Point
            au 24 février 2022.
https://www.santepubliquefrance.fr/maladies-et-traumatismes/maladies-et-infections-respiratoires/infection-a-coronavirus/documents/enquetes-etudes/signalement-d-infections-a-sars-cov-2-nosocomiales.-mars-2020-fevrier-2022.-point-au-24-fevrier-2022
Suivi des signalements de Covid-19 nosocomiaux, e-SIN, France, du 1er mars 2020 au
            18 février 2022 : 75 % des signalements reçus correspondaient à des situations de
            cas groupés (CG) (au moins 3 cas liés). 77 % des signalements de CG présentaient un
            caractère nosocomial certain ou probable. 35 % des hypothèses de transmission correspondent
            à l’absence de repérage du cas lors de son admission et29 % à des ruptures dans l’application
            des mesures barrières, depuis le début de la vague 5. 100 % des ES ont mis en place
            un dépistage, lors de l’identification d’un CG, depuis le début de la vague 5.
2022
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SPF - Santé publique France
France
COVID-19
enquête santé
infections
mars
infection croisée
signaux
Infection nosocomiale
SARS-CoV-2
maladie infectieuse nosocomiale
---
N2-AUTOINDEXEE
Déclaration conjointe sur l’importance prioritaire de la surveillance de l’infection
            par le SARS-CoV-2 chez les animaux sauvages et de la prévention de la formation de
            réservoirs animaux
Déclaration
https://www.who.int/fr/news/item/07-03-2022-joint-statement-on-the-prioritization-of-monitoring-sars-cov-2-infection-in-wildlife-and-preventing-the-formation-of-animal-reservoirs
Alors que nous entrons dans la troisième année de la pandémie, le SARS-CoV-2, le virus
            qui cause la COVID-19, se propage entre personnes de façon intense à l’échelle mondiale.
            De nombreux facteurs sont à l’origine de la transmission. L’un d’eux est l’apparition
            de variants préoccupants hautement transmissibles, le dernier en date étant Omicron.
            Le virus continue d’évoluer et le risque d’apparition de variants est élevé. Bien
            que la pandémie de COVID-19 soit provoquée par la transmission interhumaine, on sait
            que le virus SARS-CoV-2 infecte également des espèces animales. D’après les connaissances
            actuelles, la faune sauvage ne joue pas un rôle important dans la propagation du SARS-CoV-2
            chez l’être humain, mais sa propagation dans les populations animales peut affecter
            la santé de celles-ci et faciliter l’apparition de nouveaux variants du virus.
2022
OMS - Organisation Mondiale de la Santé
Suisse
COVID-19
information scientifique et technique
Animaux
maladie infectieuse
Animal
panthera uncia
Animaux
Animal
conjoints
animaux sauvages
Animaux
Animaux
animal
Infection
Animal
enregistrements
Animaux
SARS-CoV-2
---
N2-AUTOINDEXEE
Déclaration provisoire du Groupe consultatif technique de l’OMS sur la composition
            des vaccins contre la COVID-19 (TAG-CO-VAC) relative aux vaccins contre la COVID-19
            dans le contexte de la circulation du variant Omicron du SARS-CoV-2 - 8 mars 2022
https://www.who.int/fr/news/item/08-03-2022-interim-statement-on-covid-19-vaccines-in-the-context-of-the-circulation-of-the-omicron-sars-cov-2-variant-from-the-who-technical-advisory-group-on-covid-19-vaccine-composition-(tag-co-vac)-08-march-2022
L’Organisation mondiale de la Santé, avec l’appui du Groupe consultatif technique
            sur la composition des vaccins contre la COVID-19 (TAG-CO-VAC), continue d’examiner
            et d’évaluer du point de vue de la santé publique l’incidence des nouveaux variants
            préoccupants du SARS-CoV-2 sur les performances des vaccins anti-COVID-19. Depuis
            la publication de la déclaration provisoire sur les vaccins contre la COVID-19 le
            11 janvier 2022, Omicron est devenu le variant préoccupant le plus répandu à l’échelle
            mondiale, remplaçant rapidement d’autres variants en circulation. La présente déclaration
            fait le point de la situation épidémiologique mondiale, indique les problèmes que
            pose la mise à jour de la composition des vaccins et expose la position actuelle du
            TAG-CO-VAC.
2022
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OMS - Organisation Mondiale de la Santé
Suisse
COVID-19
vaccins contre la COVID-19
information scientifique et technique
COVID-19
Techniques
Vaccine
Techniques
variants SARS-CoV-2
Cicatrisation par la technique de pression négative
vaccination; médication préventive
Techniques
Techniques
variants SARS-CoV-2
mars
Vaccins
vaccination
enregistrements
vaccination
Vaccins
vaccin
Organisation Mondiale de la Santé
Groupes de discussion
SARS-CoV-2
vaccine
---
N2-AUTOINDEXEE
Recherche des contacts et placement en quarantaine dans le contexte du variant Omicron
            du SARS-CoV-2
https://apps.who.int/iris/bitstream/handle/10665/352584/WHO-2019-nCoV-Contact-tracing-and-quarantine-Omicron-variant-2022.1-fre.pdf
Ce document fournit des orientations actualisées pour la recherche des contacts et
            la mise en quarantaine des contacts lorsque la circulation du SARS-CoV-2 est élevée,
            en particulier celle du variant préoccupant Omicron qui circule à l’heure actuelle
            à des niveaux élevés et submerge les systèmes de santé du monde entier. - L’OMS continue
            de recommander aux pays d’utiliser une approche pragmatique fondée sur les risques
            lorsqu’ils apportent des modifications aux mesures existantes de recherche des contacts
            et de mise en quarantaine, en tenant compte de la continuité des fonctions essentielles
            dans la société, et des risques et des avantages pour la santé publique associés à
            toute modification. - Toute interruption de la recherche des contacts ou toute réduction
            de la durée de quarantaine augmentera le risque de transmission ultérieure et doit
            être pondérée par les capacités en matière de soins de santé, l’immunité de la population
            et les priorités socioéconomiques. - L’identification et le suivi des contacts doivent
            continuer à concerner en priorité les personnes contacts les plus susceptibles d’être
            infectées, de propager le virus ou de contracter une forme grave de la maladie, et
            les personnels de santé et d’aide à la personne. - Le dépistage du SARS-CoV-2 (par
            PCR ou par test de diagnostic rapide antigénique [TDR-Ag]) peut servir de mesure pour
            réduire la durée de la quarantaine, à sept jours par exemple, si le résultat du test
            est négatif et si la personne contact ne présente aucun symptôme. - S’il n’est pas
            possible d’effectuer un dépistage pour réduire la durée de la quarantaine, la quarantaine
            peut être levée au bout de 10 jours, sans dépistage, si la personne contact ne présente
            aucun symptôme.
2022
OMS - Organisation Mondiale de la Santé
Suisse
COVID-19
recommandation de santé publique
SARS-CoV-2
Recherches
quarantaine
traçage des contacts
Recherche
quarantaine
---
N3-AUTOINDEXEE
Hésitation du personnel soignant contre la vaccination Sars-Cov-2 : exemple du personnel
            soignant de l'hôpital de la Casamance
https://dumas.ccsd.cnrs.fr/dumas-03614835
L’hésitation vaccinale est un phénomène connu, ancien, auxquels se heurtent plus particulièrement
            les médecins généralistes dans leur mission de prévention en soins primaires. L’apparition
            de nouveaux vaccins pour lutter contre la pandémie de COVID 19 et la politique de
            vaccination générale ont fait ressurgir cette hésitation, notamment au sein du personnel
            soignant très sollicité dans la gestion de cette pandémie. Cette étude s’intéresse
            aux motifs de cette hésitation vaccinale, et aux caractéristiques de la population
            qui la compose. Matériel et méthode : une étude transversale, observationnelle, monocentrique
            a été conduite au sein de l’Hôpital Privé de la Casamance. Du 19.07.2021 au 31.08.2021,
            un questionnaire anonyme a été soumis au personnel soignant (médicaux et paramédicaux)
            exerçant au sein de la structure. Une analyse descriptive de la population entière
            a été réalisée puis 2 groupes ont été constitués et comparés en fonction de la présence
            d’une hésitation vaccinale. Résultats : il y a eu 145 personnels soignants répondants,
            dont 67% de femmes, 64% de paramédicaux, 60% de moins de 44 ans, et une expérience
            professionnelle inférieure à 10 ans pour 45% d’entre eux. Cinquante-six pour cent
            des répondants hésitaient à se faire vacciner contre le COVID 19. Les causes d’hésitations
            vaccinales retrouvées ont été : la crainte d’effets indésirables (EI) à moyen/ long
            terme pour 80% des répondants, liée notamment à la vitesse de développement du vaccin
            (65%) et à la nouveauté des vaccins à ARNm (50%), l’efficacité des vaccins sur le
            long terme méconnue (54%), les EI à court terme (43%), la communication des autorités
            (33%), par conviction personnelle (28%). Dans la population des hésitants à la vaccination
            contre le Sars-Cov2, il a été observé une différence significative sur l’âge inférieur
            à 34 ans, le sexe féminin, les professions paramédicales, l’expérience professionnelle
            de moins de 10 ans, un antécédent d’infection à Sars-Cov2 et selon les moyens d’information
            personnelle (littérature scientifique versus réseaux sociaux / médias) (p 0.05). Une
            différence significative a été retrouvée au sein du personnel soignant affecté en
            unité COVID qui hésitait plus à se faire vacciner que dans les autres services (p
            0.05) Conclusion : les facteurs d’hésitation vaccinale du personnel soignant face
            au Sars-Cov2 ont des similitudes avec les facteurs d’hésitation vaccinale à d’autres
            épidémies infectieuses. De nouveaux éléments sont apparus en lien avec les caractéristiques
            de la pandémie actuelle. La vaccination est un outil de prévention majeur et le PS
            est une population clé dans la stratégie de diffusion vaccinale.
2022
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DUMAS - Dépôt Universitaire de Mémoires Après Soutenance
France
COVID-19
vaccins contre la COVID-19
thèse ou mémoire
SARS-CoV-2
vaccination
vaccination
personnel hospitalier
---
N3-AUTOINDEXEE
Etude comparative des pneumonies à Sars-COV-2 et des pneumonies  présumées bactériennes
            chez le sujet âgé de 75 ans et plus, hospitalisé
https://nuxeo.u-bourgogne.fr/nuxeo/site/esupversions/0c813778-adf4-444f-8faa-66457e31ab63
CONTEXTE : Nous avons comparé des sujets âgés atteints de pneumonie à SARS-CoV-2 à
            ceux atteints de pneumonie bactérienne dans l’objectif d’améliorer leur prise en soin.
            METHODES : Il s’agissait d’une étude rétrospective multicentrique comparant un recueil
            hospitalier gériatrique de pneumonies bactériennes (n 216) à des pneumonies à SARS-CoV-2
            (n 124). Les données démographiques, anamnestiques, cliniques et paracliniques étaient
            recueillies à l’admission à l’hôpital. Les complications hospitalières, le pronostic
            fonctionnel et le statut vital à 1 mois, 3 mois et 1 an étaient recueillis prospectivement.
            RESULTATS : L’âge médian de 86 4ans et le sexe ne différaient pas entre les groupes.
            Les patients atteints de pneumonie bactérienne étaient plus dépendants. Les comorbidités
            pulmonaires (46.8% vs 16%), cardiaques (43.5% vs 24.2%) et hypertensive (75.5% vs
            58.9%) (tous p 0.001) étaient plus fréquentes dans la population « pneumonie bactérienne
            », à l’inverse des maladies cérébro- vasculaires et des troubles neurocognitifs indifféremment
            majeur ou mineur (p 0.001). Une confusion était quatre fois plus fréquente chez les
            patients « pneumonie à SARS-CoV-2 » (20.2% vs 5.1%, p 0.001). A l’admission, le score
            pronostic FINE était plus élevé dans le groupe « pneumonie à SARS-CoV-2 » que dans
            celui « pneumonie bactérienne » (p 0.017), témoignant d’une plus grande sévérité initiale
            dans le 1er groupe. La détresse respiratoire était significativement plus représentée
            dans le groupe « pneumonie à SARS-CoV-2 » (25.0% vs 16.2%, p 0.05), à l’inverse de
            la décompensation cardiaque (50.2% vs 17.2%, p 0.001) et de la fibrillation atriale
            (19.0% vs 4.8%, p 0.001). La mortalité intra-hospitalière était supérieure et le risque
            de décès à 30 jours deux fois plus élevé en cas de pneumonie à SarS-CoV-2 (36.3% vs
            17.1%, p 0.001). Cependant, une tendance inverse était observée à 1 an (31.1% vs 40.7%,
            p 0.41).CONCLUSION : Ces deux populations présentent d’importantes différences cliniques,
            biologiques et d’évolution. La population « pneumonie à SARS-CoV-2 » se distingue
            par un niveau d’indépendance préservé et par peu de comorbidités. L’hospitalisation
            est marquée par une surmortalité précoce en lien avec la sévérité du tableau respiratoire.
            A contrario, la population atteinte d’une pneumonie bactérienne se distingue par sa
            plus grande fragilité initiale et par la grande fréquence de décompensation de comorbidités,
            notamment cardiovasculaires, grevant le pronostic à plus long terme.
2022
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SUDOC - Catalogue du Système Universitaire de Documentation
France
COVID-19
thèse ou mémoire
pneumopathie bactérienne
hospitalisation
Étude comparative
collecte de données
sujet âgé
SARS-CoV-2
---
N3-AUTOINDEXEE
Les facteurs cliniques et démographiques associés à la sévérité de l’infection à SARS-CoV-2
https://nuxeo.u-bourgogne.fr/nuxeo/site/esupversions/4abc7962-ae3f-40ca-996c-d5d19ac1eaa8
Introduction : La pandémie à SARS-CoV-2 a impacté fortement les structures d’urgence.
            L’objectif de notre travail était de déterminer les facteurs cliniques et démographiques
            associées à la sévérité de la maladie de la Covid-19. Patients et Méthodes : Il s'agissait
            d'une étude rétrospective monocentrique réalisée au dans le service des Urgences du
            CHU de Dijon d’octobre 2020 à Janvier 2021. Tous les patients ayant une infection
            par le SARS-CoV-2 diagnostiquée par PCR positive ont été inclus. La sévérité de la
            Covid-19 a été définie par la présence d’au moins un critère parmi: le recours à un
            support ventilatoire, l’admission en réanimation et le décès intra-hospitalier. Résultats
            : 331 patients ont été inclus. L’âge moyen était de 73,5  /- 16,8 ans. 56,2% étaient
            de sexe masculin. L’hypertension artérielle (44,7%) et le diabète (33,5%) étaient
            les comorbidités les plus fréquentes. Les signes cliniques étaient dominés par la
            dyspnée (68,6 %), la fièvre (51,6%) et la toux (41,9%). Un qSOFA  2 était présent
            chez 11,5% des patients. 17,2% des patients ont été admis en réanimation et le taux
            de mortalité hospitalière était de 23,3%. Selon notre critère combiné, les facteurs
            cliniques et démographiques associés à la sévérité de la maladie de la COVID-19 étaient
            : l’âge avancé (OR 1,027 (IC 1,01-1,04) 50-60 ans, OR 2,03 (IC 1,34-3,01) 60-70 ans,
            OR 6,04 (IC 4,37-10,68)  70ans), le sexe masculin (OR 2,05 IC 1,29-3,39), l’HTA (OR
            2,55, IC 1,34-3,91), la dyspnée (OR 3,54 IC 1,84-6,79) et le qSOFA 2 (OR 1,87 IC 2,14-3,07).
            Conclusion : L’âge, le sexe masculin, l’HTA, la dyspnée et qSOFA   2 étaient les variables
            associées à la sévérité de la maladie de la Covid-19 dans notre étude.
