Génome viralDescripteur MeSH

N2-AUTOINDEXEE
Détection des génomes du virus de la grippe A et B, et du SARS-CoV-2 par RT-PCR dans un contexte d’exposition à risque à un virus influenza zoonotique
https://has-sante.fr/jcms/p_3520845/fr/detection-des-genomes-du-virus-de-la-grippe-a-et-b-et-du-sars-cov-2-par-rt-pcr-dans-un-contexte-d-exposition-a-risque-a-un-virus-influenza-zoonotique
Objectifs de l’évaluation L’objectif de ce travail était de : définir la place de la détection des génomes des virus Influenza A et B de la grippe et du SARS-CoV-2 par RT-PCR dans la stratégie diagnostique d’un cas suspect de grippe humaine due à un virus influenza d’origine zoonotique ; évaluer les performances diagnostiques de la RT-PCR détectant la grippe A et B saisonnière pour la recherche d’un virus influenza A d’origine zoonotique chez les patients présentant des symptômes compatibles avec une infection par le virus SARS-CoV-2 ou une infection respiratoire hivernale, dont la grippe, dans un contexte d’exposition à risque à un virus influenza zoonotique ; préciser les conditions de prélèvements respiratoires chez les cas possibles d’infection due à un virus influenza porcin ou aviaire. Ce travail a été mené en vue d’une extension d’indication d’un acte déjà pris en charge, en période de co-circulation du virus SAS-CoV-2 et des virus grippaux, par le système national d’assurance maladie en France. La prise en charge de cet acte dans cette indication s’étendrait à toute l’année.
2024
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HAS - Haute Autorité de Santé
France
évaluation technologique
grippe
SARS-CoV-2
cercopithecine herpesvirus 1
exposition à
exposition à
RT-PCR
Génome
coronavirus du SARS
grippe
génome
virus de l'influenza a
enquêteur
virus de la grippe A
herpèsvirus simien
génome viral
grippe humaine
virus influenza B
contexte d'application
RT-PCR
Exposition
Génome
Génomique
détection
risque
Virus
virus de la grippe A

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N3-AUTOINDEXEE
Séquençage et surveillance génomique des virus : lumière sur Emergen et Afroscreen
https://www.inserm.fr/actualite/sequencage-et-surveillance-genomique-des-virus-lumiere-sur-emergen-et-afroscreen/
La pandémie de Covid-19 qui affecte la planète depuis plus de deux ans a mis en évidence de grandes disparités entre pays en matière de séquençage – une technique indispensable pour surveiller la circulation du SARS-CoV‑2 et son évolution. Afin de renforcer ses capacités et celles des pays à ressources limitées, la France a initié les programmes Emergen et Afroscreen, en s’appuyant sur l’agence interne de l’Inserm, l’ANRS Maladies infectieuses émergentes. Ces projets lancés en 2021 ont permis de renforcer les activités de séquençage sur le territoire français, mais aussi dans treize nations africaines.
2022
INSERM - Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale
France
information scientifique et technique
organisation et administration
Séquençages
Virus
Lumière
analyse de séquence
génome
génome viral
virus
Génomique
Virus
Virus
lumière

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N3-AUTOINDEXEE
Avis n 2021.0007/AC/SEAP du 10 février 2021 du collège de la HAS relatif aux modifications des conditions d’inscription sur la LAP mentionnée à l’article L. 162-1-7 du CSS, à la détection du génome du virus SARS-CoV-2 par technique de transcription inverse suivie d’une amplification (RT-PCR) sur prélèvement salivaire
https://www.has-sante.fr/jcms/p_3236975/fr/avis-n-2021-0007/ac/seap-du-10-fevrier-2021-du-college-de-la-has-relatif-aux-modifications-des-conditions-d-inscription-sur-la-lap-mentionnee-a-l-article-l-162-1-7-du-css-a-la-detection-du-genome-du-virus-sars-cov-2-par-technique-de-transcription-inverse-suivie-d-une-amplification-rt-pcr-sur-prelevement-salivaire
Dans la continuité de son avis rendu fin janvier 2021, la HAS finalise la réévaluation des RT-PCR SARS-CoV-2 sur prélèvement salivaire. Ainsi, compte tenu des résultats d’une très large méta-analyse regroupant 65 essais portant sur les performances diagnostiques du test RT-PCR sur prélèvement salivaire et de la position du groupe d’experts, la HAS est désormais favorable à la prise en charge de ces tests non invasifs dans trois indications.
2021
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HAS - Haute Autorité de Santé
France
COVID-19
recommandation de santé publique
RT-PCR
établissements scolaires
7-methylbenzo[a]anthracene
Techniques
Techniques
transcription inverse
Abcès périanal
inversion
Agraphie
système informatisé d'entrée des ordonnances médicales
enquêteur
Virus
virus
PCR inverse
Fracture-luxation
enregistrements
Génome
amplificateurs électroniques
Techniques
Virus
génome
virus du SRAS
Abcès du poumon
Virus
Techniques
génome viral

