BactérieNotion SNOMED

N2-AUTOINDEXEE
Traitement de la bactérie dans la prévention du cancer de l'estomac
https://www.cochrane.org/fr/CD005583/GUT_traitement-de-la-bacterie-dans-la-prevention-du-cancer-de-lestomac
Problématique de la revue Le dépistage d'Helicobacter pylori chez les personnes en bonne santé et le traitement des personnes infectées par une série d'antibiotiques permettent-ils de réduire le nombre de nouveaux cas de cancer gastrique ? Contexte Helicobacter pylori( H. pylori) est une bactérie vivant dans la paroi de l'estomac de personnes ne sachant généralement pas qu'elles sont porteuses de l'infection. Les personnes infectées par H. pylori sont plus susceptibles de développer un cancer de l'estomac que les personnes non infectées. Pour cette raison, H. pylori est classée comme cancérogène (qui provoque le cancer) pour les humains. Tous les ans, beaucoup de gens meurent de cancer gastrique dans le monde, car au moment où les personnes touchées consultent un médecin, la maladie est souvent avancée. Cependant, l'infection par H. pylori est facile à éradiquer par un traitement antibiotique d'une semaine.
2020
Cochrane
France
revue de la littérature
résumé ou synthèse en français
cancer
cancer de l'estomac
bactérie
Cancer de l'estomac
tumeur maligne, sai
traitement préventif
Cancer de l'estomac
tumeurs de l'estomac
bactéries
Estomac

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N2-AUTOINDEXEE
AVIS et RAPPORT de l'Anses relatif à « Antibiorésistance et environnement - État et causes possibles de la contamination des milieux en France par les antibiotiques, les bactéries résistantes aux antibiotiques et les supports génétiques de la résistance aux antibiotiques
https://www.anses.fr/fr/system/files/EAUX2016SA0252Ra.pdf
L’antibiorésistance (ABR) est une préoccupation majeure de santé publique, partagée par un très grand nombre d’acteurs de la santé humaine et animale au niveau mondial. Ainsi, dans la lettre de saisine adressée à l’Anses, les ministères en charge de la santé, de l’agriculture et de l’environnement indiquent : «Les antibiotiques ont permis, depuis la généralisation de leur utilisation, en médecine humaine comme en médecine animale, de combattre des maladies bactériennes autrefois difficiles voire impossibles à soigner. Cependant, les mésusages des antibiotiques augmentent inévitablement les risques de sélection de bactéries résistantes dont l’impact en santé publique est majeur. »
2020
ANSES
France
rapport
Génétique
Cytisus
génétique
Antibiotiques
rapport de recherche
support
Environnement
France
France
bactérie
Bactéries
France
genetta
rapport albumine/globuline
France
viverridae
Antibiotiques
résistance bactérienne aux médicaments
gène
France
Génétique
baies (géographie)
Genettes
Anses
Génétique
rigidité diffuse
antibiotique
Environnement
français
bactéries
antibactériens
environnement

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N3-AUTOINDEXEE
Dépistage et diagnostic du VIH, des hépatites B et C et des IST bactériennes en CeGIDD en 2018 : données individuelles de la surveillance SurCeGIDD
http://beh.santepubliquefrance.fr/beh/2020/33-34/2020_33-34_4.html
Introduction – Les CeGIDD (centres gratuits d’information, de dépistage et de diagnostic des infections par le virus de l’immunodéficience humaine (VIH), des hépatites virales et des infections sexuellement transmissibles (IST) bactériennes), ont été créés en 2016. Cet article analyse leur activité de dépistage à partir de la surveillance SurCeGIDD. Méthode – La surveillance SurCeGIDD repose sur une transmission sécurisée de données individuelles concernant les consultants, selon un format prédéfini. Les données sociodémographiques, les tests de recherche du VIH, des hépatites B et C, de la syphilis, du gonocoque (NG), du Chlamydia trachomatis (CT) et du Mycoplasma genitalium (MG), les diagnostics et les comportements sexuels ont été analysés. Les proportions de consultants testés et les taux de positivité ont été décrits pour chaque pathogène et par type de population accueillie. Résultats – En 2018, 382 890 consultations ont été rapportées par 44,6 % (n 143) des CeGIDD, sur la base de 317 CeGIDD recensés en 2016. Les consultants étaient majoritairement (59,8%) des hommes, 40,0% des femmes et 0,2% des transgenres. Les taux de positivité étaient de 0,37% pour le VIH, 1,31% pour le VHB, 0,94% pour le VHC, 7,16% pour le CT, 2,83% pour le NG, 1,04% pour la syphilis et de 5,96% pour le MG. Selon les pathogènes, les taux de positivité étaient plus élevés chez les hommes ayant des rapports sexuels avec des hommes, les personnes nées à l’étranger, les transgenres et les consultants dans les DOM et en Île-de-France. Conclusion – Malgré une couverture et une exhaustivité perfectibles, SurCeGIDD offre de nouvelles perspectives de compréhension de la vulnérabilité des populations accueillies. Leur analyse contextualisée contribuera à ajuster la stratégie nationale de santé sexuelle aux territoires et aux populations.
2020
SPF - Santé publique France
France
article de périodique
Fracture induite
Dépistage
hépatite virale b
aucun diagnostic
VIH (Virus de l'Immunodéficience humaine)
hépatite B
Dépistage de masse
Hépatite
bactérie
organisation et administration
Diagnostic
virus de l'immunodéficience humaine
vih
hepatite
hépatite virale c
maladies sexuellement transmissibles
ensemble de données
hépatite C
diagnostic
ensemble de données