2022
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SUDOC - Catalogue du Système Universitaire de Documentation
France
COVID-19
thèse ou mémoire
hôpitaux privés à but lucratif
SARS-CoV-2
Facteurs démographiques
démographie
---
N2-AUTOINDEXEE
Analyse des données disponibles sur les réinfections possibles par le SARS-CoV-2 à
            partir de la base de données SIDEP. Point au 31 mars 2022.
https://www.santepubliquefrance.fr/maladies-et-traumatismes/maladies-et-infections-respiratoires/infection-a-coronavirus/documents/enquetes-etudes/analyse-des-donnees-disponibles-sur-les-reinfections-possibles-par-le-sars-cov-2-a-partir-de-la-base-de-donnees-sidep.-point-au-31-mars-2022
Points clés : 685 858 cas possibles de réinfection identifiés entre le 2 mars 2021
            et le 20 mars 2022, dont 95,2 % depuis le 6 décembre 2021 (début de la diffusion du
            variant Omicron en France) ; 50 % des cas possibles de réinfection étaient âgés de
            18 à 40 ans ; 88 % des cas possibles de réinfection pour lesquels un résultat de criblage
            était disponible et interprétable pour l’épisode de réinfection avaient un résultat
            évocateur d’Omicron ; 5,4 % des cas confirmés de COVID-19 étaient des réinfections
            possibles en S11-2022
2022
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SPF - Santé publique France
France
COVID-19
enquête santé
dû à
bases de données comme sujet
SARS-CoV-2
Réinfection
base
Analyse de données
mars
Base de données
réinfection
disponibilité de
---
N2-AUTOINDEXEE
Utilisation des tests de diagnostic rapide antigéniques du SARS-CoV-2 pour l’autodépistage
            de la COVID-19
Orientations provisoires
https://apps.who.int/iris/bitstream/handle/10665/352843/WHO-2019-nCoV-Ag-RDTs-Self-testing-2022.1-fre.pdf
L’autodépistage de la COVID-19, avec les TDR-Ag du SARS-CoV-2 (TDR-Ag), doit être
            proposé en supplément des services de tests offerts par des professionnels (Recommandation
            forte, degré de certitude faible à modéré). Cette recommandation se fonde sur les
            données montrant que les utilisateurs peuvent pratiquer les autotests avec fiabilité
            et exactitude et que l’autodépistage de la COVID-19 est acceptable et faisable et
            pourrait réduire les inégalités existantes dans l’accès aux tests.
2022
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OMS - Organisation Mondiale de la Santé
Suisse
COVID-19
article de périodique
orientation
antigène covas
Antigènes
diagnostic
autotest
orientation
SARS-CoV-2
antigènes
diagnostic préliminaire
COVID-19
---
N2-AUTOINDEXEE
Réservoir animal de SARS-CoV-2 : une menace pour l’Homme ?
https://www.academie-medecine.fr/reservoir-animal-de-sars-cov-2-une-menace-pour-lhomme/
Alors que l’on identifiait de plus en plus d’espèces animales sensibles à l’infection
            par le SARS-CoV-2 dans les conditions naturelles ou expérimentales, le risque de zoonose
            a été suspecté par l’Académie nationale de médecine dès l’origine de la pandémie,
            puis confirmé lorsque les Pays-Bas ont démontré une contamination de l’Homme par des
            visons d’élevage. Par la suite, plusieurs cas de contaminations animales par différents
            variants de SARS-CoV-2 d’origine humaine ont été rapportés, touchant une grande diversité
            d’espèces parmi les animaux de compagnie, d’élevage (mustélidés) ou de la faune sauvage.
            Des animaux de zoo (grands félins, grands singes, hippopotame, loutre) ont été contaminés
            par leurs soigneurs. En Inde, un léopard sauvage en liberté a été contaminé par le
            variant Delta. Bien que les cas de contamination de chiens et de chats par l’Homme
            soient sporadiques, la constitution d’un réservoir de virus chez les chats nomades
            reste possible en raison de leurs contacts avec la faune liminaire d’origine sauvage,
            encore peu étudiée, et de la sensibilité des félidés aux différents variants du SARS-CoV-2.
            Parmi des nouveaux animaux de compagnie, une infection naturelle chez deux lapins
            par le SARS-CoV-2 a été rapportée en France.
2022
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Académie Nationale de Médecine
France
COVID-19
information scientifique et technique
Animal
humains
Homme
Homme
imminent
Animal
Animal
Homme
Animal
Homme
homo sapiens
animal
Animal
Homme
panthera uncia
Homme
Animal
Homme
Animaux
Homme
SARS-CoV-2
Animal
Homme
---
N2-AUTOINDEXEE
Impact de la crise sanitaire due au SARS-CoV-2 sur le statut staturopondéral des enfants
            de quatre ans : comparaison des données des bilans de santé en école maternelle du
            Val-de-Marne, de 2018 à 2021
https://www.santepubliquefrance.fr/determinants-de-sante/nutrition-et-activite-physique/documents/article/impact-de-la-crise-sanitaire-due-au-sars-cov-2-sur-le-statut-staturoponderal-des-enfants-de-quatre-ans-comparaison-des-donnees-des-bilans-de-sant
http://beh.santepubliquefrance.fr/beh/2022/8/2022_8_1.html
Introduction - En France, le service de protection maternelle et infantile est en
            charge au niveau départemental de l'organisation des bilans de santé en école maternelle
            (BSEM) des enfants de 4 ans. L'objectif de ce travail était d'explorer, sur trois
            années scolaires (2018-2019, 2019-2020 et 2020-2021), l'évolution du statut staturo-pondéral
            des enfants et d'estimer l'impact de la crise sanitaire due au SARS-CoV-2 dans le
            Val-de-Marne. Matériel et méthode - À partir des données issues des BSEM, nous avons
            extrait : le poids, la taille, le sexe, l'âge, la zone prioritaire ou non dans laquelle
            était située l'école, la fréquentation d'une cantine ou d'une garderie. Nous avons
            calculé le Zscore de l'indice de masse corporelle (IMCz) selon la méthode LMS. Résultats
            - Parmi les 48 119 enfants analysés, la proportion des enfants en surpoids selon l'IMCz
            était significativement plus important en 2020-2021 par rapport aux années précédentes.
2022
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SPF - Santé publique France
France
COVID-19
article de périodique
Enfant
mère
crise
Enfant
SARS-CoV-2
Enfant
enfant
école maternelle
dû à
Santé maternelle
Bilan
valine
enfant
Enfant
ensemble de données
---
N2-AUTOINDEXEE
Covid-19
SARS-CoV-2
https://www.inrs.fr/publications/bdd/eficatt/fiche.html?refINRS=EFICATT_Covid-19
Virus à ARN linéaire non segmenté et enveloppé de la famille des Coronaviridae, du
            genre Betacoronavirus. De très nombreux coronavirus peuvent infecter les animaux.
            Chez l'homme, six espèces de coronavirus (CoV) étaient connues avant 2020 : les HCoV
            saisonniers, le SRAS-CoV et le MERS-CoV. Le septième : SARS-CoV-2, a émergé dans l’espèce
            humaine au cours du dernier trimestre de 2019 en Chine. Leur enveloppe porte à sa
            surface des protéines de surface S (spike) disposées en forme de couronne, d’où le
            préfixe « corona » (1). La souche historique du SARS-CoV-2 de Wuhan a maintenant quasiment
            disparue, supplantée successivement par différents variants. Les derniers variants
            apparus en France sont le variant Delta, plus contagieux (émergé en Inde), devenu
            majoritaire au niveau du globe, lui-même remplacé depuis fin 2021 par le variant Omicron
            (sous-lignage BA.1), encore plus transmissible (émergé en Afrique australe). Ce dernier
            a démontré un avantage compétitif sur Delta du fait d’une transmissibilité élevée
            mais surtout d’un échappement plus important à la réponse immunitaire. Depuis fin
            février 2022, le sous-lignage BA.2 d'Omicron est devenu à son tour majoritaire (2).
2022
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INRS - Institut National de Recherche et de Sécurité
France
COVID-19
information scientifique et technique
SARS-CoV-2
COVID-19
---
N1-SUPERVISEE
COVID-19 Vaccine (inactivated, adjuvanted) Valneva
https://www.ema.europa.eu/en/medicines/human/EPAR/covid-19-vaccine-inactivated-adjuvanted-valneva
COVID-19 Vaccine (inactivated, adjuvanted) Valneva est un vaccin destiné à protéger
            les personnes âgées de 18 à 50 ans contre la maladie à coronavirus 2019 (COVID-19).
            Il est utilisé pour la primovaccination. Le vaccin contient des particules entières
            de la souche originale du SARS-CoV-2 (le virus à l’origine de la COVID-19), laquelle
            a été inactivée (tuée) et ne peut provoquer la maladie...
2022
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EMA - Agence européenne des médicaments
Pays-Bas
français
anglais
flux de syndication
résumé des caractéristiques du produit
notice médicamenteuse
évaluation médicament
vaccins contre la COVID-19
COVID-19
COVID-19, virus inactivé
vaccination
agrément de médicaments
Europe
efficacité des vaccins
Immunogénicité des vaccins
adulte
vaccins inactivés
vaccins contre la COVID-19
surveillance post-commercialisation des produits de santé
primovaccination
adjuvants immunologiques
injections musculaires
SARS-CoV-2
grossesse
Allaitement naturel
interactions médicamenteuses
évaluation préclinique de médicament
VACCIN COVID-19 VALNEVA
VACCIN COVID-19 VALNEVA (inactivé, avec adjuvant), suspension injectable. Vaccin contre
            la COVID-19 (inactivé, avec adjuvant, adsorbé)
---
N2-AUTOINDEXEE
Actualisation des recommandations de prise en charge prophylactique et curative en
            phase précoce de la maladie à SARS-COV-2
https://splf.fr/wp-content/uploads/2022/07/DGS-Urgent-Actualisation-des-recommandations-de-prise-en-charge-prophylactique-et-curative-en-phase-precoce-de-la-maladie-a-Sars-CoV-2-11-07-22.pdf
La Direction Générale de la Santé propose dans ce DGS-Urgent une actualisation des
            recommandations de prise en charge prophylactique et curative en phase précoce de
            la maladie à Sars-CoV-2. Ce document détaille les traitements actuellement disponibles
            sur le territoire et présentant une activité contre les nouveaux sous-variants du
            virus circulant sur le territoire (BA.4 et BA.5).
2022
SPLF - Société de Pneumologie de Langue Française
France
COVID-19
recommandation pour la pratique clinique
maladie
précoce
SARS-CoV-2
Maladie
directives de santé publique
Maladie
Maladies
Maladies
gestion des soins aux patients
---
N2-AUTOINDEXEE
Publication des premiers résultats sur la prévalence des « affections post-COVID-19»
            ou « COVID long » et les recours aux soins associés après les premières vagues d'épidémie
            de SARS-CoV-2
https://www.santepubliquefrance.fr/presse/2022/publication-des-premiers-resultats-sur-la-prevalence-des-affections-post-covid-19-ou-covid-long-et-les-recours-aux-soins-associes-apres-les
Chez certaines personnes, l'infection par le SARS-CoV-2 est caractérisée par l'existence
            de symptômes de longue durée ou persistant après l'infection initiale, aussi appelée
            « affection post-COVID-19 » ou « COVID long ». Pour estimer la prévalence et le fardeau
            de ce syndrome, Santé publique France a mené une première étude sur un large échantillon
            de la population générale adulte et en publie les premiers résultats dans un Point
            Sur dédié. Les résultats montrent que 30% des personnes ayant eu une infection par
            le SARS-CoV-2 présentaient les critères d’un « COVID long » et que le médecin généraliste
            est le professionnel de santé le plus consulté par ces patients.
2022
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SPF - Santé publique France
France
COVID-19
information patient et grand public
Épidémies
publications
soins
affect
COVID-19
maladie
SARS-CoV-2
affect
ayant comme résultat
prévalence
maladie
Épidémies de maladies
---
N2-AUTOINDEXEE
Mise en évidence virale prolongée lors d’une infection par le SARS-CoV-2 sous immunosuppression
https://smf.swisshealthweb.ch/fr/article/doi/fms.2022.09020
Lorsque des patients atteints du COVID-19 doivent être hospitalisés, il existe un
            consensus clair quant aux  mesures stationnaires d’isolement nécessaires. Il n’est
            cependant pas toujours simple de trancher lorsqu’il est question de la levée de l’isolement.
            En particulier chez les patients immunodéprimés, la décision d’opter ou non pour des
            mesures d’isolement prolongées est particulièrement délicate, car une mise en évidence
            virale prolongée via réaction de polymérisation en chaîne (PCR) à partir d’un frottis
            nasopharyngé est décrite chez ces patients. Les personnes sous traitement par  rituximab,
            qui entraîne une immunosuppression empêchant la formation d’anticorps et donc la formation
            d’anticorps spécifiques contre le COVID-19, représentent un groupe particulier. Cet
            article, qui présente le cas d’un patient sous immunosuppression par rituximab avec
            COVID-19 prolongé et frottis nasopharyngé positif prolongé, aborde les difficultés
            dans la prise de décision quant à la levée de l’isolement et à la participation à
            la vie publique.
2022
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Forum Médical Suisse
Suisse
COVID-19
article de périodique
Infection
maladie virale
immunosuppression thérapeutique
SARS-CoV-2
immunosuppression
long
maladies virales
---
N2-AUTOINDEXEE
Modéliser la propagation et le contrôle du SARS-CoV-2 en France
http://www.theses.fr/2022SORUS092
La pandémie de COVID-19 a eu un impact majeur sur l’organisation des sociétés. Comme
            les épidémies ne sont généralement que partiellement observées et caractérisées par
            des dynamiques non linéaires, leur étude nécessite le développement de modèles mathématique
            et statistiques permettent de prendre en compte cette complexité. L’objectif de cette
            thèse est de développer des modèles pour caractériser la propagation du SARS-CoV-2
            en France ainsi que l’impact de différentes interventions. Dans une première partie,
            nous avons estimé le fardeau du SARS-CoV-2 en France à la fin du premier confinement
            en mai 2020. Dans une deuxième partie, nous avons étudié la dynamique de transmission
            du SARS-CoV-2 entre les groupes d’âge. Nous en avons déduit l’impact de mesures de
            contrôle ciblant différents groupes d’âge, notamment des stratégies fondées sur l’isolement
            des personnes âgées. La troisième partie est constituée de plusieurs analyses ayant
            permis d’évaluer l’impact de mesures de contrôle sur la dynamique de l’épidémie, notamment
            la comparaison de stratégies de priorisation des vaccins, l’utilisation du confinement
            comme solution de dernier recours en cas de reprise épidémique et l’évaluation des
            risques et bénéfices associés à différentes stratégies de distribution des vaccins.
            Les analyses rapportées dans cette thèse illustrent comment la modélisation peut permettre
            d’étudier la propagation de pathogènes dans des populations et potentiellement éclairer
            les mesures de contrôle pouvant être mises en place. Les résultats détaillés dans
            ce manuscrit ont été partagés au cours de la pandémie avec les décideurs et les agences
            de santé publique en France.
2022
theses.fr
France
COVID-19
thèse ou mémoire
France
France
SARS-CoV-2
France
français
France
France
---
N2-AUTOINDEXEE
Avis relatif au dépistage olfactif canin dans la stratégie de dépistage de l’infection
            à SARS-CoV-2
https://www.hcsp.fr/explore.cgi/avisrapportsdomaine?clefr=1250
Le dépistage olfactif canin (DOC) peut-il avoir un intérêt dans le dispositif de surveillance
            biologique de l’infection à SARS-CoV-2, en complément des méthodes diagnostiques actuellement
            préconisées ? Le DOC est fondé sur l’aptitude des chiens à reconnaître des composés
            olfactifs volatiles générés par les cellules au cours de certains états pathologiques
            et notamment lors d’infections par des virus comme le SARS-CoV-2. Le Haut Conseil
            de la santé publique analyse le bien-fondé de ce type de dépistage à la demande de
            la Direction générale de la santé sur. Après quelques rappels sur les méthodes conventionnelles
            de diagnostic de l’infection à SARS-CoV-2, le HCSP a procédé à une analyse approfondie
            de la littérature scientifique internationale sur les conditions de réalisation et
            les preuves de concept de cette méthode originale de dépistage. L’ensemble des études
            disponibles souligne les bonnes sensibilités et spécificités du DOC lorsqu’il est
            employé en conditions expérimentales avec recueil d’échantillons et analyse différée
            des résultats en utilisant des chiens bien entraînés. Les expérimentations sur le
            terrain (hôpital, métro, aéroport, université …) sont beaucoup moins nombreuses et
            n’ont pas donné lieu, pour le moment, à des mises en place pérennes de ce mode de
            dépistage.