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N2-AUTOINDEXEE
Avis du 11 mars 2021 - Inscription de la détection du génome du virus SARS-CoV-2 par technique isotherme d’amplification médiée par la transcription (TMA) sur prélèvement salivaire
https://www.has-sante.fr/jcms/p_3243221/fr/avis-n2021-0012/ac/seap-du-11-mars-2021-du-college-de-la-has-relatif-a-l-inscription-sur-la-lap-mentionnee-a-l-article-l-162-1-7-du-css-de-la-detection-du-genome-du-virus-sars-cov-2-par-technique-isotherme-d-amplification-mediee-par-la-transcription-tma-sur-prelevement-salivaire
Le document ci-dessous est l'avis du Collège de la Haute Autorité de santé relatif à l’inscription sur la liste des actes et prestations mentionnée à l’article L. 162-1-7 du code de la sécurité sociale, de la détection du génome du virus SARS-CoV-2 par technique isotherme d’amplification médiée par la transcription (TMA) sur prélèvement salivaire. La HAS est favorable à l’inscription de la technique TMA sur prélèvement salivaire dans les mêmes indications de dépistage ou de détection que la technique de transcription inverse suivie d’une amplification (RT-PCR) sur prélèvement salivaire.
2021
HAS - Haute Autorité de Santé
France
pneumopathie virale
infections à coronavirus
COVID-19
information scientifique et technique
Génome
enregistrements
virus du SRAS
génome
Fracture-luxation
génome viral
virus
Techniques
5-triméthoxyamphétamine
Virus
Abcès splénique
Virus
mars
enquêteur
amplificateurs électroniques
transcription génétique
Techniques
Techniques
triméthylamine
Techniques
Virus
génome
virus
pandémies
méthylamines
COVID-19

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N1-VALIDE
Évaluation de la détection du génome des entérovirus dans le liquide céphalorachidien par amplification génique dans les méningites - Rapport d'évaluation
http://www.has-sante.fr/portail/jcms/c_1739174/fr/evaluation-de-la-detection-du-genome-des-enterovirus-dans-le-liquide-cephalorachidien-par-amplification-genique-dans-les-meningites-rapport-d-evaluation
http://www.has-sante.fr/portail/jcms/c_1757832/fr/evaluation-de-la-detection-du-genome-des-enterovirus-dans-le-liquide-cephalorachidien-par-amplification-genique-dans-les-meningites-rapport-d-evaluation
L’objectif de cette évaluation est de déterminer si la détection du génome des entérovirus dans le liquide céphalorachidien (LCR) par amplification génique est un outil diagnostique validé dans la prise en charge des méningites
2014
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HAS - Haute Autorité de Santé
France
148. Méningites, méningoencéphalites chez l'adulte et l'enfant
151. Méningites, méningoencéphalites, abcès cérébral chez l'adulte et l'enfant
français
évaluation technologique
génome viral
enterovirus
liquide cérébrospinal
méningite virale
amplification de gène
méningite à entérovirus
infections à entérovirus
guides de bonnes pratiques cliniques comme sujet
réaction de polymérisation en chaîne

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N1-VALIDE
Conditions pré-analytiques de réalisation de la recherche du génome (ADN) des Papillomavirus Humains (HPV) oncogènes à partir de frottis cervico-utérins - Rapport d'évaluation
http://www.has-sante.fr/portail/jcms/c_1264004/fr/conditions-pre-analytiques-de-realisation-de-la-recherche-du-genome-adn-des-papillomavirus-humains-hpv-oncogenes-a-partir-de-frottis-cervico-uterins-rapport-devaluation
http://www.has-sante.fr/portail/jcms/c_1660402/fr/conditions-pre-analytiques-de-realisation-de-la-recherche-du-genome-adn-des-papillomavirus-humains-hpv-oncogenes-a-partir-de-frottis-cervico-uterins-rapport-devaluation
L'objectif de travail qui se place dans le cadre de l'indication de recherche du génome (ADN) des HPV oncogènes, recommandée et prise en charge par l'Assurance Maladie (frottis cervico-utérin ASC-US), était : d'identifier les facteurs pré-analytiques succeptibles d'interférer avec les résultats de la recherche du génome (ADN) et des HPV oncogènes d'établir les conditions de réalisation de la phase pré-analytique de cette recherche
2013
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HAS - Haute Autorité de Santé
Paris
France
297. Tumeurs du col utérin, tumeur du corps utérin
300. Tumeurs du col utérin, tumeur du corps utérin
français
génome viral
alphapapillomavirus
Frottis vaginaux
évaluation technologique
Test de détection du génome des papillomavirus humains oncogènes

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