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N3-AUTOINDEXEE
Rapport de l'Anses : Réseau d’épidémiosurveillance de l’antibiorésistance des bactéries pathogènes animales (RESAPATH) - Bilan 2019
https://www.anses.fr/fr/system/files/LABO-Ra-Resapath2019.pdf
Depuis 38 années au service de lasurveillance de l’antibiorésistance chez les bactéries pathogènes d'origine animale en France, le Résapath s’est imposé dans le paysage national de mobilisation sur cet enjeu majeur de santé publique. Sa capacité à étendre son périmètre a consolidé sa légitimité, depuis les bovins en 1982, les porcs et le svolaille sen 2001, ou les chiens, chats et chevaux en 2007. La qualité des données produites est le résultat d’une vigilance constante des acteurs, qu’il s’agisse de maîtriser les méthodes d’analyses, de collecter et transmettre les données produites de manière rigoureuse, et d’en interpréter les résultats au regard des connaissances scientifiques les plus actuelles. Ces efforts sont donc ceux de tous et en premier lieu des laboratoires adhérents. Le rapport Résapath est chaque année le fruit de ce travail. Qu’ils soient tous très vivement remerciés de leur rigueur et de la dynamique collective de cohésion qui les caractérisent.
2020
ANSES
France
rapport
Animaux
animal
Animal
résistance bactérienne aux médicaments
Anses
Animal
baies (géographie)
Animal
Animal
Réseau
Animal
Animaux
Animaux
Surveillance épidémiologique
Bilan
Animaux
panthera uncia
Animaux
Animal
Bactéries
Fracture intercondylienne de l'humérus
bactérie
Animal
rapport de recherche
animaux
rapport albumine/globuline
réseau
États financiers
bactéries

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N3-AUTOINDEXEE
Biofilms bactériens et santé
https://www.encyclopedie-environnement.org/sante/biofilms-bacteriens/
Qu’est-ce qu’un biofilm ? C’est un mode de vie en communautés qui permet à des microorganismes – des êtres unicellulaires tels que les bactéries – d’adopter un comportement de groupe. Les biofilms sont le plus souvent fixés à un support et ils sont ubiquitaires. Ce fut d’ailleurs un des premiers modes d’organisation du vivant au fond des océans, il y a quelques milliards d’années. La majorité des infections bactériennes impliquent des biofilms, ce qui favorise la survenue des formes chroniques et entraine des difficultés de traitement. Aucune stratégie efficace n’a encore pu être mise au point, mais une meilleure connaissance des mécanismes impliqués dans la formation et le maintien de ces agrégats devrait permettre d’élaborer prochainement des approches innovantes et efficaces.
2020
Encyclopédie de l'environnement
France
cours
biofilms
santé
bactérie

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N3-AUTOINDEXEE
Identification des bactéries à cote de sécurité élevée, basée sur la spectrométrie de masse à temps de vol après désorption/ionisation laser assistée par matrice : considérations pour les utilisateurs canadiens de Bruker
https://www.canada.ca/fr/sante-publique/services/rapports-publications/releve-maladies-transmissibles-canada-rmtc/numero-mensuel/2020-46/numero-10-1-octobre-2020/identification-bacteries-securite-elevee-desorption-ionisation-laser-assistee-matrice-mesure-temps-vol.html
Contexte : L’utilisation de systèmes de spectrométrie de masse à temps de vol après désorption/ionisation laser assistée par matrice (SM MALDI-TOF) pour identifier des bactéries est rapidement devenue un outil de première ligne dans les laboratoires de diagnostic, remplaçant les méthodes microbiologiques classiques qui déclenchaient auparavant l’identification des agents pathogènes à haut risque. Des isolats inconnus du groupe de risque 3 ont été mal identifiés comme des espèces moins pathogènes en raison de la disponibilité, du contenu et de la qualité de la bibliothèque spectrale. Par conséquent, l’exposition à des agents pathogènes à haut risque a été signalée au sein du personnel de laboratoire canadien à la suite de la mise en œuvre de la SM MALDI-TOF. Cet aperçu vise à communiquer au personnel de laboratoire le risque potentiel d’une identification inexacte des bactéries des agents biologiques à cote de sécurité élevée et à fournir des suggestions pour l’atténuer.
2020
Gouvernement du Canada
Canada
article de périodique
côtes
masse
identification (psychologie)
Sécurité
dé-identification
sécurité
Spectrométrie de masse
unilatéral
matrice extracellulaire
laser
matrices (génétique)
Assistance
bactéries
spectrométrie de masse
bactérie
Anonymisation des données