2022
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HCSP - Haut Conseil de la Santé Publique
France
COVID-19
Dépistage de masse
recommandation de santé publique
SARS-CoV-2
Infection
odorat
jugement
Dépistage
espèces canines
canine
odorat
maladie infectieuse
---
N3-AUTOINDEXEE
Évaluation des séquelles respiratoires des patients hospitalisés pour une pneumonie
            à SARS-CoV-2 au CHU d'Amiens en 2020
https://dumas.ccsd.cnrs.fr/dumas-03736477
Introduction : depuis la fin de l’année 2019, le virus SARS-CoV-2 est responsable
            d’une pandémie mondiale. Ce virus, comme d’autres coronavirus (SRAS, MERS-CoV par
            exemple), est responsable de pneumonies hypoxémiantes. Peu d’études sont disponibles
            sur les séquelles respiratoires suite à l’infection à SARS-CoV-2. Matériels et méthodes
            : notre objectif principal était de déterminer la fréquence de l’altération de la
            DLCO (DLCO inférieure à 70%) à 3 mois d’une infection à SARS-CoV-2. Nos objectifs
            secondaires étaient 1) d’en déterminer les facteurs prédictifs, et d’analyser l’évolution
            de la DLCO à 6 et 12 mois, 2) d’évaluer les symptômes persistants, et la présence
            ou non d’anomalies au test de marche de 6 minutes, 3) de déterminer le type de lésions
            scannographiques persistantes après 3, 6 et 12 mois post Covid-19 ainsi que leurs
            éventuels facteurs prédictifs. Pour répondre à ces objectifs, nous avons réalisé une
            étude de cohorte prospective monocentrique incluant tous les patients ayant été hospitalisés
            pour une infection à SARSCoV-2 entre février et novembre 2020 au CHU d’Amiens, et
            ayant bénéficié d’une évaluation en hôpital de jour (examen clinique, scanner thoracique,
            EFR-DLCO et test de marche de 6 minutes). Résultats : parmi les 292 patients inclus,
            201 patients ont réalisé une mesure de la diffusion du CO à M3, qui était altérée
            dans 36,3% des cas (n 73). La DLCO moyenne était de 75,1% ( 18,2) et la médiane de
            76% (extrêmes : 22% - 132%) des valeurs théoriques. Les facteurs prédictifs retrouvés
            étaient dans notre analyse multivariée l’antécédent d’hémopathie (p 0,011), l’insuffisance
            rénale chronique (p 0,012), et la prise en charge en réanimation (p 0,001). Il existait
            une corrélation nette entre la DLCO mesurée à 3 mois et celle à 6 mois (p 0,0001).
            La DLCO était altérée pour 14 (38,9%) de nos 36 patients à 12 mois. Les lésions scannographiques
            persistantes étaient principalement le verre dépoli à 3, 6 et 12 mois (respectivement
            49,1%, 78,8%, 61,1%). Au moins deux lésions évocatrices de fibrose avaient été mises
            en évidence pour 14% de nos patients à 3 mois (40/285), 28,2% à 6 mois (24/85) et
            33,3% (18/54) à 12 mois. Les facteurs prédictifs d’une atteinte scannographique persistante
            à long terme étaient essentiellement la présence d’une infection sévère à la phase
            aiguë. Conclusion : notre étude confirme l’importance d’un suivi pneumologique la
            première année qui suit l’hospitalisation des patients atteints de SARS-CoV-2. Concernant
            la possible évolution des lésions initiales en lésions fibrosantes, d’autres études
            sont nécessaires pour en déterminer des facteurs de risque, leur physiopathologie,
            et leurs traitements.
2022
DUMAS - Dépôt Universitaire de Mémoires Après Soutenance
France
thèse ou mémoire
SARS-CoV-2
séquelle
pneumonie
patients hospitalisés
pneumonie
pneumopathie infectieuse
hôpitaux universitaires
études d'évaluation comme sujet
hospitalisation
a comme patient
Pneumonie
---
N3-AUTOINDEXEE
Pneumopathie acquise sous ventilation mécanique chez les patients présentant une infection
            respiratoire à SARS-CoV-2 en réanimation
https://dumas.ccsd.cnrs.fr/dumas-03834819
Contexte :  br La pneumopathie acquise sous ventilation mécanique (PAVM) est la principale
            cause d’infection nosocomiale en réanimation. De nombreux patient atteints de la COVID-19
            nécessitent une ventilation mécanique invasive et sont exposés au risque de PAVM.
            L’objectif principal de cette étude était d’estimer l’incidence de la PAVM chez les
            patients ayant présenté une pneumopathie à SARSCoV- 2, puis secondairement, de les
            caractériser et d’en identifier les facteurs de risque.  br Matériel et méthodes :
            br Nous avons mené une étude observationnelle, rétrospective, monocentrique incluant
            tous les patients adultes ayant présenté une pneumopathie virale à SARS-CoV-2 ayant
            conduit à une intubation orotrachéale et à une ventilation mécanique invasive pour
            une durée minimale de 48hau sein du service de réanimation polyvalente du CH de Dieppe.
            Le critère de jugement principal était l’incidence d’une PAVM. Les critères de jugements
            secondaires étaient les facteurs de risque de survenue et de mortalité d’une PAVM,
            l’épidémiologie microbienne, la durée de séjour et la mortalité en réanimation.  br
            Résultats :  br Au total, 62 patients parmi les 84 patients inclus dans l’étude ont
            présenté au moins un épisode de PAVM. La densité d’incidence de la PAVM était de 60,49
            cas pour 1000 jours de ventilation avec une médiane d’apparition de 6 jours. Les facteurs
            de risque indépendants de survenue d’une PAVM était un rapport PaO2/FiO2   100 mmHg
            et le décubitus ventral. L’âge supérieur à 70 ans était le seulfacteur de risque retrouvé
            de mortalité des PAVM. Les principaux agents pathogènes étaient Pseudomonas aeruginosa
            (19%), Staphylococcus aureus (17%), et Klebsiella spp (14%). Les entérobactéries représentaient
            42% des agents pathogènes incriminés. La durée de séjour en réanimation était prolongée
            en cas de PAVM. La mortalité globale était de 39% et il n’y avait pas de différence
            entre les groupes de patients, avec et sans PAVM.  br Conclusion :  br Les patients
            infectés par le SARS-CoV-2 ont une plus grande susceptibilité de développer une PAVM.
            Nous avons retrouvé une association entre la survenue d’une PAVM et la sévérité de
            l’atteinte respiratoire initiale ainsi qu’un risque accru de mortalité chez les patients
            les plus âgés.
2022
DUMAS - Dépôt Universitaire de Mémoires Après Soutenance
France
COVID-19
thèse ou mémoire
Réanimation respiratoire
SARS-CoV-2
mécanique respiratoire
Pneumopathie
Ventilation mécanique
Ventilation
maladie infectieuse
infections de l'appareil respiratoire
Infection respiratoire
ventilation artificielle
maladies pulmonaires
pneumopathie
ventilation mécanique
Réanimation
patients
a comme patient
---
N3-AUTOINDEXEE
Incidence et caractéristiques des infections des voies aériennes inférieures acquises
            sous ventilation mécanique dans la pneumonie à SARS-CoV-2
https://pepite-depot.univ-lille.fr/LIBRE/Th_Medecine/2022/2022ULILM141.pdf
Objectif : Bien que les patients avec une infection à SARS-CoV-2 présentaient plusieurs
            facteurs de risque d’infection des voies aériennes inférieures acquises sous ventilation
            mécanique (IAVM), leur incidence rapportée précocément dans la pandémie semblait basse.
            L’objectif principal de notre étude était de déterminer l’incidence des IAVM chez
            les patients souffrant de pneumonie à SARS-CoV-2, en comparaison à deux groupes constitués
            de patients avec une pneumonie grippale et sans infection virale à l’admission en
            réanimation. Méthode : Etude de cohorte rétrospective multicentrique européenne (36
            services de réanimations). Tous les adultes intubés  48h étaient éligibles s'ils présentaient
            : une pneumonie à SARS-CoV-2, une pneumonie grippale, ou pas d’infection virale à
            l’admission. Les IAVM comprenaient les pneumonies acquises sous ventilation mécanique
            (PAVM) et les trachéo-bronchites acquises sous ventilation mécanique (TAVM), diagnostiquées
            par des critères cliniques, radiologiques et une confirmation microbiologique quantitative.
            L’incidence cumulée à J28 des premiers épisodes d’IAVM a été estimée en considérant
            les événements compétitifs (méthode de Kalbfleish et Prentice), et comparée via des
            modèles de Fine et Gray uni et multivariés. Résultats : 1576 patients ont été inclus
            (586 avec une infection à SARS-CoV-2, 482 avec une pneumonie grippale et 526 dans
            le groupe pas d’infection virale). L’incidence des IAVM était significativement plus
            élevée chez les patients SARS-CoV-2 (287, 50,5%) en comparaison au groupe grippe (146,
            30,3%, sub hazard ratio ajusté (sHR) 1,60 (IC à 95% 1,26 à 2,04)) ou au groupe pas
            d’infection virale (133, 25,3%, sHR ajusté 1,7 (IC 95% 1,2 à 2,39)). Les bacilles
            gram-négatifs étaient responsables en très large majorité (82% à 89,7%) des IAVM,
            principalement Pseudomonas aeruginosa, Enterobacter Spp. et Klebsiella Spp. Le taux
            de BMR était plus bas dans le groupe SARS-CoV-2 en comparaison aux deux autres groupes.
            Conclusion : L’incidence des IAVM est plus élevée chez les patients atteints de COVID-19,
            par rapport aux patients avec une grippe ou sans infection virale. Différents facteurs
            pourraient expliquer en partie ces résultats, tels que la durée prolongée de ventilation
            mécanique ou le taux élevé de syndrome de détresse respiratoire aigüe (SDRA).
2022
SUDOC - Catalogue du Système Universitaire de Documentation
France
COVID-19
thèse ou mémoire
Ventilation
pneumonie
ventilation mécanique
SARS-CoV-2
Ventilation mécanique
Pneumonie
pneumopathie infectieuse sous ventilation assistée
infection des voies respiratoires inférieures
incidence
pneumonie
infections
ventilation artificielle
Infection
---
N2-AUTOINDEXEE
Avis relatif aux traitements appliqués aux boues de stations d'épuration par rapport
            au risque d'infection au virus SARS-CoV-2
https://www.hcsp.fr/explore.cgi/avisrapportsdomaine?clefr=1260
Le HCSP se prononce après une saisine du 26 juillet 2022 de la part de quatre directions
            d’administration centrale sur l’existence d’éléments scientifiques et techniques justifiant
            la poursuite des traitements complémentaires appliqués aux boues de stations d’épuration
            des eaux usées et le maintien des restrictions d’épandage de ces boues en période
            de Covid-19. Ces traitements avaient été mis en place en 2020 face aux inquiétudes
            sur la présence du virus infectieux SARS-CoV-2 dans les eaux usées et dans les boues
            d’épuration. Compte tenu des connaissances disponibles à la date de cet avis, bien
            qu’il n’y ait pas, à ce jour, de méthode formelle d’isolement du SARS-CoV-2 dans les
            milieux environnementaux, les données épidémiologiques, virologiques et techniques,
            ne vont pas dans le sens d’un maintien d’une éventuelle viabilité du SARS-CoV-2 dans
            les matières fécales, les eaux usées urbaines (ou les effluents mixtes urbains et
            industriels) et les boues de stations d’épuration. Le HCSP recommande de reconsidérer
            les traitements complémentaires d’hygiénisation des boues des stations d’épuration
            des eaux usées liés au SARS-CoV-2 et de pas maintenir les mesures restrictives d’épandage
            des boues, actuellement en vigueur. Le développement de méthodes d’analyse virale
            (méthodes d’isolement du virus et de viabilité) dans les milieux complexes doit être
            poursuivi ainsi que les réflexions et les travaux sur l’évolution de la réglementation
            relative aux risques sanitaires et environnementaux liés à l’épandage des boues des
            stations d’épuration.
2022
HCSP - Haut Conseil de la Santé Publique
France
recommandation de santé publique
Applications
virus
risque
rapport albumine/globuline
Virus
eaux d'égout
Applications
attention
pélothérapie
SARS-CoV-2
rapport de recherche
jugement
risque d'infection
Virus
Infection
virus du SRAS
Applications
Virus
---
N3-AUTOINDEXEE
Etude de la prévalence d' une immunisation au SARS-COV-2 au sein du service de médecine
            d' urgence du Centre Hospitalier de Périgueux durant la première vague Covid-19
https://dumas.ccsd.cnrs.fr/dumas-03643111/
Introduction : l’émergence de nouveaux pathogènes tels que le SARS-COV-2 peut amener
            à de nouvelles recommandations en hygiène et à faire évoluer les pratiques quotidiennes,
            afin de limiter l’exposition des personnels soignants au sein d’un service de médecine
            d’urgence. Objectif : évaluer le nombre de personnels, à moyen terme, immunisé contre
            le SARS-COV-2, au travers des facteurs d’expositions tels que la profession et les
            horaires de travail au sein du service de médecine d’urgence du centre hospitalier
            de Périgueux durant la première vague de l’épidémie de Covid-19. Méthode : étude épidémiologique
            rétrospective transversale concernant le personnel soignant du service de médecine
            d’urgence du Centre Hospitalier de Périgueux, il a été recruté selon la profession,
            les horaires de travail, selon un questionnaire avec analyse sérologique au SARS-COV-2
            suite à l’exposition de patients. Résultats : les résultats de cette étude ont permis
            de montrer que l’efficacité des premières mesures d’hygiène au sein du service de
            médecine d’urgence de Périgueux ont permis une protection du personnel soignant au
            sein de son site et une certaine satisfaction de celui-ci face à la mise en place
            et l’application des précautions standard, aboutissant à une faible prévalence, en
            terme d’immunisation suite au contact avec des patients atteints ou suspects SARS-CoV2.
            Conclusion : l’enjeu de cette épidémie a permis de montrer d’une part l’implication
            des mesures d’hygiène au quotidien au sein d’un service de médecine d’urgence, renforcées
            en cas de crise sanitaire avec cette épidémie au SARS-CoV2 et d’autre part la nécessité
            de maintenir une formation active et récurrente en Hygiène. Contrairement à ce que
            l’on aurait pu penser, les premières mesures mises en place dans l’urgence ont permis
            de largement freiner la propagation du virus au sein du personnel soignant de l’hôpital
            de Périgueux.
2022
DUMAS - Dépôt Universitaire de Mémoires Après Soutenance
France
thèse ou mémoire
COVID-19
médecine d'urgence
service hospitalier d'urgences
Études de prévalence
médecins hospitaliers
Médecins
hôpitaux
hôpital
vaccination
Centre
médecine hospitalière
région mammaire
Centres d'urgences
central
COVID-19
études transversales
SARS-CoV-2
premiers secours
immunisation
---
N3-AUTOINDEXEE
Investigation de cas groupés d’infections à SARS-CoV-2 dans la station balnéaire de Quiberon,
            Bretagne, juillet-août 2020
http://beh.santepubliquefrance.fr/beh/2022/26/2022_26_2.html
Introduction – Le 21 juillet 2020, des cas groupés de Covid-19 ont été signalés chez
            de jeunes adultes. La cellule régionale de Bretagne de Santé publique France, en collaboration
            avec l’Agence régionale de santé (ARS), a mené une investigation épidémiologique visant
            à rompre les chaînes de transmission. Méthode – Un cas ou contact primaire a été défini
            comme toute personne présente à Quiberon du 17 juillet au 5 août 2020 ayant réalisé
            un test RT-PCR (reverse transcription-polymerase chain reaction) SARS-CoV-2, ayant
            fréquenté le cas index, ou les bars, ou le camping de résidence du cas index, ou les
            plages la nuit. Les cas ou contacts secondaires, tertiaires ou quaternaires étaient
            les contacts des précédents cas ayant réalisé un test RT-PCR SARS-CoV-2. Les facteurs
            associés au risque d’infection à SARS-CoV-2 ont été recherchés par régression logistique
            multivariée. Résultats – Pour l’analyse, 633 personnes (cas ou contacts) ont été retenues
            sur 716 personnes recensées. Le taux d’attaque d’infection à SARS-CoV-2 des cas primaires
            était de 60,9%, 7,6% chez les cas secondaires et 4,9% chez les cas tertiaires. Les
            symptômes étaient présents dans 54,8% des cas primaires. L’âge (médiane 19,4) était
            retrouvé comme facteur de risque d’infection à SARS-CoV-2 (rangs primaires et secondaires)
            (odds ratio : OR 0,97 ; intervalle de confiance a 95% (IC95%): [0,95-0,99]). La fréquentation
            d’un bar de nuit incriminé présentait un risque 3,07 fois [1,06-9,45] plus élevé de
            développer cette infection. De plus, les personnes de rang 1 avaient 20,3 fois [12,09-34,08]
            plus de risque d’être contaminées que celles de rangs supérieurs. Discussion – Ces
            résultats permettent de conforter l’hypothèse de la survenue des cas de Covid-19 en
            lien avec la fréquentation du bar incriminé chez les jeunes adultes participant à
            des soirées estivales. Face à cette épidémie, les jeunes adultes sont toujours fortement
            touchés en raison du non-respect des gestes barrières, notamment dans les endroits
            clos (bars, discothèques), et des soirées souvent alcoolisées où les distanciations
            sociales sont peu respectées.
2022
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SPF - Santé publique France
France
article de périodique
personnel de recherche
Bretagne
Bretagne
infections
SARS-CoV-2
maladie infectieuse
stations de cure
groupes de population
Infection
casse-croute
---
N2-AUTOINDEXEE
Renforcement de la surveillance génomique du SARS-CoV-2 notamment pour les voyageurs
            en provenance de chine
https://sante.gouv.fr//IMG/pdf/dgs-urgent_no2023-01-_renforcement_surveillance_genomique_-_chine.pdf
La situation épidémiologique s’est rapidement dégradée en Chine après l’abandon de
            la politique « zéro Covid ». Le pays fait actuellement face à une vague de contaminations
            associée à de fortes tensions sur le système de santé. Les autorités sanitaires chinoises
            n’ont à ce stade pas signalé l’apparition d’un variant émergent préoccupant. Il apparaît
            toutefois nécessaire de prendre d’ores et déjà des dispositions pour renforcer la
            surveillance génomique du SARS-CoV-2 sur le territoire national.
