Description : La médecine de précision est une approche médicale récente prenant en compte les caractéristiques
génomiques, biologiques, environnementales et sociales des patients pour proposer
une meilleure évaluation des risques de maladies, un diagnostic plus fin, une meilleure
capacité pronostique, une plus grande personnalisation des traitements. Elle se caractérise
donc par le recours à une très large quantité de données, de sources et de natures
diverses. L’exploitation de ces données soulève en premier lieu des enjeux d’intégration
et d’interopérabilité. Leur réutilisabilité ultérieure suppose la compréhension de
leur sémantique et du contexte dans lequel elles ont été produites. Sous ces deux
aspects, l’utilisation d’ontologies informatiques constitue une solution viable et
éprouvée. Un troisième aspect concerne l’analyse de ces données, pour laquelle l’organisation
de ces dernières en un graphe de connaissances ouvre des perspectives propres. C’est
en ce sens que nous considérons qu’il existe une « voie ontologique » pour la médecine
de précision. Dans le cadre du projet de recherche hospitalo-universitaire PsyCARE,
qui témoigne de l’émergence en psychiatrie de cette approche médicale, nous proposons
une ontologie modulaire. Le module de haut niveau accorde une importance majeure à
la représentation du changement et de la temporalité. Le module de niveau intermédiaire
est une ontologie noyau des données médicales. Le module dédié à la clinique psychiatrique
vise également à l’annotation sémantique de documents de psychiatrie. Plusieurs ontologies
de domaine correspondant aux disciplines convoquées (imagerie, biologie, analyse du
discours, évaluation de la psychomotricité) sont développées à partir d’un patron
de conception ontologique élaboré à cette occasion.;
Pays