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N2-AUTOINDEXEE
Dépistage des IST bactériennes dans le secteur privé en France, 2006-2018
http://beh.santepubliquefrance.fr/beh/2019/31-32/2019_31-32_3.html
Introduction – En complément du préservatif, le dépistage et le traitement des infections sexuellement transmissibles (IST) bactériennes sont des axes stratégiques majeurs de la lutte contre ces infections. Cet article analyse l’évolution du dépistage des IST dans le secteur privé en France, à partir des données individuelles de remboursement de soins de l’Assurance maladie. Méthode – Les données de remboursement de l’Assurance maladie permettent de connaître le nombre de personnes dépistées pour la syphilis et les infections à Chlamydia trachomatis ou à gonocoque dans les laboratoires privés (laboratoires de ville et des établissements de santé privés). Les taux nationaux et régionaux de dépistage ont été calculés pour 1 000 personnes âgées de 15 ans et plus, selon l’âge et le sexe. Les tendances ont été décrites depuis 2006, avec un focus sur la période 2016-2018. Résultats – En 2018, 2,1 millions de personnes ont été testées pour une infection à Chlamydia trachomatis, soit un taux de 39 pour 1 000 habitants, avec une augmentation de 9% par rapport à 2016. Près de 1,6 millions de personnes ont eu un dépistage du gonocoque, soit un taux de 30 pour 1 000, en forte augmentation par rapport à 2016 ( 18%). Pour ces deux infections, bien que les taux soient plus élevés chez les 25 ans et plus, l’augmentation de l’activité de dépistage entre 2016 et 2018 est deux fois plus importante chez les jeunes de moins de 25 ans par rapport aux 25 ans et plus, quel que soit le sexe. Le nombre total de personnes testées pour la syphilis est de 1,8 millions en 2018 (soit un taux de 33 pour 1 000 habitants), en diminution de 7% par rapport à 2016. Cette diminution, observée pour la première fois depuis 2006, concerne seulement les femmes. Conclusion – L’augmentation du dépistage des infections à Chlamydia trachomatis et à gonocoque de 2006 à 2018, chez les jeunes de moins de 25 ans, pourrait résulter d’une meilleure sensibilisation des populations et des professionnels de santé suite aux campagnes de prévention. Dans un contexte où les données de surveillance montrent que le nombre de diagnostics de ces IST continue à augmenter, il est essentiel de poursuivre les efforts en termes de diversification de l’offre de dépistage et de ciblage des populations exposées, pour parvenir à contrôler les épidémies. La stabilité de l’activité de dépistage de la syphilis, alors que celle des autres IST bactériennes augmente, nécessitera d’être confirmée les années suivantes.
2019
SPF - Santé publique France
France
article de périodique
Dépistage
Fossette congénitale de la papille optique
France
maladies sexuellement transmissibles
Dépistage de masse
bactérie
France
secteur privé
Fracture induite
français
France
France
France

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N3-AUTOINDEXEE
« The Philly Killer » : Émergence de Legionella pneumophila, bactérie ubiquitaire de l’environnement
https://www.encyclopedie-environnement.org/sante/emergence-legionellose-legionella-pneumophila/
Juillet 1976, Bellevue Stratford Hotel à Philadelphie (Pennsylvanie – USA, voir Figure 1). La chaleur est étouffante, le conditionnement d’air tourne à plein régime… Plusieurs centaines de vétérans de « l’American Legion » y sont réunis en Congrès. A la fin du congrès, une épidémie soudaine de pneumonies graves se développe sur plusieurs jours consécutifs dans des villes environnantes : 147 légionnaires sont hospitalisés, 29 (16%) succombent. Aucune étiologie classique n’est trouvée. Une véritable enquête policière démarre alors sous l’égide des « Centers for Disease Control and Prevention » d’Atlanta (CDCP), afin de détecter « le tueur» : celui-ci reste inconnu pendant plusieurs mois ; en fait il s’agit d’une nouvelle bactérie pathogène pour l’homme, appelée par la suite « Legionella pneumophila » qui a pour biotope les eaux douces. Une nouvelle maladie d’origine environnementale était née : la légionellose !
2019
Encyclopédie de l'environnement
France
information patient et grand public
thé
legionella pneumophila
Bactéries
environnement
legionella pneumophila
thé
Environnement
bactérie
tétrahydrocortisone
bactéries

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N2-AUTOINDEXEE
Surveillance des bactéries multirésistantes dans les établissements de santé : Réseau BMR-Raisin, France, Résultats 2017
https://www.santepubliquefrance.fr/maladies-et-traumatismes/infections-associees-aux-soins-et-resistance-aux-antibiotiques/resistance-aux-antibiotiques/documents/enquetes-etudes/surveillance-des-bacteries-multiresistantes-dans-les-etablissements-de-sante-reseau-bmr-raisin-france-resultats-2017
La maîtrise de la diffusion des bactéries multirésistantes (BMR) dans les établissements de santé (ES) est une priorité du programme national de prévention des infections associées aux soins (PROPIAS). Depuis 2002, le Raisin coordonne une surveillance des Staphylococcus aureus résistant à la méticilline (SARM) et des entérobactéries productrices de béta-lactamases à spectre étendu (EBLSE) isolés de prélèvement à visée diagnostique dans les ES français. En 2017, 1 311 ES ont participé à la surveillance pour une couverture de 73 % des lits d'hospitalisation de France. Pour les SARM, la densité d'incidence (DI) globale était de 0,23 pour 1000 JH. Elle était plus élevée en court séjour (0,33), notamment en réanimation (0,75) qu'en SSR (0,11) et SLD (0,08). Depuis 2002, la DI des SARM a diminué de 64 % globalement et de 70 % en réanimation.
2019
SPF - Santé publique France
France
information scientifique et technique
France
organisation et administration
France
ayant comme résultat
bactérie
Fracture de fatigue
établissements de santé
Réseau
vitis
réseaux communautaires
bactéries
français
France
Raisins
France
France
réseau