2022
DGS-Urgent
France
recommandation de santé publique
organisation et administration
Chine
renforcement psychologique
génome
génomique
SARS-CoV-2
renforcement
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N3-AUTOINDEXEE
Infection à SARS COV 2 en EHPAD et mortalité: impact des troubles neurocognitifs
https://pepite-depot.univ-lille.fr/RESTREINT/Th_Medecine/2022/2022ULILM246.pdf
Introduction : En France, au cours de la première vague de la pandémie à SARS COV
            2, de mars à mai 2020, les établissements pour personnes âgées dépendantes (EHPAD)
            ont été durement touchés avec un taux de mortalité élevé parmi les résidents. Nombreux
            facteurs de risque de mortalité ont été évoqués parmi lesquels l’âge, le sexe masculin,
            le surpoids ou encore les pathologies cardio-vasculaires. En revanche les données
            de la littérature sont pauvres et contradictoires concernant l’impact des troubles
            neuro-cognitifs (TNC) pourtant présents chez plus de 70% des résidents d’EHPAD. Méthodologie
            : L’objectif principal de l’étude est d’établir si les TNC ont été un facteur de risque
            de décès de l’infection à SARS COV 2 chez les résidents d’EHPAD. L’objectif secondaire
            est d’établir et analyser la part des autres facteurs de risque de décès dans cette
            population. Il s’agit d’une observationnelle rétrospective, multicentrique réalisée
            à partir du registre de l’équipe mobile de prélèvements (EMP) COVID du CHU de Lille
            auprès des différents EHPAD de la région Nord Pas de Calais. Parmi les 34 EHPAD du
            Nord- Pas-de-Calais ayant reçu l’intervention de l’EMP en 2020, 115 résidents testés
            positifs pour une infection à SARS COV 2 ont été inclus. Les données ont été recueillies
            par hétéro évaluation selon un questionnaire standardisé et anonymisé. Une analyse
            uni variée a été menée afin d’identifier les facteurs de risque de décès. Une courbe
            de survie a été élaborée. Résultats : Le délai médian de survie était de 55 jours
            (IQR 21 à 164,5 jours) et les résidents décédés étaient significativement plus âgés
            que les survivants en médiane (92 ans vs. 88,0 ans ; p   0,016). Parmi les résidents
            décédés, 89.3 % présentaient des TNC (76% d’entre eux étaient à un stade modéré à
            sévère). Cependant les TNC n’apparaissaient pas comme un facteur de risque de décès
            (p   0,42). Selon nos résultats, les résidents des unités UVA et PASA avaient toutefois
            plus de risque de décéder que les résidents des unités conventionnelles (p   0,006).
            Le poids des comorbidités était majeur avec un score de Charlson moyen significativement
            plus élevé dans le groupe des résidents décédés (8,8 vs 7,1 ; p   0,0001). Conclusion
            : Le taux de décès important lié au SARS COV 2, lors de la première vague de la pandémie
            parmi les résidents d’EHPAD en France, a pointé l’importance du dépistage et des mesures
            barrières afin d’endiguer l’épidémie. Notre étude a montré que les TNC n’étaient pas
            significativement associés à une surmortalité parmi les résidents d’EHPAD infectés
            à SARS COV 2.
2022
SUDOC - Catalogue du Système Universitaire de Documentation
France
thèse ou mémoire
SARS-CoV-2
Infection
établissements de soins de long séjour
maladie infectieuse
Troubles neurocognitifs
---
N2-AUTOINDEXEE
Recours à l’oxygénothérapie à domicile pour une infection à SARS-CoV-2 en 2021 en
            France
https://assurance-maladie.ameli.fr/etudes-et-donnees/2022-oxygenotherapie-domicile-covid-19-2021
Cette étude pharmaco-épidémiologique décrit le recours à l’oxygénothérapie à domicile
            pour une infection à SARS-CoV-2 n’ayant pas donné lieu à une hospitalisation au préalable
            pour Covid-19, en 2021 en France.
2022
AMELI - Assurance Maladie En Ligne
France
rapport
Domicile
maladie infectieuse
oxygénothérapie
France
France
France
France
SARS-CoV-2
France
caractéristiques de l'habitat
français
oxygénothérapie
Infection
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N3-AUTOINDEXEE
Différencier les cas de dengue non sévère de la COVID-19 dans un contexte de co-épidémie
            : Etude de cohorte dans un centre de dépistage du SARS-CoV-2 sur l’île de La Réunion
https://dumas.ccsd.cnrs.fr/dumas-03951269
Introduction : Alors que l’épidémie de coronavirus 2019 (SARS-CoV-2) se propage, de
            nombreux pays font face à une épidémie de dengue. Les deux maladies étant décrites
            avec des similitudes cliniques, il serait utile de pouvoir les distinguer. Pour cela,
            nous avons réalisé une étude de cohorte rétrospective pour identifier les marqueurs
            prédictifs de chaque infection. Méthode : Les sujets suspectés d’avoir la COVID-19
            entre le 23 mars et le 10 mai 2020 ont été testé au CHU de St Pierre. Le SARS-CoV-2
            était testé par PCR et la dengue par un TROD. Les facteurs indépendamment associés
            à la COVID-19 ou la dengue ont été recherchés via des modèles de régression logistique
            multinomiale, en prenant les Autres Maladies Fébriles (AMF) comme contrôle. Résultats
            : Nous avons diagnostiqué 80 COVID-19, 61 cas de dengue non sévère, 872 AMF. Nous
            avons identifié plusieurs facteurs indépendants prédictifs d’une infection à SARS-CoV-2
            : présentation retardée à partir du début des symptômes, contact avec un cas COVID-19
            positif et l’anosmie ; alors que pour la dengue les facteurs retrouvés étaient : courbatures,
            céphalées et douleurs rétro-orbitaires. Conclusion : Bien qu’ayant certaines limites,
            notre étude montre que la dengue non sévère semble plus symptomatique que la COVID-19.
            Dans la présentation clinique, neufs indicateurs cliniques et épidémiologiques peuvent
            aider à distinguer la COVID-19, de la dengue et d’autres maladies fébriles.
2022
DUMAS - Dépôt Universitaire de Mémoires Après Soutenance
France
thèse ou mémoire
Épidémies
casse-croute
Dépistage de masse
central
dengue sévère
Épidémies de maladies
COVID-19
SARS-CoV-2
Dengue
études de cohortes
Dépistage
dengue
Réunion
sévère
COVID-19
Dengues
Centre
---
N1-SUPERVISEE
Bamlanivimab - Risque potentiel d'échec du traitement en raison de la circulation
            de variants résistants du SRAS-CoV-2
https://canadiensensante.gc.ca/recall-alert-rappel-avis/hc-sc/2021/75503a-fra.php
 La surveillance à l’échelle mondiale a permis de déterminer qu’il existe un risque
            potentiel d’échec du traitement par le bamlanivimab contre certains variants du coronavirus
            du syndrome respiratoire aigu sévère 2 (SRAS-CoV-2). Le bamlanivimab devrait conserver
            une activité neutralisante contre le variant B.1.1.7 d’origine britannique. Recommandations
            à l’intention des professionnels de la santé :      Les essais in vitro portant sur
            le bamlanivimab ont montré une activité réduite contre les variants du SRAS-CoV-2
            présentant les substitutions E484K (p. ex., d’origine sud-africaine ou brésilienne)
            et L452R (p. ex., d’origine californienne).     L’épidémiologie locale des variants
            devrait être prise en considération avant l’utilisation empirique du bamlanivimab
            comme traitement unique par anticorps monoclonaux. Le bamlanivimab ne devrait être
            utilisé que dans les régions où la faible prévalence des lignées de variants du SRAS-CoV-2
            présentant les substitutions E484K et/ou L452R est connue ou confirmée.     Les patients
            traités par le bamlanivimab devraient faire l’objet d’une surveillance pour détecter
            les signes et symptômes de la COVID-19 et recevoir une confirmation supplémentaire
            ou un traitement au besoin...
2021
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Canadiens en santé
Canada
français
avis de pharmacovigilance
anticorps monoclonaux humanisés
antiviraux
risque
échec thérapeutique
nouveau variant du coronavirus
résistance virale aux médicaments
adulte
adolescent
bamlanivimab
SARS-CoV-2
COVID-19
---
N2-AUTOINDEXEE
Recommandations concernant l’administration d’une ou deux doses de vaccins à ARNm
            chez des personnes étant ou ayant été infectées au SARS-CoV-2
https://www.health.belgium.be/fr/avis-9634-1-ou-2-doses-si-infectes-par-sars-cov-2
Dans cet avis scientifique, qui propose des lignes directrices aux responsables des
            politiques en matière de santé publique, le Conseil Supérieur de la Santé de Belgique
            formule des recommandations concernant l'administration d'une ou deux doses de vaccins
            à ARNm chez des personnes étant ou ayant été infectées au SARS-CoV-2.
2021
SPF - Service Public Fédéral - Santé publique, Sécurité de la Chaîne alimentaire et
            Environnement
Belgique
pneumopathie virale
infections à coronavirus
COVID-19
vaccins à ARNm
recommandation de santé publique
vaccins
directives de santé publique
Personna +
SARS-CoV-2
Administration
vaccin
personnes
organisation et administration
infections
vaccine
arn messager
Administration
Vaccine
ARN messager
maladie infectieuse
vaccination; médication préventive
Vaccins
vaccination
vaccination
Betacoronavirus
pandémies
vaccins antiviraux
COVID-19
vaccins contre la COVID-19
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N3-AUTOINDEXEE
SARS-CoV-2 et co--infections respiratoires virales
https://dumas.ccsd.cnrs.fr/dumas-03522829
Depuis son apparition à Wuhan en Chine en décembre 2019, le nouveau coronavirus humain
            nommé SARS-CoV-2 a été responsable d’une pandémie mondiale avec plus de 200 millions
            de cas et de 4,6 millions de décès. A l’IHU Méditerranée Infection à Marseille, nous
            avons commencé le dépistage de l’infection par RT-PCR à la fin du mois de janvier
            2020 et nous avons inscrit ce dépistage dans une approche syndromique respiratoire
            plus globale avec des PCR multiplex afin de permettre à la fois le diagnostic du SARS-CoV-2
            et des autres virus respiratoires. Ainsi, entre le 1er mars et le 30 avril 2020 nous
            avons testé par RT-PCR 4222 patients pour l’infection par le SARS-CoV-2 et les autres
            virus respiratoires. Un total de 643 patients a été positif uniquement pour le SARS-CoV-2
            (15,2%), 1068 patients ont été positifs pour un virus autre que le SARS-CoV-2 (25,3%)
            et 27 patients ont été co-infectés SARS-CoV-2 / autre(s) virus respiratoire(s) (4,2%).
            Nous avons retrouvé parmi les co-infections surtout des rhinovirus, des coronavirus
            humains saisonniers et des virus grippaux. Les 27 patients comprenaient 13 hommes
            pour 14 femmes avec une moyenne d’âge (  écart-type) de 59,6   23,8 ans. Les charges
            virales au diagnostic pour les patients co-infectés étaient plus élevées pour le SARS-CoV-2
            et sur la durée de l’étude un patient a été admis en réanimation et un autre est décédé.
            Le taux de co-infection était plus élevé chez les patients SARS-CoV-2 négatifs (45%)
            avec une majorité de rhinovirus. Dans la littérature, de nombreuses études rapportent
            des séries de patients co-infectés par le SARS-CoV-2 et un ou plusieurs autres virus
            respiratoires mais ces taux sont considérablement variables, allant de 0,3% à plus
            de 30%. Le taux de ces co-infections, s’avère lié à la coïncidence de ces différents
            virus respiratoires. Même si les mécanismes associés à ces co-infections virales respiratoires
            sont assez mal connus et caractérisés il parait important de les inclure dans une
            démarche diagnostique syndromique afin d’adapter au mieux la prise en charge des patients.
2021
DUMAS - Dépôt Universitaire de Mémoires Après Soutenance
France
COVID-19
thèse ou mémoire
virus
SARS-CoV-2
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N3-AUTOINDEXEE
Effet du décubitus ventral en ventilation spontanée sur l'oxygénation dans l'insuffisance
            respiratoire aiguë liée au SARS-CoV-2
https://dumas.ccsd.cnrs.fr/dumas-03235113
Introduction : le décubitus ventral (DV) vigile est utilisé chez les patients en ventilation
            spontanée pour la gestion de l’insuffisance respiratoire aiguë secondaire au SARS-CoV-2.
            Objectifs : amélioration de l’oxygénation et diminution du travail respiratoire pendant
            le DV. Méthodes : du 1er octobre 2020 au 15 janvier 2021, 18 patients admis pour une
            pneumonie à SARS-Cov-2 avec une hypoxémie définie par un PaO2 : FiO2   300 mmHg sous
            oxygénothérapie à haut débit nasal ont été inclus dans 4 unités de réanimations à
            Marseille (France). Ils ont été placés selon une séquence randomisée en schéma croisés
            en DV et en décubitus dorsal (DD) pendant deux heures entrecoupées d’une période de
            washout de 2 heures. Nous avons relevé les gazométries artérielles, les données cliniques,
            la dyspnée et l’inconfort. L’effort inspiratoire a été estimé par les courbes de pressions
            œsophagiennes (Pes). Le produit pression-temps simplifié et la pression transpulmonaire
            ont été mesurés. Nous avons aussi enregistré le CO2 expiré et calculé l’espace mort
            physiologique. Résultats : 17 patients ont été analysés. 1 patient est sorti d’étude
            avant le début de l’expérience. Le PaO2 : FiO2 médian était de 93 [IQR : 73-126] mmHg
            à l’inclusion, il était majoré à 208 [IQR : 114-226] mmHg à la fin du DV et avait
            baissé à 91 [IQR : 64-120] mmHg en fin de DD (p 0,0004). 65% des patients (n 11) ont
            été classés comme répondeurs dans le groupe DV. La fréquence respiratoire était significativement
            diminuée en fin de DV en comparaison au DD (respectivement 21 cycles/min [19-22] et
            28 cycles/min [20-33], p  0,0008). Il n’y avait pas de différence significative de
            PaCO2, d’ETCO2 ni d’espace mort physiologique entre la fin du DD et la fin du DV,
            de même que sur la valeur du produit pression-temps simplifié, le delta(Δ) de Pes,
            le delta de pression transpulmonaire dynamique et l’intensité de la dyspnée. Il y
            a eu une augmentation de l’inconfort de 2[IQR : 1.8-4.0] à 3.1[IQR : 2.5-6.2] p  0.0232
            pendant le DV, sans majoration de la douleur. Conclusion : dans les insuffisances
            respiratoires aiguës secondaires au SARS-CoV-2, en comparaison au DD, le DV améliore
            l’oxygénation, réduit la fréquence respiratoire sans modifier le ΔPes, le travail
            respiratoire, la PaCO2 et l’espace mort.