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N3-AUTOINDEXEE
Comprendre et contrôler la transmission des bactéries multirésistantes par l'analyse et la modélisation des réseaux d’interactions interindividuelles en milieu hospitalier
https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-02448298
Les infections associées aux soins représentent un enjeu majeur de santé publique dans le monde. Les bactéries multirésistantes (BMR) sont responsables d’une grande partie de ces infections. Mieux comprendre leur dissémination dans les établissements de soins est indispensable pour élaborer des mesures de contrôle et de prévention.L’objectif de cette thèse est d’utiliser des données détaillées sur les réseaux de contacts interindividuels, couplées à des méthodes de modélisation mathématique, pour étudier la dissémination des BMR à l’hôpital afin d’améliorer leur contrôle. Pour répondre à cette problématique, les données de l’étude i-Bird ont été analysées. Cette étude prospective longitudinale a eu lieu dans l’hôpital maritime de Berck-sur-Mer durant 4 mois en 2009. Pendant cette période, les interactions de proximités entre tous les individus de l’hôpital ont été enregistrées chaque jour grâce à des capteurs RFID (Radio Frequency Identification Devices) et des prélèvements microbiologiques ont été récoltés chaque semaineDans un premier temps, la structure des contacts interindividuels au sein de et entre les différentes catégories d’individus (patient, aide-soignant, infirmier, …) a été analysée. Cette première étude a souligné l’importance des contacts patient-patient en établissement de longue durée. De plus, certaines catégories de personnel hospitalier ont été identifiées comme de potentiels super-propagateurs, tel que les brancardiers et les médecins.Dans un deuxième temps, le rôle du réseau de contacts dans la dissémination de deux espèces (E. coli et K. pneumoniae) d’entérobactéries résistantes aux béta-lactamines à spectre étendue (BLSE) a été étudié. Cette étude a montré que le réseau d’interactions de proximités était suffisant pour expliquer la propagation des KP-BLSE. En revanche, il n’était pas suffisant pour retracer la dissémination des EC-BLSE.La dernière partie de la thèse a été consacrée au développement d’un modèle individu-centré de transmission de BMR à l’hôpital modélisant explicitement les contacts interindividuels. Ce modèle permet d’évaluer l’effet de mesures de contrôle ciblant la structure du réseau de contacts. A titre d’application, les données de l’étude i-Bird ont été utilisées pour simuler la transmission de Staphylococcus aureus résistant à la méticilline (SARM) durant les 4 mois de l’étude. La simulation de procédures de cohorting du personnel dans l’hôpital de Berck-sur-Mer suggère que la mise en place de telles mesures permet de réduire l’acquisition de SARM chez les patients.Cette thèse combine analyse de réseaux, épidémiologie des maladies infectieuses et modélisation dynamique. Elle apporte une meilleure compréhension de la diffusion et du contrôle des BMR dans les hôpitaux de longue durée. De plus, elle apporte un outil innovant, visant à être développé, pour la compréhension et le contrôle de la dissémination des BMR à travers les contacts en milieu hospitalier.
2019
TEL - Thèses en ligne
France
thèse ou mémoire
hôpitaux
hôpital
bactérie
Transmissions
bactéries
réseau

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N2-AUTOINDEXEE
Traitements pour réduire l'infection par la bactérie Staphylococcus aureus dans l'eczéma
https://www.cochrane.org/fr/CD003871/SKIN_traitements-pour-reduire-linfection-par-la-bacterie-staphylococcus-aureus-dans-leczema
Contexte La peau des personnes atteintes d'eczéma (dermatite atopique) porte souvent un grand nombre de bactéries appelées Staphylococcus aureus (S. aureus), qui peuvent causer des infections cutanées. Les traitements de l'eczéma destinés à réduire la présence de S. aureus sur la peau comprennent les antibiotiques, les traitements mis sur la peau et les savons et bains antibactériens. Il n'est pas clair quant à savoir quels traitements sont utiles. Problématique de la revue Nous avons examiné les données sur l'effet des traitements visant à réduire la présence de S. aureus sur la peau des personnes atteintes d'eczéma atopique. Les comparaisons éligibles étaient les traitements similaires sans action anti-S. aureus. Nous avons inclus 41 études portant sur 1753 participants (les données sont à jour jusqu'en octobre 2018).
2019
Cochrane
revue de la littérature
résumé ou synthèse en français
Infection
Infection
Eczéma
eczéma
eczéma
Bactéries
staphylococcus aureus
staphylococcus aureus
bactérie
infections à staphylocoques
maladie infectieuse
infection
bactéries

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N3-AUTOINDEXEE
Panaris péri-unguéal bactérien aigu : trempage à chaud, et parfois incision d'un abcès
In Panaris péri-unguéal bactérien aigu Rev Prescrire 2018 ; 38 (418) : 600-604.
http://www.prescrire.org/fr/3/31/55202/0/NewsDetails.aspx
Les panaris près de l'ongle sont des affections souvent peu graves qui justifient surtout des soins d'hygiène et une surveillance clinique pour repérer les complications...
2018
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Prescrire
France
français
résumé ou synthèse en français
abcès
incisive
panaris
aigu
Bromhidrose
abcès
Acidémie
Bradycardie
Syndrome de l'artère poplitée piégée
bactérie
trempage
incision
son aigu
Fracture induite
hyperthyroidie
gastrite chronique
panaris
paronychie

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N2-AUTOINDEXEE
Microbiote intestinal et inflammation : prédiction de la réponse aux anti-TNF? dans les maladies inflammatoires chroniques et modulation de la croissance bactérienne in vitro en réponse au TNF?
http://www.theses.fr/2018BORD0285
L’interface hôte/microbiote intestinal est un système d’interactions complexes dont le déséquilibre est associé au développement des maladies inflammatoires chroniques. Les traitements anti-TNFα sont très efficaces dans ces maladies, mais seulement chez certains patients. L’objectif de ce travail était de rechercher un lien entre composition du microbiote intestinal et réponse aux traitements anti-TNFα dans deux types de maladies inflammatoires chroniques, les spondyloarthrites et les maladies inflammatoires chroniques de l’intestin. Nous avons retrouvé des variations de la composition du microbiote intestinal après traitement par anti-TNFα chez des patients atteints de spondyloarthrite et avons identifié un nœud taxonomique prédictif de la réponse thérapeutique à trois mois. Ce nœud taxonomique, l’ordre des Burkholderiales, étant ainsi un biomarqueur potentiellement utilisable en pratique clinique, nous avons déposé une demande de brevet européen, qui est en cours d’instruction. Ce travail a été poursuivi par un nouveau protocole de recherche clinique incluant des patients atteints de spondyloarthrites mais aussi de maladies inflammatoires chroniques intestinales. Ce protocole est financé par le CHU de Bordeaux dans le cadre de l’Appel d’Offre Interne. Il permettra de valider les hypothèses de notre premier travail, en réalisant notamment des PCR quantitatives utilisant des amorces spécifiques de l’ordre des Burkholderiales. Nous avons de plus retrouvé in vitro pour la première fois à notre connaissance une modulation de la croissance bactérienne chez Bacteroides fragilis en réponse au TNFα humain.
2018
theses.fr
France
thèse ou mémoire
infections bactériennes
inflammation
inflammation
Maladie inflammatoire
Intestins
Malade chronique
bactérie
Microbiome gastro-intestinal
maladie chronique
Maladies
anti-inflammatoires
Inflammation
In vitro
maladies inflammatoires
maladie chronique
microbiote
croissance
Inflammation
Maladie chronique
tractus intestinal, sai
intestins
Techniques in vitro
microbiote

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N2-AUTOINDEXEE
Bactéries multirésistantes et voyage
https://www.revmed.ch/RMS/2017/RMS-N-561/Bacteries-multiresistantes-et-voyage
La résistance aux antibiotiques est un problème global qui touche aussi les pays tropicaux. Les voyageurs dans ces régions s’exposent donc au risque d’être colonisés et infectés avec des germes multirésistants. La région visitée, la survenue de diarrhées et la prise d’antibiotiques sont les facteurs de risque principaux pour une colonisation digestive avec des entérobactéries multirésistantes qui peut aller jusqu’à 80 %. Les colonisations par les staphylocoques dorés résistant à la méticilline et les entérocoques résistant à la vancomycine sont souvent dues à un contact avec les services médicaux dans les pays visités. Pour le praticien, il est important de tenir compte du risque d’infections avec des bactéries multirésistantes chez les patients au retour d’un voyage. Un dépistage de ces germes dans les selles ou par des frottis mucocutanés peut être discuté dans certaines situations.
2017
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RMS - Revue Médicale Suisse
Suisse
français
article de périodique
bactéries
voyage
bactérie

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N3-AUTOINDEXEE
Surveillance des bactéries multiresistantes dans les établissements de santé en France
Réseau BMR-Raisin – Résultats 2015
https://www.santepubliquefrance.fr/maladies-et-traumatismes/infections-associees-aux-soins-et-resistance-aux-antibiotiques/resistance-aux-antibiotiques/documents/rapport-synthese/surveillance-des-bacteries-multiresistantes-dans-les-etablissements-de-sante-en-france.-reseau-bmr-raisin-resultats-2015
La maîtrise de la diffusion des bactéries multirésistantes (BMR) dans les établissements de santé (ES) est une priorité du programme national de prévention des infections associées aux soins (PROPIAS). Depuis 2002, le réseau Raisin coordonne une surveillance des Staphylococcus aureus résistant à la méticilline (SARM) et des entérobactéries productrices de béta-lactamases à spectre étendu (EBLSE) isolés de prélèvement à visée diagnostique dans les ES français. En 2015, 1 427 ES ont participé à la surveillance soit une augmentation de 199 % depuis 2002 pour une couverture de 77 % des lits d’hospitalisation de France. Pour les SARM, la densité d’incidence (DI) globale était de 0,26 pour 1 000 JH. Elle était plus élevée en court séjour (0,36) et en réanimation (0,93) qu’en SSR (0,16) et SLD (0,11). Depuis 2002, la DI des SARM a diminué de 59 % globalement et de 63 % en réanimation. Pour les EBLSE, la DI globale était de 0,67 pour 1 000 JH. Elle était deux fois plus élevée en court séjour (0,93) qu’en SSR(0,44) et trois fois qu’en SLD (0,23). Depuis 2002, la DI des EBLSE a été multipliée par 5,1 ( 413 %) et la proportion de l’espèce Escherichia coli au sein des EBLSE a augmenté de 19 à 57 %. La diminution continue de l’incidence des SARM suggère un impact positif des actions de prévention instituées dans les services participants au réseau. Le nombre annuel d’IN à SARM est toutefois estimé entre 23 000 et 39 000, dont environ 3 800 à 5 700 bactériémies et celui des EBLSE entre 49 000 et 103 000, dont entre 5 800 et 10 200 bactériémies. Enfin, l’augmentation de l’incidence des EBLSE, en particulier des E. coli, est préoccupante et peut servir de réservoir potentiel pour l’émergence de nouvelles souches résistantes aux carbapénèmes.
2017
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InVS - Institut de Veille Sanitaire
France
français
rapport
ayant comme résultat
France
bactérie
établissements de santé
Raisins
bactéries
réseau
français
vitis

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N3-AUTOINDEXEE
Modification de la Nomenclature des actes de biologie médicale pour l’acte de suivi thérapeutique des patients infectés par Treponema pallidum (bactérie responsable de la syphilis)
http://www.has-sante.fr/portail/jcms/c_2752929/fr/modification-de-la-nomenclature-des-actes-de-biologie-medicale-pour-l-acte-de-suivi-therapeutique-des-patients-infectes-par-treponema-pallidum-bacterie-responsable-de-la-syphilis
Objectif L’objectif de ce travail est de répondre à une saisine la Caisse nationale d’assurance maladie des travailleurs salariés (CNAMTS) adressée en juin 2014, en vue d’inscrire à la Nomenclature des actes de biologie médicale (NABM) un acte de suivi thérapeutique de la syphilis. Suite à cette même saisine, une évaluation traitant des actes de dépistage et de diagnostic a été publiée en mai 2015. La CNAMTS propose d’inscrire un acte de suivi thérapeutique fondé sur un test non tréponémique (TNT) quantitatif, devant être réalisé à 3, 6 et 12 mois après le début du traitement pour une syphilis précoce (et de manière plus fréquente chez les patients infectés par le VIH et les femmes enceintes), et à 6, 12 et 24 mois pour une syphilis tardive. La demande précise d’une part qu’une négativation, sinon une diminution par quatre du titre, confirme une guérison et d’autre part, qu’une augmentation par quatre du titre permet de poser le diagnostic d’une recontamination.
2017
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HAS - Haute Autorité de Santé
France
français
évaluation technologique
Patients
continuité des soins
Bactéries
altéré
syphilis
treponema pallidum
biologique
Thérapeutique
biologie
syphilis
Infection
médical
bactérie
Surveillance des médicaments
Nomenclature
a comme patient
patients
bactéries
thérapeutique
infection
terminologie