2021
DUMAS - Dépôt Universitaire de Mémoires Après Soutenance
France
COVID-19
thèse ou mémoire
décubitus ventral
oxygène
Insuffisance respiratoire aiguë
insuffisance respiratoire aiguë
oxygène
SARS-CoV-2
position corporelle en décubitus ventral
oxygène
Ventilation
insuffisance respiratoire
ventilation
ventilation
insuffisance respiratoire
OXYGENE MEDICAL
oxygénateurs
Betacoronavirus
---
N2-AUTOINDEXEE
Avis n  2021.0044/AC/SEESP du 17 juin 2021 du collège de la Haute Autorité de santé
            relatif à la vaccination en anneau et la vaccination réactive devant l’émergence de
            variants du SARS-CoV-2
https://www.has-sante.fr/jcms/p_3272617/fr/avis-n-2021-0044/ac/seesp-du-17-juin-2021-du-college-de-la-haute-autorite-de-sante-relatif-a-la-vaccination-en-anneau-et-la-vaccination-reactive-devant-l-emergence-de-variants-du-sars-cov-2
Considérant la menace liée à l’apparition et à la diffusion de certains variants,
            la Direction générale de la santé a saisi la Haute Autorité de santé (HAS) sur l’opportunité,
            les indications et les modalités éventuelles d’une vaccination autour des cas de Covid-19
            pour lesquels la présence d’un variant préoccupant (VOC) ou d’un variant d’intérêt
            (VOI) émergent est détectée. Elle souhaitait notamment que soient précisés le périmètre
            des personnes éventuellement éligibles à ce type d’opération de vaccination lorsqu’il
            s’agit d’un cas sporadique et lorsqu’il s’agit d’un regroupement de cas (cluster),
            les délais dans lesquels ce type de stratégie peut être déployée, les types de vaccins
            à employer, les modalités de réalisation de ceux-ci notamment lorsque deux doses sont
            nécessaires. Enfin, l’opportunité d’étendre cette stratégie à l’ensemble des clusters
            identifiés ou de l’ensemble des cas quelle que soit la souche dès lors que l’incidence
            serait suffisamment faible et dans l’hypothèse d’une disponibilité suffisante des
            doses de vaccins nécessaires devait être évaluée
2021
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HAS - Haute Autorité de Santé
France
COVID-19
nouveau variant du coronavirus
vaccins contre la COVID-19
recommandation de santé publique
jugement
Vaccins
attitude envers la santé
variants SARS-CoV-2
Fracture-luxation
Vaccine
Acanthome
établissements scolaires
Santé
vaccination; médication préventive
vaccination
vaccination
anneau
SARS-CoV-2
vaccin contre la vaccine
santé
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N2-AUTOINDEXEE
Avis n  2021.0042/AC/SEAP du 17 juin 2021 du collège de la HAS relatif aux modifications
            des conditions d’inscription sur la LAP mentionnée à l’article L. 162-1-7 du CSS,
            de la détection des anticorps sériques dirigés contre le coronavirus SARS-CoV-2
https://www.has-sante.fr/jcms/p_3272801/fr/avis-n-2021-0042/ac/seap-du-17-juin-2021-du-college-de-la-has-relatif-aux-modifications-des-conditions-d-inscription-sur-la-lap-mentionnee-a-l-article-l-162-1-7-du-css-de-la-detection-des-anticorps-seriques-diriges-contre-le-coronavirus-sars-cov-2
A l’issue de ses travaux (cahier des charges et rapports d’évaluation) réalisés en
            avril/mai 2020, la Haute Autorité de santé (HAS) a rendu un avis favorable le 20 mai
            2020 relatif au remboursement de la détection des anticorps sériques dirigés contre
            le coronavirus SARS-CoV-2 en listant les indications prises en charge et les non-indications
            pour éviter des dérives dans l’utilisation de ces tests.
2021
HAS - Haute Autorité de Santé
France
COVID-19
évaluation technologique
jugement
virus du SRAS
enregistrements
Coronavirus
établissements scolaires
Fracture-luxation
Abcès du poumon
coronavirus
Agraphie
7-methylbenzo[a]anthracene
système informatisé d'entrée des ordonnances médicales
enquêteur
anticorps covas
anticorps
Acanthome
SARS-CoV-2
coronavirus
systèmes d'entrée des ordonnances médicales
benzo[a]anthracènes
Betacoronavirus
---
N2-AUTOINDEXEE
Stratégie de vaccination contre le Sars-Cov-2 - Rôle des facteurs socio-économiques
            et professionnels dans le risque d’infection et de formes graves de Covid-19 et actualisation
            des recommandations
https://www.has-sante.fr/jcms/p_3275157/fr/strategie-de-vaccination-contre-le-sars-cov-2-role-des-facteurs-socio-economiques-et-professionnels-dans-le-risque-d-infection-et-de-formes-graves-de-covid-19-et-actualisation-des-recommandations
La meilleure connaissance des facteurs de risque associés au SARS-CoV-2 est essentielle
            pour l’adaptation de la stratégie vaccinale ainsi que pour l’information éclairée
            des personnes pour lesquelles un risque accru de formes graves ou d’exposition est
            identifié. Afin d’ajuster la stratégie de vaccination au fur et à mesure de l’acquisition
            des connaissances, la HAS, en s’appuyant sur la Commission technique des vaccinations,
            actualise son avis en réévaluant particulièrement le rôle des facteurs de risque associés
            à la précarité socio-économique et aux expositions professionnelles. Si les contraintes
            d’approvisionnement actuelles en vaccins ne justifient plus de priorisation, il apparaît
            néanmoins que des actions spécifiques doivent être entreprises pour informer les personnes
            particulièrement exposées au risque de Covid-19 et leur proposer la vaccination.
2021
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HAS - Haute Autorité de Santé
France
COVID-19
vaccins contre la COVID-19
recommandation de santé publique
Economie
rôle professionnel
directives de santé publique
facteurs socioéconomiques
risque d'infection
Vaccine
Facteurs économiques
vaccination
facteurs de risque
infections
Economie
Vaccins
vaccination
vaccination; médication préventive
COVID-19
SARS-CoV-2
vaccination
facteur de risque
---
N2-AUTOINDEXEE
Avis 9655 - Vaccination contre le SARS-CoV-2 à partir de 12 ans
https://www.health.belgium.be/fr/avis-9655-vaccination-contre-le-sars-cov-2-partir-de-12-ans
Dans cet avis scientifique, qui propose des lignes directrices aux responsables politiques
            en matière de santé publique, le Conseil Supérieur de la Santé de Belgique émet des
            recommandations en matière de vaccination pédiatrique contre la COVID-19 pour les
            enfants à partir de 12 ans. Cet avis remplace la version déjà publiée le 20 mai 2021,
            qui ne comportait que la partie 1 (pour les 16-17 ans). Cet avis vise à fournir à
            la Taskforce belge « Opérationnalisation de la stratégie de vaccination COVID-19 »
            et aux médecins généralistes des recommandations précises sur la vaccination stratégique
            contre la COVID-19 en Belgique.
2021
SPF - Service Public Fédéral - Santé publique, Sécurité de la Chaîne alimentaire et
            Environnement
Belgique
COVID-19
vaccins contre la COVID-19
recommandation de santé publique
jugement
vaccination
SARS-CoV-2
vaccination; médication préventive
dû à
vaccination
---
N2-AUTOINDEXEE
Inégalités entre hommes et femmes face au risque d’infection par le virus SARS-CoV-2
            durant le confinement du printemps 2020 en France
http://beh.santepubliquefrance.fr/beh/2021/11/2021_11_2.html
Introduction – La distribution sociale de l’infection au SARS-CoV-2 et le rôle du
            genre ont été largement négligés en France, principalement en raison du manque de
            données. L’objectif de cet article est d’analyser le risque d’infection au SARS-CoV-2
            en fonction du sexe, en étudiant l’influence d’autres dimensions sociales dans cette
            relation, en particulier la profession. Méthodes – Nous avons utilisé les données
            du Baromètre Covid-19. Chaque semaine, une vague de sondage était administrée sur
            Internet auprès d’un échantillon de 5 000 personnes représentatif de la population
            française métropolitaine âgée de 18 ans et plus, établi par la méthode des quotas.
            Au total, 25 001 participants ont été interrogés entre le 7 avril et le 11 mai 2020.
            La relation entre le sexe, la profession et l’infection au SARS-CoV-2 a été étudiée
            par des modèles de régression logistique emboités.
2021
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SPF - Santé publique France
France
COVID-19
article de périodique
virus du SRAS
France
Virus
Infection
femmes
Femelle
virus
SARS-CoV-2
France
Risque
France
risque d'infection
Virus
France
hommes
Virus
infections
France
confinement de risques biologiques
Face
français
facteurs socioéconomiques
---
N2-AUTOINDEXEE
Position du Conseil d’orientation de la stratégie vaccinale sur le délai nécessaire
            à l’obtention d’une protection au décours de l’administration de 2 doses de vaccin
            à ARNm anti SARS-CoV-2.
https://sante.gouv.fr//IMG/pdf/avis_du_cosv_15_juillet_2021_-_delai_necessaire_a_l_obtention_d_une_protection_au_decours_de_l_administration_de_2_doses_de_vaccin_a_arnm_anti_sars-cov-2.pdf
Un délai de 14 jours est actuellement appliqué après la dernière dose de vaccin à
            ARN contre la Covid-19 pour que le schéma vaccinal soit réputé complet. Les études
            cliniques indiquent que tant pour le vaccin Pfizer-BioNtech que le vaccin Moderna,
            qu’un très haut niveau de protection clinique est observée dès 7 jours après administration
            de la seconde dose. Cela est illustré dans les courbes des cas cumulés d’infection
            comparées à celles des groupes placebo dans les études de phase 3 ou au groupe contrôle
            dans les études en vie réelle (Polack FP. Et al, New Engl. J. Med., 2020 -phase 3
            Pfizer- ; Dagan N. et al, New Engl. J. Med., 2021, 384, 412,- étude en vie réelle
            Pfizer - ; Baden L.R. et al, New Engl. J. Med., 2021, 384, 403 -phase 3 Moderna) Cette
            observation est valable tant pour la protection contre l’infection que contre le risque
            d’infections graves (hospitalisation, réanimation, décès) et très vraisemblablement
            contre le risque de transmission (cf. étude Dagan N. et al, citée plus haut).
2021
Ministère du Travail, de la Santé, des Solidarités et des Familles
France
COVID-19
vaccins contre la COVID-19
vaccins à ARNm
recommandation de santé publique
vaccination; médication préventive
Vaccine
Administration
vaccins
conseiller en orientation
vaccin
Vaccins
SARS-CoV-2
orientation
vaccination
ARN messager
Vaccine
arn messager
Administration
Vaccination
Assistance
organisation et administration
vaccins synthétiques
vaccin à ARNm
---
N2-AUTOINDEXEE
Actualisation des risques de contamination de la population par le virus SARS-CoV-2
            via les matières textiles, suite à la réouverture des commerces de l’habillement
https://www.hcsp.fr/explore.cgi/avisrapportsdomaine?clefr=1075
Dans le cadre de la réouverture des commerces, notamment de l’habillement, le Haut
            Conseil de la santé publique (HCSP) actualise ses recommandations sur les risques
            de contamination de la population par le virus SARS-CoV-2 via les matières textiles.
            Après avoir pris en compte les dernières recommandations internationales et les données
            récentes de la littérature sur la persistance du SARS-CoV-2 sur les textiles, le HCSP
            recommande [...]
2021
HCSP - Haut Conseil de la Santé Publique
France
COVID-19
recommandation de santé publique
facteurs de risque
Virus
Population à risque
caractéristiques de la population
commerce
virus du SRAS
Virus
Virus
SARS-CoV-2
virus
textiles
virus
Betacoronavirus
---
N1-VALIDE
Étude ComCor : analyse de l’efficacité des vaccins à ARN messager sur les variants
            alpha et bêta du SARS-CoV-2 en France
https://www.santepubliquefrance.fr/presse/2021/etude-comcor-analyse-de-l-efficacite-des-vaccins-a-arn-messager-sur-les-variants-alpha-et-beta-du-sars-cov-2-en-france
Au cours des six derniers mois, l'Organisation Mondiale de la Santé a classé quatre
            variants du SARS-CoV-2 comme « préoccupants » en raison de leur plus forte transmissibilité
            ou de leur possible échappement immunitaire : les variants alpha, bêta, gamma et delta.
            Des chercheurs de l’Institut Pasteur, en collaboration avec la Caisse nationale de
            l’Assurance Maladie, l’institut Ipsos et Santé publique France ont mené, en France,
            une étude cas-témoin au niveau national permettant d’évaluer l'efficacité des vaccins
            à ARNm contre les formes symptomatiques de l'infection par le SARS-CoV-2, qu'il s'agisse
            du virus d'origine ou des variants alpha et bêta.
2021
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SPF - Santé publique France
France
COVID-19
vaccins à ARNm
information scientifique et technique
variants SARS-CoV-2
France
beta
France
vaccin
arn messager
vaccine
UN ALPHA
ARN messager
France
Vaccins
français
efficacité du vaccin
Vaccine
vaccination
variants SARS-CoV-2
France
vaccination
France
collecte de données
vaccination; médication préventive
SARS-CoV-2
vaccins contre la COVID-19
SARS-CoV-2 mRNA vaccine
---
N2-AUTOINDEXEE
Recommandations pour les stratégies de dépistage et les capacités de diagnostic du
            SARS-CoV-2 à l’échelle nationale
Orientations provisoires
https://apps.who.int/iris/bitstream/handle/10665/342903/WHO-2019-nCoV-lab-testing-2021.1-fre.pdf
Le dépistage diagnostique du SARS-CoV-2 est un élément essentiel de la stratégie mondiale
            de prévention et de lutte contre la COVID-19. - Les pays devraient avoir mis en place
            une stratégie de dépistage nationale dotée d’objectifs clairs, qui peuvent être adaptés
            à l’évolution de la situation épidémiologique, aux ressources et aux outils disponibles,
            et au contexte du pays. - Toutes les activités de dépistage du SARS-CoV-2 doivent
            absolument être liées aux mesures de santé publique mises en oeuvre pour garantir
            des soins et un soutien cliniques pertinents, et à une recherche des contacts pour
            rompre les chaînes de transmission.
2021
OMS - Organisation Mondiale de la Santé
Suisse
COVID-19
recommandation de santé publique
diagnostic préliminaire
Diagnostic
dû à
poids et mesures
Dépistage de masse
SARS-CoV-2
orientation
échelle
directives de santé publique
Échelles
aptitude
Dépistage
orientation
diagnostic
Betacoronavirus
---
N2-AUTOINDEXEE
4 % de la population a développé des anticorps contre le SARS-CoV-2 entre mai et novembre
            2020
https://drees.solidarites-sante.gouv.fr/publications/etudes-et-resultats/4-de-la-population-developpe-des-anticorps-contre-le-sars-cov-2
Six mois après un premier volet réalisé en mai 2020, l’enquête nationale Épidémiologie
            et Conditions de vie (EpiCov) révèle que 6,2 % de la population possède des anticorps
            contre le SARS-CoV-2 en novembre 2020, en France métropolitaine, chez les personnes
            de 15 ans ou plus hors Ehpad. Cette séroprévalence est inférieure à la proportion
            de personnes ayant été contaminées par le virus depuis le début de l’épidémie, car
            les anticorps peuvent disparaître avec le temps chez les personnes infectées. Entre
            mai et novembre 2020, on estime que 4,0 % de la population a développé des anticorps
            contre le virus, portant la part de la population contaminée par le virus depuis le
            début de l’épidémie à au moins 8,5 % en novembre 2020.
2021
DREES - Direction de la recherche, des études, de l’évaluation et des statistiques
France
COVID-19
rapport
population
anticorps covas
SARS-CoV-2
anticorps
Betacoronavirus
---
N2-AUTOINDEXEE
Directive sur le recours aux prélèvements salivaires et par gargarisme pour la détection
            du SARS-CoV-2
Directive COVID-19 - 4 août 2021
https://publications.msss.gouv.qc.ca/msss/document-003122/
Afin de favoriser l’adhésion de la population et des employés au dépistage de la COVID-19,
            le ministère de la Santé et des Services sociaux demande aux établissements du réseau
            de la santé et des services sociaux (RSSS) d’évaluer les possibilités de recours,
            ou d’élargissement du recours, aux prélèvements alternatifs salivaires ou par gargarisme
            à l’écouvillonnage nasopharyngé pour la détection du SARS-CoV-2, le tout en respect
            notamment [...]
2021
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MSSS - Ministère de la Santé et des Services sociaux du Québec
Canada
COVID-19
recommandation de santé publique
COVID-19
SARS-CoV-2
enquêteur
leadership
Directives
gargarisme
directives
Betacoronavirus
pneumopathie virale
infections à coronavirus
pandémies
---
N2-AUTOINDEXEE
NOTE appui scientifique et technique de l'Anses relative à la viabilité dans l’air
            et la dose infectante du virus SARS-COV-2
https://www.anses.fr/fr/system/files/AIR2021SA0018.pdf
En janvier 2020, l’Organisation Mondiale de la Santé (OMS) a identifié un nouveau
            virus émergent, suite à la remontée de cas groupés de pneumopathies apparus en décembre
            2019 dans la ville de Wuhan (région du Hubei), en Chine. Il s’agit d’un coronavirus,
            officiellement désigné par l’OMS coronavirus du syndrome respiratoire aigu sévère
            ou SARS-CoV-2, responsable de la maladie COVID-19 (Coronavirus disease).
2021
ANSES
France
COVID-19
rapport
Infection
Virus
virus du SRAS
infections
baies (géographie)
Anses
SARS-CoV-2
maladie infectieuse
Virus
air
Air
amélioration d'image radiographique
aspartate aminotransferases
air
Virus
viabilité foetale
virus
virus
Betacoronavirus
---
N2-AUTOINDEXEE
Avis commun sur la vaccination obligatoire du personnel soignant contre le SARS-CoV-2
https://www.armb.be/fileadmin/sites/armb/uploads/Document-site/pdf/Avis/2021/AVIS_DES_ACADEMIES_SUR_LA_VACCINATION_OBLIGATOIRE.pdf
Dans le cadre de la pandémie de COVID 19 et l’émergence de variants de plus en plus
            contagieux, l’Académie royale de Médecine de Belgique (ARMB) et la Koninklijke Academie
            voor Geneeskunde van België (KAGB) soutiennent les autorités fédérales et fédérées
            belges dans leur politique de poursuite active de la vaccination et de sa promotion
            optimale, elles les soutiennent dans leur mission de se doter des instruments juridiques
            nécessaires et proportionnels pour promouvoir l’intérêt collectif de la protection
            de la santé publique, tout en respectant les droits fondamentaux des citoyens dans
            une société libre et démocratique, elles recommandent, à l’instar de ce qui se fait
            dans d’autres pays européens, une vaccination obligatoire élargie à tous les professionnels
            soignants et non soignants des hôpitaux, des cliniques et des s de soins**, ainsi
            qu’aux médecins, aux autres professionnels de la santé et aux bénévoles***, impliqués
            dans les soins (ambulatoires). Elles recommandent aussi des mesures de protection
            supplémentaires (comme des mesures COVID-safe, la réaffectation professionnelle) pour
            les personnes qui ne peuvent pas être protégées par le vaccin pour des raisons médicales.