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N3-AUTOINDEXEE
Impact d’une politique proactive de surveillance et de gestion des risques infectieux dans un centre hospitalo-universitaire parisien sur la diffusion des Bactéries Multi-Résistantes aux antibiotiques
https://hal.archives-ouvertes.fr/tel-01791618
Cette thèse recouvre une période de 15 ans de lutte contre la diffusion hospitalière des bactéries multi-résistantes aux antibiotiques (BMR) au sein d’un CHU parisien pilote. Elle intègre plusieurs études axées sur les outils informatiques de surveillance, la maîtrise de la transmission croisée, et le bon usage des antibiotiques
2017
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HAL Archives ouvertes
France
français
thèse ou mémoire
diffusion
résistance bactérienne aux médicaments
bactérie
diffusion
antibiotique
gestion du risque
propagation
politique
résistant
rigidité diffuse
Antibiotiques
centres hospitaliers universitaires
central
Bactéries
Antibiotiques
Centre

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N3-AUTOINDEXEE
Détection précoce de la sensibilité bactérienne aux antibiotiques
http://www.theses.fr/2017USPCB078
Suite à la découverte des antibiotiques, les succès thérapeutiques ont laissé présager un avenir où les maladies infectieuses d’origine bactérienne seraient éradiquées. Cependant, en moins d’un siècle, l’utilisation massive des antibiotiques à large spectre a conduit à l’émergence de résistances réduisant ainsi les options thérapeutiques. Mon projet de recherche vise à comprendre les altérations métaboliques et morphologiques bactériennes induites précocement par les antibiotiques et à contribuer au développement de tests diagnostiques rapides et fiables pour favoriser la mise en place d’antibiothérapies plus ciblées. Grâce au suivi des modifications des divers paramètres métaboliques et morphologiques des bactéries après traitement aux antibiotiques, nous avons montré l’intérêt des marqueurs de viabilité tels que le DiBAC4(3), le TOPRO -3 ou encore l’Alexa FluorTM Hydrazide pour la détection rapide (<3h) de la sensibilité des bactéries aux antibiotiques. Nous avons notamment montré, pour la première fois, que la carbonylation des protéines, qui est induite dans des conditions de stress oxydatif et de vieillissement cellulaire, est un marqueur précoce universel de la sensibilité aux antibiotiques bactéricides. Suite à cette première partie de l’étude, nous avons souhaité comprendre les mécanismes mis en jeu par les bactéries en réponse au stress létal causé pas les antibiotiques. Au cours de nos expériences, il a été observé que lorsque les conditions ne permettaient plus la survie de l’organisme, un signal de fluorescence intrinsèquement lié à la bactérie permettait de prédire l’issue fatale après seulement 2 heures d’incubation avec l’antibiotique. En effet, suite à un traitement avec un antibiotique bactéricide ciblant la synthèse du peptidoglycane bactérien (ampicilline), nous avons observé une fluorescence maximale des cellules à la dose d’antibiotique correspondant à la Concentration Minimale Inhibitrice (CMI). L’augmentation de la fluorescence des cellules bactériennes a aussi été observé lors du traitement létal avec un agent biocide (hypochlorite de sodium). Cependant, ce phénomène n’est plus observable avec des antibiotiques bactériostatiques ou bactéricides qui inhibent la synthèse protéique indiquant l’importance d’un métabolisme bactérien actif. Les corrélations de propriétés spectrales nous ont permis de suspecter les molécules de flavines comme étant responsables du phénomène d’autofluorescence observé. De plus, nous avons montré une suractivation de la voie de biosynthèse des cofacteurs de type flavines et des flavoprotéines en présence d’ampicilline. Finalement, nous avons effectué des expériences de tri et de survie cellulaire de populations bactériennes traitées à l’ampicilline. Nos résultats ont montré que les cellules très fluorescentes ont une survie moyenne 5 fois supérieure aux cellules peu fluorescentes. Ceci suggère que le signal de fluorescence observé est une réponse cellulaire médiée par les composés flavonoïdes pour tenter de survivre au traitement antibiotique. Des travaux exploratoires suggèrent que le phénomène étudié chez les bactéries est conservé chez les levures et chez les cellules humaines. Ces résultats ouvrent de nouvelles perspectives dans la compréhension de la physiologie bactérienne, l’étude de la réponse bactérienne face à un stress exogène et la surveillance rapide de la viabilité des cellules.
2017
theses.fr
France
thèse ou mémoire
Antibiotiques
bactérie
antibiotique
sensibilité
Antibiotiques
enquêteur
antibactériens
diagnostic précoce
Sensibilité
sensibilité et spécificité

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N2-AUTOINDEXEE
La grippe et les surinfections bactériennes - Menaces et traitements
https://www.medecinesciences.org/articles/medsci/pdf/2017/05/medsci20173305p528.pdf
La grippe et ses complications restent un problème important de santé publique et une lourde préoccupation socio-économique. La découverte de nouveaux antiviraux et l’exploitation des connaissances sur l’immunité antivirale devraient offrir prochainement de nouvelles solutions thérapeutiques ou préventives pour mieux contrôler la sévérité de la grippe. Une meilleure compréhension de la pathogenèse devrait également aboutir à la découverte de molécules clés dont on pourrait moduler la production pour le bienêtre des patients. Enfin, l’identification de nouveaux immunomodulateurs et immunostimulants pourrait permettre de compenser le dysfonctionnement des mécanismes de défense contre les infections bactériennes secondaires dont on sait qu’elles amplifient gravement le tableau clinique des patients grippés.
2017
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M/S médecine sciences
France
français
article de périodique
grippe
surinfections
Surinfection
bactérie
Grippe
Traités
thérapeutique
grippe
surinfection
grippe humaine
surinfection
imminent
co-infection
coopération internationale

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N3-AUTOINDEXEE
Étude de la sensibilité des bactéries aux antibiotiques prescrits en première intention par les médecins généralistes dans les infections urinaires communautaires
https://dumas.ccsd.cnrs.fr/dumas-01293414
Introduction : Les médecins généralistes (MG) sont confrontés à une augmentation des résistances bactériennes aux antibiotiques les plus utilisés dans les infections urinaires (IU) et doivent en conséquence adapter leurs prescriptions à l’évolution de l’écologie bactérienne. Objectif : Évaluer si les antibiotiques prescrits en première intention par les MG dans les IU présentaient un seuil de résistance inférieur à 20% pour les cystites aiguës simples et à 10% pour les cystites à risque de complication, les pyélonéphrites aiguës et les IU masculine
2016
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DUMAS - Dépôt Universitaire de Mémoires Après Soutenance
France
français
thèse ou mémoire
infections urinaires
infections urinaires
Antibiotiques
antibiotique
Antibiotiques
prescription
intention
sensibilité
médecine communautaire
infections communautaires
Infection communautaire
Sensibilité
bactéries
Médecins
médecins généralistes
maladie infectieuse des voies urinaires
bactérie
collecte de données
Infection urinaire
antibactériens
sensibilité et spécificité

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N3-AUTOINDEXEE
Otite externe aiguë bactérienne : les premiers choix
http://www.prescrire.org/Fr/3/31/52087/0/NewsDetails.aspx
Les otites externes aiguës sont souvent d'origine bactérienne. Pour réduire la durée des symptômes, une fluoroquinolone en gouttes dans le conduit auditif, telle que la ciprofloxacine ou l'ofloxacine, est le traitement antibiotique de premier choix...
2016
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France
français
résumé ou synthèse en français
otite externe
otite externe
premier
bactérie
comportement de choix
otite externe aiguë
Maladie aigüe
otite externe

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N3-AUTOINDEXEE
Gestion des risques associés à la présence de la bactérie Legionella spp. dans les réseaux d’eau des centres hospitaliers au Québec
https://www.inspq.qc.ca/publications/2159
En mai 2013, le directeur de santé publique de l’Agence de la santé et des services sociaux (ASSS) de la Mauricie-et-du Centre-du-Québec a demandé à l’Institut national de santé publique du Québec (INSPQ) un avis sur la gestion de la présence de la bactérie Legionella spp. dans les réseaux d’eau potable des hôpitaux. Il n’existe actuellement aucune ligne directrice ni réglementation au Québec ou au Canada quant à la présence et au suivi de cette bactérie dans les réseaux d’eau potable, ainsi qu’à l'interprétation des résultats lorsqu’elle est détectée.
2016
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INSPQ - Institut National de Santé Publique - Québec
France
français
rapport
central
gestion du risque
hôpital
Québec
legionella
réseau
bactérie
hôpitaux
eau
syndrome post-phlébitique
syndrome post-poliomyélitique
legionella
embolisation d'artère utérine
eau
Bactéries
bactéries

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N3-AUTOINDEXEE
Revue de 22 cas d'endophtalmies endogènes bactériennes et fongiques au CHU de Nice sur 15 ans
https://dumas.ccsd.cnrs.fr/dumas-01293654
Objectif : Evaluer les caractéristiques, la prise en charge diagnostique et thérapeutique et le pronostic des cas d’endophtalmies endogènes bactériennes et fongiques pris en charge au CHU de Nice entre Janvier 2000 et Juin 2015. Matériel et Méthode : Les 323 dossiers de patients ayant été traités pour endophtalmie au CHU de Nice sur cette période ont été revus pour sélectionner les patients atteints d’endophtalmies endogènes. Leurs caractéristiques démographiques, antécédents médicaux, caractéristiques cliniques initiales, prise en charge diagnostique et thérapeutique, les germes retrouvés ainsi que leur pronostic final ont été analysés.
2015
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DUMAS - Dépôt Universitaire de Mémoires Après Soutenance
France
français
thèse ou mémoire
endophtalmie
endogène
bactérie
hôpitaux universitaires
revue de la littérature
endophtalmie
champignon
revue de la littérature

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N3-AUTOINDEXEE
Tuberculose: histoire évolutive et bactérie zombie
http://www.avisdexperts.ch/videos/view/3667/1/a%3A1%3A%7Bs%3A3%3A%22Tag%22%3Ba%3A1%3A%7Bi%3A0%3Bs%3A8%3A%22MEDECINE%22%3B%7D%7D
2015
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Avis d'Experts - La Radio Télévision Suisse (RTS) et les Universités de Suisse Romande
Suisse
français
information patient et grand public
enregistrement vidéo
histoire
bactérie
bactéries