2021
Académie Royale de Médecine de Belgique
Belgique
COVID-19
vaccins contre la COVID-19
recommandation de santé publique
Communication
vaccination
personnel de santé
Communication
jugement
vaccination
SARS-CoV-2
personnel de communication
vaccination
Communication personnelle
communication
Commune
vaccination; médication préventive
a comme soignant
Vaccine
Communications
Vaccins
Betacoronavirus
---
N2-AUTOINDEXEE
Évaluation de l’intérêt diagnostique des tests RT-LAMP réalisés sur système intégré
            et prélèvement salivaire pour détecter les sujets infectés par le SARS-CoV-2
https://www.has-sante.fr/jcms/p_3280186/fr/evaluation-de-l-interet-diagnostique-des-tests-rt-lamp-realises-sur-systeme-integre-et-prelevement-salivaire-pour-detecter-les-sujets-infectes-par-le-sars-cov-2
Dans ses précédents avis du 27 novembre 2020 et du 22 janvier 2021, la Haute Autorité
            de santé a donné un avis favorable au remboursement de l’acte de détection du génome
            du virus SARS-CoV-2 par technique RT-LAMP intégrée sur prélèvement salivaire uniquement
            chez les patients symptomatiques pour lesquels le prélèvement nasopharyngé est impossible
            ou difficilement réalisables. Comme tous les avis et recommandations de la HAS pendant
            la crise sanitaire, cet avis était susceptible d’être revu en fonction de l’évolution
            des connaissances ou des alertes scientifiques, en l’occurrence sur les solutions
            technologiques utilisées (RT-LAMP intégrée). Depuis, de nouvelles données de performances
            ont été produites pour différents tests RT-LAMP intégrés sur prélèvement salivaire
            permettant de se positionner de manière plus globale sur l’ensemble de ces techniques
            rapides (sans extraction d’acides nucléiques).
2021
HAS - Haute Autorité de Santé
France
COVID-19
évaluation technologique
Tests diagnostiques
amplification isotherme médiée par une boucle de transcription inverse
SARS-CoV-2
amplification isotherme médiée par des boucles
accomplissement
maladie infectieuse
Infection
enquêteur
personnes
études d'évaluation comme sujet
tests diagnostiques courants
infections
sepsie
intégration de systèmes
infections
techniques d'amplification d'acides nucléiques
techniques de diagnostic moléculaire
Betacoronavirus
---
N2-AUTOINDEXEE
Mesures de prévention des risques liés au virus SARS-CoV-2 dans le domaine de l’assistance
            médicale à la procréation (AMP)
https://www.hcsp.fr/explore.cgi/avisrapportsdomaine?clefr=1077
Le Haut Conseil de la santé publique (HCSP) a été saisi par la Direction générale
            de la santé pour émettre un avis sur les recommandations mises en place par l’Agence
            de la biomédecine (ABM), dans le domaine de l’assistance médicale à la procréation
            (AMP) en période de circulation du virus SARS-CoV-2. En effet, compte tenu des incertitudes
            initiales sur les modes de transmission du SARS-CoV-2, du caractère émergent du Covid-19
            et du manque de données sur son évolution à long terme, les mesures de sécurité ou
            de prévention préconisées initialement par l’ABM pour les personnes souhaitant recourir
            à l’AMP ainsi que pour les dons de gamètes, embryons et tissus germinaux, devaient
            être réévaluées en fonction de l’évolution des connaissances scientifiques mais également
            de la progression de la couverture vaccinale de la population contre ce virus. Le
            HCSP est également sollicité pour émettre un avis, en partenariat avec la Haute Autorité
            de Santé, sur la vaccination des personnes ayant recours à l’AMP.
2021
HCSP - Haut Conseil de la Santé Publique
France
COVID-19
recommandation de santé publique
techniques de reproduction assistée
SARS-CoV-2
Mesures
virus
Appréciation des risques
Virus
assistant médical
Assistance médicale à la procréation
AMP
Virus
virus du SRAS
Virus
Risque
poids et mesures
virus
risque
Betacoronavirus
---
N2-AUTOINDEXEE
Directive sur l'organisation du criblage des variants du SARS-CoV-2
Directive COVID-19 - 13 août 2021
https://publications.msss.gouv.qc.ca/msss/document-003124/
Mise en place d’une structure fonctionnelle afin de soutenir le déploiement et le
            respect de la stratégie québécoise de surveillance des variants du SARS-CoV-2.
2021
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MSSS - Ministère de la Santé et des Services sociaux du Québec
Canada
COVID-19
recommandation de santé publique
variants SARS-CoV-2
organisateurs embryonnaires
organisation
SARS-CoV-2
Organisation
variants SARS-CoV-2
organismes
COVID-19
Organisation
leadership
Directives
directives
pneumopathie virale
infections à coronavirus
pandémies
---
N2-AUTOINDEXEE
Avis du 4 août 2021 - inscription sur la liste des actes et prestations mentionnée
            à l’article L. 162-1-7 du CSS, de la détection des anticorps sériques dirigés contre
            le coronavirus SARS-CoV-2 (indications de prophylaxie post et pré-exposition à la
            COVID-19 – personnes immunodéprimées)
https://www.has-sante.fr/jcms/p_3282209/fr/avis-n-2021-0058/ac/seap-du-4-aout-2021-du-college-de-la-haute-autorite-de-sante-relatif-a-l-inscription-sur-la-liste-des-actes-et-prestations-mentionnee-a-l-article-l-162-1-7-du-css-de-la-detection-des-anticorps-seriques-diriges-contre-le-coronavirus-sars-cov-2-indications-de-prophylaxie-post-et-pre-exposition-a-la-covid-19-personnes-immunodeprimees
La Haute Autorité de santé a rendu une décision d’autorisation d’accès précoce de
            la spécialité RONAPREV (casirivimab/imdevimab) dans le cadre de traitements prophylactiques.
            Le recours à cette spécialité nécessite la réalisation préalable d’un test sérologique
            chez les patients candidats à ces traitements afin d’identifier les patients non répondeurs
            ou faiblement répondeurs à la vaccination. En conséquence, compte tenu de ces éléments,
            la Haute Autorité de santé est favorable à l’inscription de la détection des anticorps
            sériques dirigés contre le virus SARS-CoV-2 sur la liste des actes et prestations
            (service attendu suffisant et amélioration du service attendu de niveau V) dans les
            indications susmentionnées.
2021
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Suffisant
Suffisant
HAS - Haute Autorité de Santé
France
évaluation technologique
COVID-19
Indicateurs
indication de
Prophylaxie pré-exposition
sujet immunodéprimé
prophylaxie après exposition
virus du SRAS
personnes
enregistrements
indicateurs et réactifs
7-méthylbenzo[a]anthracène
anticorps covas
Exposition
jugement
Coronavirus
listes d'attente
Personna +
coronavirus
laisse entrevoir
effets de l'exposition à un agent externe
enquêteur
SARS-CoV-2
anticorps
traitement prophylactique
COVID-19
7-methylbenzo[a]anthracene
personnes
coronavirus
Betacoronavirus
pneumopathie virale
infections à coronavirus
pandémies
benzo[a]anthracènes
---
N2-AUTOINDEXEE
Directives relatives à la conduite d’évaluations de l’efficacité vaccinale dans le
            contexte des nouveaux variants du SARS-CoV-2
Orientations provisoires - 22 juillet 2021
https://apps.who.int/iris/bitstream/handle/10665/345277/WHO-2019-nCoV-vaccine-effectiveness-variants-2021.1-fre.pdf
Introduction; Surveillance des nouveaux variants; Déclencheurs précoces de l'efficacité
            vaccinale réduite contre les nouveaux variants; Approches basées uniquement sur les
            cas pour l'évaluation de l'efficacité vaccinale par rapport aux nouveaux variants;
            Evaluations complètes de l'efficacité vaccinale face aux nouveaux variants; Considérations
            analytiques pour le séquençage génomique lors de l'estimation de l'efficacité vaccinale
            face aux nouveaux variants; Biais dans les études sur l'efficacité vaccinale face
            aux nouveaux variants; Conclusion
2021
OMS - Organisation Mondiale de la Santé
Suisse
recommandation de santé publique
COVID-19
vaccins contre la COVID-19
études d'évaluation comme sujet
orientation
orientation
leadership
variants SARS-CoV-2
variants SARS-CoV-2
Directives
efficacité du vaccin
SARS-CoV-2
directives
---
N2-AUTOINDEXEE
Populations ultra-prioritaires pour l'administration d'anticorps monoclonaux dirigés
            contre le SARS-CoV-2 dans l'indication 'PREP'
https://www.infectiologie.com/fr/actualites/ac-en-prophylaxie-primaire-du-covid_-n.html
La prescription d’une combinaison d’anticorps monoclonaux actifs sur le SARS-CoV-2
            en prophylaxie primaire (préexposition, PREP) est possible en France pour les patients
            non répondeurs à 3 doses de vaccin et à risque de développer une forme grave. Bien
            que les données d’efficacité clinique ne soient publiées que pour la prophylaxie postexposition,
            la balance bénéfice-risque pourrait être favorable pour la PREP dans des populations
            très sélectionnées (O’Brien, NEJM 2021). Ces propositions sont susceptibles d’évoluer
            en fonction des nouvelles données scientifiques.
2021
Infectiologie.com
France
recommandation professionnelle
Betacoronavirus
COVID-19
Administration
indicateurs et réactifs
anticorps monoclonaux
Administration
indication de
Anticorps monoclonaux
Indicateurs
population
organisation et administration
anticorps monoclonaux
Anticorps monoclonaux
SARS-CoV-2
---
N1-SUPERVISEE
Covid-19 : étude sur l’efficacité de la mémoire immunitaire après vaccination ARNm
            pour reconnaître les variants du SARS-CoV2
https://presse.inserm.fr/covid-19-etude-sur-lefficacite-de-la-memoire-immunitaire-apres-vaccination-arnm-pour-reconnaitre-les-variants-du-sars-cov2/43817
Les équipes de l’hôpital Henri-Mondor AP-HP et de l’Université Paris-Est Créteil,
            de l’Inserm, du CNRS, d’Université de Paris, au sein de l’Institut Necker-Enfants
            malades, et de l’Institut Pasteur ont mené des travaux sur la capacité de la mémoire
            immunitaire générée après vaccination ARNm à reconnaître et neutraliser les variants
            du SARS-CoV-2.  Ces travaux, coordonnés par le Pr Mahévas, le Dr Reynaud, le Pr Weill,
            le Dr Chappert, le Dr Rey et le Dr Bruhns, montrent que des personnes vaccinées avec
            un vaccin à ARN messager contre le SARS-CoV-2 développent des défenses contre les
            variants Beta et Delta. Leur système immunitaire produit en effet des cellules à mémoire
            capables de reconnaitre et neutraliser les variants préoccupants. Les résultats de
            cette étude ont fait l’objet d’une publication le 20 septembre 2021 au sein de la
            revue Immunity...
2021
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INSERM - Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale
France
français
article de périodique
vaccins synthétiques
SARS-CoV-2
COVID-19
mémoire immunologique
vaccination
vaccin à ARNm
variants SARS-CoV-2
efficacité du vaccin
---
N1-SUPERVISEE
Covid-19 : identification de cellules immunitaires associées à la survie dans les
            formes sévères de la maladie
https://presse.inserm.fr/covid-19-identification-de-cellules-immunitaires-associees-a-la-survie-dans-les-formes-severes-de-la-maladie/43802
Mieux appréhender les mécanismes précis de la réponse immunitaire face au SARS-CoV-2
            est essentiel afin d’améliorer la prise en charge des patients et de continuer à développer
            de nouveaux vaccins efficaces. Depuis le début de la pandémie, de nombreux travaux
            ont notamment tenté d’expliquer ce qui différencie la réponse immunitaire des personnes
            atteintes de formes graves et qui décèdent de la Covid-19 de celle des autres patients.
            Dans une nouvelle étude, des chercheurs et chercheuses de l’Inserm et de Sorbonne
            Université au Centre d’immunologie et de maladies infectieuses, en collaboration avec
            des médecins chercheurs de l’AP-HP, se sont intéressés à un type de réponse immunitaire
            dite cellulaire. Ils montrent que certaines cellules impliquées dans cette réponse,
            des lymphocytes T CD8 , sont présents en moindre quantité chez des patients décédés
            de la Covid-19. Certains de ces lymphocytes constitueraient des marqueurs prédictifs
            de la survie. Ces travaux sont publiés dans la revue JCI Insight...
2021
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INSERM - Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale
France
français
article de périodique
COVID-19
SARS-CoV-2
survie
système immunitaire
COVID-19
immunité cellulaire
lymphocytes T CD8+
---
N2-AUTOINDEXEE
Avis commun sur la vaccination obligatoire du personnel soignant contre le SARS-CoV-2
https://ordomedic.be/fr/avis/deontologie/devoirs-generaux-du-medecin/verplichte-vaccinatie-van-zorgpersoneel-tegen-sars-cov-2
En sa séance du 18 septembre 2021, le Conseil national a examiné l’avis commun du
            19 juillet 2021 de l’Académie royale de Médecine de Belgique et de la Koninklijke
            Academie voor Geneeskunde van Belgie  sur la vaccination obligatoire du personnel
            soignant contre le SARS-CoV-2. Tout d’abord, le Conseil national se réjouit du fait
            que nombre de médecins se sont fait vacciner sur la base de la « good medical practice
            » et qu’ils considèrent cette démarche comme un devoir moral et déontologique. Cependant,
            une protection complète des médecins et de l’ensemble du personnel soignant par la
            vaccination reste nécessaire pour garantir la sécurité des patients vulnérables, pour
            protéger les collaborateurs et pour assurer la continuité des soins de santé.
2021
Ordre des médecins [belge]
Belgique
recommandation de santé publique
Betacoronavirus
Communications
jugement
SARS-CoV-2
Communication personnelle
Communication
personnel de santé
Commune
vaccination
communication
vaccination; médication préventive
Vaccins
vaccination
a comme soignant
vaccination
personnel de communication
Communication
Vaccine
COVID-19
vaccins contre la COVID-19
---
N2-AUTOINDEXEE
Note relative à la gestion des cas acquis ou de cluster d’infections par le SARS-COV-2
            chez des patients ou des professionnels en établissement de santé
https://www.sf2h.net/wp-content/uploads/2020/02/Note_SF2H_Gestion-Cas-aquis-Cluster-COVID-19-en-ES_V29sept2021.pdf
Dans le contexte de la pandémie de COVID-19, et selon le niveau actuel de circulation
            du SARS-CoV-2, les membres du Conseil scientifique de la SF2H ainsi que des experts
            sollicités proposent une conduite à tenir quant à la gestion d'un cas nosocomial de
            COVID-19 voire d'un cluster en établissements de santé (ES), que l'épisode concerne
            des patients ou des professionnels.
2021
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SF2H - Société Française d'Hygiène Hospitalière
France
recommandation professionnelle
COVID-19
Betacoronavirus
prise en charge personnalisée du patient
SARS-CoV-2
personnel de santé
a comme patient
patients
infections
Infection
établissements de santé
maladie infectieuse
---
N1-SUPERVISEE
SARS-CoV-2 : des réponses immunitaires différentes observées dans la muqueuse nasale
            et dans le sang
https://presse.inserm.fr/sars-cov-2-des-reponses-immunitaires-differentes-observees-dans-la-muqueuse-nasale-et-dans-le-sang/43850
Les manifestations cliniques développées à la suite d’une infection par le SARS-CoV-2
            sont variables chez les individus, et les mécanismes pouvant expliquer cette variabilité
            restent encore méconnus. La muqueuse nasale étant un des premiers points d’entrée
            du virus, des chercheurs de l’Institut Pasteur et de l’Inserm, en collaboration avec
            l’Hôpital Cochin AP-HP, ont étudié en parallèle les réponses immunitaires dans la
            muqueuse nasale et dans le sang de personnes infectées par le SARS-CoV-2. Les scientifiques
            ont montré que chez ces personnes atteintes de Covid-19, les réponses immunitaires
            dans la muqueuse et dans le sang faisaient l’objet d’une régulation différente et
            indépendante. Ils ont également observé une perturbation du microbiote nasal, favorisant
            le développement de bactéries pathogènes opportunistes pouvant être à l’origine d’infections
            bactériennes secondaires. Ces résultats ont fait l’objet d’une publication dans Nature
            Immunology, le 1er septembre 2021...