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N2-AUTOINDEXEE
Infection à bactéries multi-résistantes (BMR) digestives
http://www.inrs.fr/publications/bdd/eficatt/fiche.html?refINRS=EFICATT_Infection%20%C3%A0%20bact%C3%A9ries%20multi-r%C3%A9sistantes%20(BMR)%20digestives
Agent pathogène, données épidémiologiques, pathologie, que faire en cas d'exposition ? Démarche médico-légale, éléments de référence
2015
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INRS - Institut National de Recherche et de Sécurité
France
français
information scientifique et technique
bactéries
infection
appareil digestif, sai
fonction du tube digestif
digestif
bactérie
Digestifs
digestion
résistance aux infections
résistant
agents gastro-intestinaux

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N3-AUTOINDEXEE
Génétique bactérienne
http://umvf.cerimes.fr/media/ressWikinu/p2d1/maurin_max_3a_p01/index.htm
Le génome bactérien; Réplication de l'ADN bactérien; Transcription, traduction; Les opérons; Reproduction par scissiparité; Variations génétiques; Applications: taxonomie, identification bactérienne et diagnostic moléculaires
2011
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2eme cycle / master
Université Grenoble Alpes
France
français
cours
Bactériologie médicale
bactériologiste
bactériologique
bactérie
bactériologie
génétique microbienne
gène
Génétique
génétique

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N3-AUTOINDEXEE
Bactéries de l'ulcère gastroduodénal
Helicobacter pylori
http://umvf.cerimes.fr/media/ressWikinu/p2d1/maurin_max_3a_p08/index.htm
Introduction; Taxonomie; Bactériologie; Épidémiologie; Pouvoir pathogène; Diagnostic; Traitement
2011
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2eme cycle / master
Université Grenoble Alpes
France
français
cours
Ulcères peptiques
bactérie
ulceration
helicobacter pylori
Ulcère
bactériologique
bactériologie
bactériologiste
ulcère peptique
Bactéries
ulcère pylorique
helicobacter pylori
ulcère
bactéries

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N3-AUTOINDEXEE
Les bactéries responsables des entérites
http://umvf.cerimes.fr/media/ressWikinu/p2d1/maurin_max_3a_p05/index.htm
Introduction; Épidémiologie; Physiopathologie; Aspects cliniques; Bactéries et leur épidémiologie; Diagnostic par TIA/TIAC; Diagnostic de la colite pseudomembraneuse; Traitement; Prophylaxie
2011
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2eme cycle / master
Université Grenoble Alpes
France
français
cours
Entérite
bactéries
entérite
bactériologiste
bactérie
bactériologie
bactériologique
entérite

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N3-AUTOINDEXEE
Bactéries responsables des endocardites
http://umvf.cerimes.fr/media/ressWikinu/p2d1/maurin_max_3a_p07/index.htm
Introduction; Physiopathologie; Épidémiologie; Aspects cliniques; Espèces bactériennes en cause; Diagnostic; Traitement; Prophylaxie
2011
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2eme cycle / master
Université Grenoble Alpes
France
français
cours
Maladies de l'endocarde et du péricarde
bactéries
endocardite
bactérie
bactériologie
endocardite
bactériologique
endocardite
bactériologiste

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N3-AUTOINDEXEE
Bactéries des zoonoses non alimentaires
http://umvf.cerimes.fr/media/ressWikinu/p2d1/maurin_max_3a_p09/index.htm
Définition; Réservoir et modes de transmission; Caractères spécifiques; Professions ou activités à risque; Rickettsia-Rickettsioses; Coxiella burnetii-Fièvre Q; Bartonella-bartonelloses; Chlamydophila psittaci-psittacose; Brucella-Brucellose; Francisella-tularémie; Bacillus anthracis-charbon; Yersinia pestis-Peste; Borrelia-Maladie de Lyme; Leptospira-leptospirose; Pasteurella-Pasteurellose; Conclusion
2011
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2eme cycle / master
Université Grenoble Alpes
France
français
cours
Zoonoses
zoonoses
bactéries
bactériologique
zoonose
bactérie
bactériologiste
bactériologie

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N3-AUTOINDEXEE
Bactéries responsable des bactériémies et des endocardites infectieuses
http://umvf.cerimes.fr/media/ressWikinu/p2d1/maurin_max_3a_p06/index.htm
Introduction; Physiopathologie; Épidémiologie; Manifestations cliniques; Diagnostic: hémoculture; Diagnostic moléculaire; Traitement; Conclusion
2011
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2eme cycle / master
Université Grenoble Alpes
France
français
cours
Maladies de l'endocarde et du péricarde
bactérie
bactéries
bactériémie
bactériologique
endocardite
bactériologiste
endocardite bactérienne
bactériologie
endocardite bactérienne
bactériémie
Endocardite infectieuse
endocardite

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N3-AUTOINDEXEE
Réponse immune innée des cellules épithéliales aux bactéries pathogènes
http://umvf.cerimes.fr/media/ressMicrobiologie/reponse-immune-innee.m4v
La réponse immune innée; Les récepteurs de la réponse innée; Interaction PAMP-TLR sur les macrophages; Comment les cellules épithéliales intestinales tolèrent-elles les bactéries commensales, mais pas les pathogènes?; La détection des bactéries invasives par les cellules épithéliales; Conclusion
2007
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Université de Rennes 1
France
français
cours
Tissus épithéliaux
bactéries
bactérie
immunité innée

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N3-AUTOINDEXEE
Bactéries, nos amies?
http://www.canal-u.tv/video/cerimes/bacteries_nos_amies.8956
Film d'animation
1990
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Canal U
France
film éducatif
Biologie des organismes vivants et sujets connexes
bactérie
bactéries
amis

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