2021
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INSERM - Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale
France
français
article de périodique
COVID-19
muqueuse nasale
sang
réponse immunitaire
SARS-CoV-2
surinfections
co-infection
---
N2-AUTOINDEXEE
Orientations pour la surveillance des variants du SARS-CoV-2
Orientations provisoires - 9 août 2021
https://apps.who.int/iris/bitstream/handle/10665/345912/WHO-2019-nCoV-surveillance-variants-2021.1-fre.pdf
Le présent document vise à décrire un ensemble minimal d’activités de surveillance
            recommandées au niveau national pour détecter et surveiller la prévalence relative
            des variants du SARS-CoV-2, et à présenter un ensemble d’activités permettant de caractériser
            et d’évaluer le risque posé par ces variants. Un ensemble d’indicateurs est également
            fourni pour standardiser la surveillance et la présentation de rapports publics sur
            la circulation de variants.
2021
OMS - Organisation Mondiale de la Santé
Suisse
COVID-19
recommandation de santé publique
organisation et administration
orientation
orientation
variants SARS-CoV-2
SARS-CoV-2
variants SARS-CoV-2
---
N2-AUTOINDEXEE
Avis abrogeant l’avis complémentaire du 15 avril 2021 sur les critères de sélection
            des donneurs d’organes, tissus et cellules dans le contexte de pandémie de Covid-19,
            en rapport avec l’arrêt de la circulation en France d’un variant du SARS-CoV-2
https://www.hcsp.fr/explore.cgi/avisrapportsdomaine?clefr=1100
Le HCSP prend acte de l’arrêt de la circulation du variant 20C (B.1.616) et recommande
            : la levée des mesures spécifiques en matière de dons d’organes, tissus et cellules
            mises en place dans la zone géographique initialement concernée suite à son émergence
            en Bretagne ; l’abrogation de l’avis du 15 avril 2021, pris en complément de l’avis
            du 9 mars 2021, concernant la conduite à tenir particulière en cas de suspicion d’exposition
            des donneurs d’organes, de tissus ou cellules au variant 20C (B.1.616).
2021
HCSP - Haut Conseil de la Santé Publique
France
COVID-19
recommandation de santé publique
lymphocyte u'
France
sélection de donneurs
jugement
rapport de recherche
SARS-CoV-2
Cellule
donneur d'organe
rapport albumine/globuline
Sélection de tissus et d'organes
donneurs de tissus
Critères de sélection
sélection de patients
pandémies
COVID-19
Organisme
France
français
donneurs d'organes
cellules
France
France
France
---
N3-AUTOINDEXEE
Proposition de loi instaurant la vaccination obligatoire contre le SARS-CoV-2
http://www.senat.fr/rap/l21-028/l21-028.html
Réunie le mercredi 6 octobre 2021 sous la présidence de Mme Catherine Deroche, la
            commission des affaires sociales a examiné le rapport de M. Bernard Jomier sur la
            proposition de loi instaurant la vaccination obligatoire contre le SARS-CoV-2. Sûre
            et efficace, la vaccination contre la covid-19 reste le seul moyen d'atteindre une
            protection collective suffisante pour espérer maîtriser durablement l'épidémie et
            permettre un retour à une vie quotidienne normale. Si l'annonce à la mi-juillet 2021
            de l'extension du passe sanitaire a permis de relancer le rythme des vaccinations,
            le nombre de premières injections ne cesse de diminuer depuis le 31 juillet, si bien
            que la part des personnes entièrement vaccinées, qui s'établit au 5 octobre 2021 à
            un peu plus de 72 % de la population totale1(*), ne progresse désormais plus que très
            lentement.
2021
Le Sénat
France
COVID-19
vaccins contre la COVID-19
rapport
proposita
vaccination; médication préventive
SARS-CoV-2
vaccination
vaccination
Vaccins
Vaccine
Loi
vaccination
---
N2-AUTOINDEXEE
Note du 13 septembre 2021 relative au rappel vaccinal contre le SARS-CoV-2 chez les
            personnels de santé à l’automne 2021
Conseil d’orientation de la stratégie vaccinale COVID-19
https://sante.gouv.fr//IMG/pdf/note_du_cosv_rappel_vaccinal_chez_les_personnels_soignants-x1.pdf
Les personnels de santé de plus de 50 ans ont pu bénéficier d'une vaccination contre
            le SARS-CoV-2 à partir du 3 janvier 2021. La vaccination des professionnels de santé
            tous âges confondus a par la suite été ouverte le 6 février 2021. - Selon les données
            du Ministère de la Santé, 640 000 professionnels et intervenants de santé à risque
            de plus de 50 ans avaient reçu une première dose au 31 janvier 2021. Cette population,
            parmi les premiers vaccinés, présente aujourd’hui un intervalle de 6 mois et demi
            minimum depuis la complétion de leur schéma vaccinal. Ainsi, il semble opportun que
            les professionnels de santé de plus de 50 ans fassent partie des premières populations
            à recevoir un rappel vaccinal contre le SARS-CoV-2.
2021
Ministère du Travail, de la Santé, des Solidarités et des Familles
France
COVID-19
vaccins contre la COVID-19
recommandation de santé publique
Assistance
personnel de santé
SARS-CoV-2
orientation
conseiller en orientation
COVID-19
---
N2-AUTOINDEXEE
Généraliser la détection du SARS-CoV-2 dans les eaux usées : une mesure urgente en
            période de reflux épidémique
https://www.academie-medecine.fr/generaliser-la-detection-du-sars-cov-2-dans-les-eaux-usees-une-mesure-urgente-en-periode-de-reflux-epidemique/
Dans la phase de régression actuelle de l’épidémie de Covid-19, tous les moyens doivent
            être mis en jeu pour surveiller la circulation du virus dans la population et détecter
            précocement d’éventuelles résurgences. Les tests de dépistage (tests antigéniques
            et RT-PCR) permettent d’identifier les personnes infectées, de tracer les sujets contacts
            et de les isoler. Ces tests aident à quantifier l’incidence journalière des infections
            par le SARS-CoV-2 dans chaque département grâce au système d’information de dépistage
            (SI-DEP), mais avec un faible degré d’anticipation sur une possible reprise de l’épidémie.
2021
Académie Nationale de Médecine
France
COVID-19
recommandation de santé publique
poids et mesures
Périodique
enquêteur
eaux usées
Mesures
eaux d'égout
Eaux usées
épidémies
eaux usées
SARS-CoV-2
reflux
---
N2-AUTOINDEXEE
Détection des antigènes pour le diagnostic de l’infection à SARS-CoV-2
Orientations provisoires
https://apps.who.int/iris/bitstream/handle/10665/347019/WHO-2019-nCoV-Antigen-Detection-2021.1-fre.pdf
Les tests diagnostiques pour le dépistage du SARS-CoV-2 sont un élément essentiel
            de la stratégie globale de lutte anti-infectieuse dans le cadre de la COVID-19. Les
            pays doivent mettre en place une stratégie nationale de dépistage avec des objectifs
            clairs qui peuvent être adaptés en fonction de l’évolution de la situation épidémiologique,
            des ressources et des outils disponibles et du contexte local. Il est essentiel que
            tous les dépistages du SARS-CoV-2 soient en lien avec des actions de santé publique
            pour assurer des soins cliniques et un soutien appropriés et entreprendre la recherche
            des contacts afin de briser les chaînes de transmission.
2021
OMS - Organisation Mondiale de la Santé
Suisse
COVID-19
recommandation de santé publique
enquêteur
maladie infectieuse
orientation
Infection
aucun diagnostic
diagnostic
antigènes
infections
antigène covas
SARS-CoV-2
orientation
Antigènes
---
N3-AUTOINDEXEE
Covid-19 : quel impact de l’infection au SARS-CoV-2 sur l’irrigation vasculaire du
            cerveau ?
https://presse.inserm.fr/covid-19-quel-impact-de-linfection-au-sars-cov-2-sur-lirrigation-vasculaire-du-cerveau/44010/
De nombreux chercheurs et chercheuses sont actuellement mobilisés pour accroître les
            connaissances relatives au virus du SARS-CoV2, pour une meilleure prise en charge
            des patients infectés, mais également pour essayer de prévoir les conséquences futures
            d’une infection sur la santé.  Dans le cadre d’une collaboration internationale, des
            chercheurs de l’Inserm, de l’Université, du CHU et de l’Institut Pasteur de Lille,
            au sein du laboratoire « Lille neuroscience & cognition », et des collègues du CNRS,
            identifient pour la première fois un effet direct du SARS-CoV-2 sur les vaisseaux
            sanguins du cerveau. Certaines cellules, les cellules endothéliales vasculaires cérébrales,
            composantes essentielles de la barrière hémato-encéphalique qui protège le cerveau
            sont affectées par un phénomène de mort cellulaire. Ces résultats, qui font l’objet
            d’une publication dans la revue Nature Neuroscience, interrogent notamment sur les
            conséquences à long terme de la maladie.
2021
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INSERM - Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale
France
COVID-19
article de périodique
maladie infectieuse
Infection
SARS-CoV-2
vaisseau sanguin, sai
irrigation
COVID-19
infections
cerveau
---
N2-AUTOINDEXEE
Avis n  2021.0082/AC/SESPEV du 18 novembre 2021 du collège de la Haute Autorité de
            santé relatif à la pertinence d’un rappel chez les sujets avec antécédents d’infection
            par le SARS-CoV-2 vaccinés par une dose de vaccin contre la Covid-19, et chez les
            sujets infectés après une primovaccination complète ou incomplète
https://www.has-sante.fr/jcms/p_3300292/fr/avis-n-2021-0082/ac/sespev-du-18-novembre-2021-du-college-de-la-haute-autorite-de-sante-relatif-a-la-pertinence-d-un-rappel-chez-les-sujets-avec-antecedents-d-infection-par-le-sars-cov-2-vaccines-par-une-dose-de-vaccin-contre-la-covid-19-et-chez-les-sujets-infectes-apres-une-primovaccination-complete-ou-incomplete
La HAS prend acte de la volonté du Ministère de la santé d’intégrer la dose de rappel
            dans le passe sanitaire et n’a pas de remarque à formuler sur le projet de décret
            à ce sujet. La HAS s’est déjà prononcée en faveur d’une dose de rappel dans la population
            des personnes de plus de 65 ans à plusieurs reprises  [1][2] et tient à souligner
            qu’il est primordial de poursuivre les efforts de vaccination des personnes non encore
            vaccinées ainsi que l’administration du rappel aux groupes éligibles. La mise à jour
            de la liste des contre-indications proposée dans le décret est conforme aux précédentes
            recommandations de la HAS.
2021
HAS - Haute Autorité de Santé
France
COVID-19
vaccins contre la COVID-19
recommandation de santé publique
établissements scolaires
Vaccination
attitude envers la santé
maladie infectieuse
jugement
Vaccine
personnes
vaccination
vaccin contre la vaccine
Vaccins
antécédents
SARS-CoV-2
infections
Santé
COVID-19
vaccination; médication préventive
Vaccine
Vaccins
---
N2-AUTOINDEXEE
Point sur le variant du SARS-CoV-2 Omicron (B.1.1.529)
https://www.santepubliquefrance.fr/les-actualites/2021/point-sur-le-variant-du-sars-cov-2-omicron-b.1.1.529
Le 23 novembre 2021, un nouveau variant portant de nombreuses mutations a été identifié
            à partir des données partagées sur la base de données internationales GISAID. Un premier
            nom, B.1.1.529, lui a été attribué le 24 novembre. L’OMS lui a attribué ce jour le
            nom Omicron. Les connaissances sur ce variant sont à ce stade encore incomplètes et
            des travaux sont en cours pour les approfondir.
2021
SPF - Santé publique France
France
COVID-19
information scientifique et technique
variants SARS-CoV-2
variants SARS-CoV-2
SARS-CoV-2
---
N2-AUTOINDEXEE
Être réinfecté par le SARS-CoV-2, vraiment ?
Canal Detox
https://presse.inserm.fr/etre-reinfecte-par-le-sars-cov-2-vraiment/41260/
Plusieurs études le confirment : les réinfections par le nouveau coronavirus à l’origine
            de la pandémie de Covid-19 sont possibles. Toutefois, le phénomène serait rare. Canal
            Détox fait le point sur ce que l’on sait et sur les données encore parcellaires sur
            le sujet.
2021
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INSERM - Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale
France
COVID-19
information scientifique et technique
SARS-CoV-2
Réinfection
---
N3-AUTOINDEXEE
Les facteurs prédictifs d'évolution défavorable des pneumopathies à SARS CoV-2, en
            régulation médicale
https://athena.u-pec.fr/primo-explore/search?query=any,exact,998036264004611&vid=upec
Contexte: Lors de la première vague de l’épidémie à Sars COV-2, les centres de régulation
            des SAMU, à l’instar des services d’urgences et de réanimation du monde entier, ont
            dû modifier leurs habitudes pour faire face à un afflux de patients et d’appels. De
            nombreuses études ont recherché des facteurs prédictifs de mauvaise évolution de la
            COVID 19, certaines, aboutissant à la réalisation de scores pronostiques. Aucun score
            pronostique ne semble applicable en régulation. Objectif: Identifier les facteurs
            prédictifs d’évolution défavorable des patients suspects d’infection pulmonaire à
            Sars-CoV-2, dès leur prise en charge en régulation. Méthode: Réalisation d’une étude
            descriptive monocentrique au CRRA de Seine et Marne. Nous avons étudié les dossiers
            de patients pris en charge par un SMUR suite à un appel au CRRA pour dyspnée par infection
            supposée à Sars CoV-2. Les facteurs pronostiques étudiés étaient : l’âge, les comorbidités,
            l’IMC et le q-SOFA. Le critère de jugement principal était le décès. Résultats: 129
            dossiers de régulation médicale ont été inclus. 61.20% étaient des hommes et l’âge
            moyen était de 65 ans. L’âge   65 ans (Hazard ratio à 1,05 ; IC: [1.02 ; 1,1], p 
            0,001 ), et le score de q-SOFA   2 (Hazard ratio à 1.23; IC : [1.10 ; 3,3] ; p   0,022)
            étaient corrélés à un risque accru de décès. Conclusion: L’âge   65 ans et le q-SOFA
            2 sont des facteurs prédictifs d’évolution défavorable des pneumopathies à Sars COV-2
            prise en charge par un SMUR. Un arbre décisionnel reproductible, incluant l’âge, les
            antécédents cardiopulmonaires, le poids et le q-SOFA devrait permettre de mieux catégoriser
            ces patients et d’avoir une meilleure prise en charge.
2021
SUDOC - Catalogue du Système Universitaire de Documentation
France
COVID-19
thèse ou mémoire
pneumopathie
Pneumopathie
maladies pulmonaires
SARS-CoV-2
facteur
---
N3-AUTOINDEXEE
Quelle stratégie vaccinale contre la Covid-19 a été mise en œuvre par les patients
            fragiles dans les suites d'une forme grave d'infection par le SARS CoV-2 ?: étude
            rétrospective concernant la vaccination réalisée auprès des patients hospitalisés
            lors de la 1ère vague de la Covid-19 au printemps 2020 en unité covid gériatrique
            au centre hospitalier de Haguenau en Alsace
https://publication-theses.unistra.fr/public/theses_exercice/MED/2021/2021_COLIN_Laurene.pdf
Depuis 2020 nous faisons face à une pandémie inédite causée par le virus SARS-CoV-2.
            La région Grand Est a été particulièrement touchée lors de la 1ère vague en France
            en mars 2020 avec une adaptation des systèmes de soins dont la création d’unités covid
            et unités covid-gériatriques. A partir de décembre 2020 a été mise en place une stratégie
            de vaccination ciblant prioritairement les personnes jugées les plus à risques de
            formes graves selon leur âge et leurs comorbidités. Ce travail de thèse s’intéresse
            à la stratégie vaccinale mise en place au sein d’une population particu-lière : les
            patients âgés de plus de 75 ans ayant déjà présenté une forme grave d’infection par
            le SARS-CoV-2. Il s’agit d’un état des lieux des pratiques sous la forme d’une étude
            épidémiologique descriptive ré-trospective se basant sur les patients hospitalisés
            lors de la 1ère vague en unité covid gériatrique au CH de Haguenau, dans la région
            Grand Est. Le recueil de données a été effectué via un questionnaire téléphonique
            auprès de médecins généralistes et patients sur la période de juin à septembre 2021.
            Dans environ 47% des cas c’est le médecin traitant qui a abordé le sujet de la vaccination,
            avec un taux d’acceptation de l’ordre de 77%. Les patients se sont principalement
            fait vacciner en centre de vaccination (39%), puis en EHAPD (29%). La vaccination
            par le médecin traitant lui-même concerne 19% des cas, l’hôpital 8% et la pharmacie
            3%. C’est le vaccin Corminaty développé par le laboratoire Pfizer & BioNTech qui a
            été le plus utilisé, puisqu’il a été reçu par 64% des patients. Suivi par le vaccin
            Spikevax de Moderna (17%) et Vaxzevria d’Astrazeneca (14%). Le schéma majoritaire
            de vaccination comprend 2 injections (56% des cas). Malgré une tendance à la vaccination
            selon un schéma de 2 doses de vaccin à ARNm, il existe une hétérogénéité de prises
            en charge de ces patients. Le principal motif de non-vaccination rapporté est la présence
            d’une sérologie positive, en débit du fait que cette infection ait été source d’une
            hospita-lisation. Et ce malgré le fait que ces patients appartiennent à une population
            considérée comme à risque d’infection grave. Il est important de noter que les connaissances
            scientifiques ont évolué en parallèle de la mise en place de la campagne vaccinale,
            modifiant également les recommandations de pratique et pouvant être source de confusion
            vis-à-vis de la stratégie à adopter
2021
SUDOC - Catalogue du Système Universitaire de Documentation
France
COVID-19
ChAdOx1 nCoV-19
thèse ou mémoire
SARS-CoV-2
accomplissement
sévère
Vaccine
a comme patient
maladie infectieuse
Alsace
patients hospitalisés
études rétrospectives
Vaccins
hospitalisation
COVID-19
vaccination
hôpital
central
infections
vaccination
hôpitaux
Centre
vaccination
vaccination; médication préventive
---
N2-AUTOINDEXEE
Avis relatif à relatif à la prévention des épidémies de virus hivernaux en période
            de circulation du SARS-CoV-2 (mise à jour de l’avis du 17 septembre 2020)
https://www.hcsp.fr/explore.cgi/avisrapportsdomaine?clefr=1132
Le HCSP actualise son avis du 17 septembre 2021 relatif à la prévention des épidémies
            de virus hivernaux dans le contexte de pandémie à SARS-CoV-2. Les experts confirment
            les recommandations figurant dans l’avis de septembre 2020 : respect des gestes barrières,
            vaccination contre la grippe saisonnière des personnes éligibles (en particulier les
            professionnels des établissements de santé et médico-sociaux), et recherche du SARS-CoV-2
            devant tout signe pouvant évoquer le Covid-19. Pour les enfants âgés de moins de 6
            mois, les examens diagnostiques sont fonction de la symptomatologie et sont détaillés
            dans l’avis. Le diagnostic de grippe doit être réalisé conformément aux préconisations
            : collectivités à risque, infection respiratoires nécessitant une hospitalisation…
            Enfin la recherche simultanée de virus grippal et du SARS-CoV-2 par tests moléculaires
            doit être réalisée prioritairement chez les personnes à risque de formes graves et
            en période de co-circulation de ces deux virus.
2021
HCSP - Haut Conseil de la Santé Publique
France
COVID-19
recommandation de santé publique
épidémies
Virus
SARS-CoV-2
virus
Virus
Périodique
jugement
Virus
---
N2-AUTOINDEXEE
Actualisation des recommandations d'éviction des professionnels de santé diagnostiqués
            positifs au Sars-Cov-2 ou contacts à risque
https://www.hcsp.fr/explore.cgi/avisrapportsdomaine?clefr=1133
Le HCSP actualise l’avis du 2 avril 2021 relatif à l’éviction des professionnels positifs
            au SARS-CoV-2 travaillant en établissements de santé ou en établissements médico-sociaux.
            Le HCSP rappelle qu’à la date de son courrier le variant Delta est largement majoritaire
            en France et que des incertitudes demeurent s’agissant du variant Omicron (transmission,
            durée d’excrétion du virus …), que les personnes atteintes de formes asymptomatique
            de Covid-19 jouent un rôle important dans la transmission du virus et que la protection
            apportée par la dose de rappel du vaccin contre le Covid-19 permet une baisse significative
            du nombre de cas de Covid-19 graves.
2021
HCSP - Haut Conseil de la Santé Publique
France
COVID-19
recommandation de santé publique
risque
personnel de santé
diagnostic
SARS-CoV-2
Santé
Counseling directif
---
N2-AUTOINDEXEE
Variant Omicron du SARS-CoV-2 : propositions de contact tracing
https://www.hcsp.fr/explore.cgi/avisrapportsdomaine?clefr=1136
Face à la propagation très rapide du variant Omicron du SARS-CoV2, le Haut Conseil
            de la santé publique (HCSP) a été saisi par la Direction générale de la santé (DGS)
            pour adapter la doctrine Isoler / Détecter / Tracer des personnes infectées par le
            virus du SARS-CoV-2 ou des personnes contacts, en fonction de leurs situations personnelles
            et de leur statut vaccinal (complet, incomplet ou non vacciné). Le HCSP émet des recommandations
            proposant un raccourcissement des durées d’isolement, en discernant les citoyens et
            les professionnels exerçant des métiers essentiels, dont les professionnels de santé,
            et en précisant que les mesures ne peuvent être que transitoires au regard de l’évolution
            de l’épidémie. Les aspects sociétaux et économiques sous-jacents sont aussi pris en
            considération de par leur impact possible sur la mise en œuvre d’actions de santé
            publique.
2021
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HCSP - Haut Conseil de la Santé Publique
France
COVID-19
recommandation de santé publique
équipement et fournitures
SARS-CoV-2
disposition (psychologie)
Dispositifs
dispositif
Face
---
N2-AUTOINDEXEE
Avis relatif à la protection respiratoire contre le variant Omicron du SARS-CoV-2
            31 décembre 2021
https://www.sf2h.net/wp-content/uploads/2021/12/SF2H-Indications-APR-contexte-Omicron-31.12.2021.pdf
La contagiosité du variant Omicron s’avère beaucoup plus importante que les variants
            précédents. Un grand nombre d’infections sont peu ou pas symptomatiques alors que
            les patients sont contagieux. Le variant Omicron a les mêmes mécanismes de transmission
            que les variants précédents. La lutte contre la transmission du virus SARS-CoV-2 repose
            sur l’application conjointe de plusieurs mesures importantes illustrées dans la figure
            1. La protection respiratoire est l’une de ces mesures.
2021
SF2H - Société Française d'Hygiène Hospitalière
France
COVID-19
recommandation professionnelle
SARS-CoV-2
jugement
---
N2-AUTOINDEXEE
Note relative à l’identification de situations à haut risque de transmission aéroportée
            du virus SARS-CoV-2
https://www.sf2h.net/wp-content/uploads/2022/01/2021-12-31-COVID_-transmission_SF2H.pdf
Ce document a pour objectif de mettre à jour les connaissances scientifiques sur le
            risque de transmission aéroportée du SARS-CoV-2. Après quelques rappels sur les conditions
            d’émission de particules respiratoires, sous la forme d’un continuum allant des gouttelettes
            aux microparticules, les conditions à considérer pour évaluer le risque de transmission
            en milieu de soins sont discutées en détaillant les contraintes liées à la ventilation
            et à l’occupation des locaux.
2021
SF2H - Société Française d'Hygiène Hospitalière
France
COVID-19
information scientifique et technique
Virus
aéroports
Virus
Aéroportie
Appréciation des risques
virus du SRAS
Virus
SARS-CoV-2
Transmissions
dé-identification
virus
Risque relatif
---
N3-AUTOINDEXEE
Evaluation de l'impact de la pandémie de Sars-Cov-2 sur les admissions avec alcoolémie
            positive au sein du service d'accueil des urgences du centre hospitalier de Mâcon
https://nuxeo.u-bourgogne.fr/nuxeo/site/esupversions/802cc008-1fb0-414c-857f-2cc9d3b83088
Objectif : Evaluer  l’impact de la pandémie de COVID-19 et  des  mesures sanitaires
            et  sociales  sur  les patients admis avec alcoolisation positive au sein du Service
            d’Accueil des Urgences du Centre Hospitalier de Mâcon.  Méthode : Etude rétrospective
            et comparative réalisée au sein du Service d’Accueil des Urgences du Centre  Hospitalier
            de  Mâcon,  incluant  les  patients  âgés  de  plus  de  18  ans  admis  avec  alcoolémie
            supérieure à 0,1 gramme d’alcool/litre de sang, entre le 1er mars et le 31 décembre
            2019 et 2020.  Résultats :  La  fréquentation  du  service  diminue  globalement 
            (-54%  en  avril  et  -30%  en  mars,  mai, novembre et décembre). Bien que non significative,
            on remarque une tendance à l'augmentation du nombre  de  patients alcoolisés  en mai
            ( 28%) et juin ( 51%), ainsi que  de  leur proportion de mars à juin.  Tout  autant,
            on  observe  également une tendance, non significative, à l’augmentation  des consultations
            en semaine. Il n’y a pas de différence significative d’âge, de sexe, d’alcoolémie,
            du délai avant son dosage, de leur niveau de gravité ni de leur orientation en cas
            d’hospitalisation entre les 2 périodes. La durée moyenne de séjour s’allonge significativement
            passant de 237 à 284 minutes (p 0.001). Les retours à domicile augmentent significativement
            (p 0.001). L’étude de 300 dossiers en 2020 retrouve 71% d’hommes, de 48 ans en moyenne,
            avec une notion de trouble de l’usage d’alcool (47%), de précarité (32%), d’antécédent
            et de traitement psychiatrique (53 et 48%). 67% sont amenés par les sapeurs-pompiers,
            10% sont médicalisés et 15% nécessitent l’intervention des forces de l’ordre. Les
            accidents, les symptômes psychiatriques et non psychiatriques amènent 30% des patients.
            Un bilan complémentaire est souvent réalisé. La moitié bénéficie d’une prise en charge
            médicamenteuse et 16% d’une  contention  physique.  Une  hospitalisation  est  nécessaire
            dans  82%  des  cas  (  47%  en médecine, 38% aux urgences, 2% en soins intensifs).
            Conclusion :  La  pandémie  de  SARS-CoV-2  et  les  mesures  gouvernementales  française
            impactent globalement  peu  le  profil  des  patients admis avec alcoolémie positive
            mais modifient l’activité du Service d’Accueil des Urgences du Centre Hospitalier
            de Mâcon, en particulier pendant les périodes de confinement et de sortie de confinement.
            Les patients relèvent rarement de l’urgence vitale  mais nécessitent des moyens humains
            et matériels important.
2021
SUDOC - Catalogue du Système Universitaire de Documentation
France
COVID-19
thèse ou mémoire
Centre d'accueil d'urgence
central
études d'évaluation comme sujet
région mammaire
hôpital
Alcoolémie
SARS-CoV-2
Centre d'accueil d'urgence
service hospitalier d'urgences
service hospitalier des admissions
Service des admissions
hôpitaux
pandémies
Centre
alcoolémie
Centres d'urgences
---
N2-AUTOINDEXEE
Expérimentation du dépistage réactif du SARS-Cov-2 en écoles primaires. Analyse après
            cinq semaines de mise en oeuvre. Saint-Maurice : Santé publique France, 2021
https://www.santepubliquefrance.fr/maladies-et-traumatismes/maladies-et-infections-respiratoires/infection-a-coronavirus/documents/enquetes-etudes/experimentation-du-depistage-reactif-du-sars-cov-2-en-ecoles-primaires.-analyse-apres-cinq-semaines-de-mise-en-oeuvre.-saint-maurice-sante-publiq
Le dépistage réactif dans les écoles vise à éviter la fermeture systématique des classes
            en présence d'un cas de Covid-19, par l'éviction des seuls cas confirmés identifiés
            lors de deux dépistages successifs (J0 et J7). L'expérimentation présentée ici s'est
            déroulée dans dix départements sur deux périodes. Une première période de deux semaines
            avant les vacances d'automne 2021 et une seconde période de trois semaines après les
            vacances. Le génome du SARS-Cov-2 était recherché par analyse PCR sur échantillon
            de salive.
2021
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SPF - Santé publique France
France
COVID-19
rapport
SARS-CoV-2
Santé publique
Dépistage de masse
Dépistage
France
France
écoles primaires
France
saints
Maurice
France
principal
indicateurs et réactifs
Réactifs
France
établissements scolaires
français
Santé publique
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N3-AUTOINDEXEE
Hypothèses physiopathologiques des atteintes neurologiques du SARS-Cov 2
https://dumas.ccsd.cnrs.fr/dumas-03512894
En décembre 2019 un nouveau coronavirus a émergé à Wuhan (Chine) capable d’infecter
            l’homme. Très contagieux, il s’est étendu aux quatre coins de la planète au point
            que l’OMS a décrété une pandémie mondiale. Nous avons constaté chez les patients,
            hospitalisés initialement pour pneumopathies atypiques, des atteinte multi-organes
            qui nous font penser que ce virus a une physiopathologie particulière dont une partie
            ressemble au SARS-Cov 1 et au MERS-Cov. Il existe également une atteinte neurologique
            dont le mécanisme n’est pas bien compris. Ainsi nous détaillons ces atteintes et nous
            proposons des hypothèses physiopathologiques qui nous permettront d’identifier potentiellement
            des cibles thérapeutiques.
2020
DUMAS - Dépôt Universitaire de Mémoires Après Soutenance
France
COVID-19
thèse ou mémoire
maladie
neurologie
Neurologie
SARS-CoV-2
---
N2-AUTOINDEXEE
Formes neurologiques de l’infection à SARS-CoV-2 : description initiale et évolution
            à 3 mois
https://dumas.ccsd.cnrs.fr/dumas-03655366
Contexte : l’épidémie du SARS-CoV-2 a émergé en décembre 2019 en Chine puis s’est
            répandue à travers le monde. La description initiale est un syndrome grippale associé
            à une pneumopathie, mais des atteintes neurologiques peuvent également apparaitre.
            br Objectifs : l'objectif primaire est de présenter l’analyse des données cliniques,
            paracliniques et notamment électroencéphalographiques de patients hospitalisés à Bichat
            lors de la phase aiguë d’une COVID-19 puis de les comparer avec les mêmes données
            relevées 3 mois après leur hospitalisation. br Matériel et Méthode : l’étude s’appuie
            sur un premier recueil rétrospectif des données cliniques, biologiques, et électroencéphalographique
            obtenues auprès de 15 patients entre le 12 mars 2020 et le 20 avril 2020 lors de leur
            hospitalisation. Un nouveau recueil de ces mêmes données a été spécialement réalisé
            3 mois après le premier recueil de données auprès de ces mêmes patients. br Résultats
            : sur les quinze patients inclus dans l’étude, quatre patients ont été hospitalisés
            en réanimation, et onze dans un service conventionnel. Ils ont tous été atteints par
            la COVID-19, documenté par une PCR nasopharyngée positive. Les symptômes neurologiques
            correspondaient principalement à des confusions, deux patients avaient des symptômes
            de courte durée évoquant une origine comitiale. Sur l’ensemble des patients, lors
            du premier EEG, treize avaient un rythme de fond ralenti, deux patients avaient une
            activité cérébrale inscrite dans la bande alpha. Cinq patients avaient une activité
            plus ample dans les régions antérieures, trois patients avaient des ondes triphasiques,
            trois patients avaient une activité lente intermittente temporo-occipitale gauche,
            une patiente avait des ondes lentes delta généralisées, un patient avait une activité
            lente thêta continue temporo occipitale gauche. Aucune anomalie d’allure épileptique
            n’a été enregistrée. Une analyse du LCS a été effectuée chez six patients, la PCR
            SARS-CoV-2 y était négative. Une patiente avait une méningite associée à une synthèse
            intrathécale. Au total, quatorze patients ont effectué une imagerie cérébrale. Neuf
            avaient eu une IRM cérébrale, un patient avait un AVC ischémique aigu, un patient
            avait un « mild encephalopathie, reversible, splenium lesion » (MERS), huit avaient
            un TDM cérébral révélant chez deux patients des AVC anciens. Quatorze patients ont
            été revus à trois mois. Sur le plan cognitif, cinq patients avaient un score pathologique
            au test de dépistage réalisé par MMS. Sur ces cinq patients, quatre avaient des antécédents
            neurologiques dont des AVC ou des troubles cognitifs, et un seul patient n’avait pas
            d’antécédent notable. Les EEG lors du suivi à 3 mois se sont tous améliorés par rapport
            aux EEG initiaux. Onze patients avaient une activité de fond s’inscrivant dans la
            bande alpha et les 3 autres en bande thêta entre 7 et 8 Hz. Chez l’ensemble des patients,
            les anomalies initiales avaient disparu. br Conclusions : l’évolution à trois mois
            est globalement favorable, avec un retour à l’état de base des signes neurologiques.
2020
DUMAS - Dépôt Universitaire de Mémoires Après Soutenance
France
COVID-19
thèse ou mémoire
SARS-CoV-2
neurologie
Neurologie
Infection
maladie infectieuse
dû à
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