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N3-AUTOINDEXEE
Apport des technologies de séquençage haut débit en microbiologie clinique : revue de la littérature et projet d’implantation au CHU de Rouen
https://dumas.ccsd.cnrs.fr/dumas-03978975
Le diagnostic microbiologie est le prérequis indispensable à un traitement anti-infectieux adapté. Les techniques de diagnostic microbiologiques sont encore grandement dépendantes de méthodes, certes robustes, mais anciennes et qui atteignent leurs limites. Les nouvelles méthodes de séquençages, dites « haut débit » ou NGS, permettent d’obtenir de nouvelles données sur les prélèvements cliniques. Cependant, leur utilisation est couteuse et complexe et nécessite un personnel qualifié pour les mettre en œuvre. br Ce travail bibliographique a pour objectif d’inventorier ces nouvelles techniques de séquençages, de guider la mise en place de celles-ci dans un laboratoire de microbiologie clinique et d’aider à leur usage tant dans leurs indications que dans leur interprétation. Celui-ci servira de base au développement de l’usage du séquençage haut débit au laboratoire de microbiologie de l’Hôpital Charles Nicolle - CHU de Rouen.
2022
DUMAS - Dépôt Universitaire de Mémoires Après Soutenance
France
thèse ou mémoire
prothèses et implants
Microbiologie
Microbiologie
Technologie
Séquençages
Littérature
Microbiologie
littérature de revue comme sujet
implant
hôpitaux universitaires
techniques microbiologiques
analyse de séquence
Technologie
hôpitaux privés à but lucratif

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N3-AUTOINDEXEE
Diagnostic microbiologique des entérobactéries productrices de carbapénémases ou résistantes à la colistine renfermant le gène mcr-1
http://www.hcsp.fr/explore.cgi/avisrapportsdomaine?clefr=589
http://www.hcsp.fr/explore.cgi/avisrapportsdomaine?clefr=620
Le HCSP actualise, à la demande de la Direction générale de la santé, la définition des bactéries hautement résistantes émergentes (BHRe) ainsi que les modalités d’identification de la résistance de ces bactéries, tenant compte de l’évolution de l’épidémiologie. Le HCSP a diffusé le 27 septembre 2016 un premier avis relatif aux mesures à prendre par les établissements de santé, en lien avec l’émergence d’une résistance plasmidique à la colistine (mcr-1) chez les entérobactéries, en réponse à l’actualisation de la définition des BHRe. Le présent avis a pour objectif de répondre à la seconde question de la saisine concernant les modalités microbiologiques d’identification des souches d’entérobactéries résistantes à la colistine par présence du gène mcr-1. À l’occasion de la diffusion de cet avis, le HCSP actualise le chapitre « Dépistage et diagnostic microbiologique des entérobactéries productrices de carbapénémases » des recommandations pour la prévention de la transmission croisée des « Bactéries Hautement Résistantes émergentes (BHRe) » publié en 2013.
2016
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HCSP - Haut Conseil de la Santé Publique
France
français
information scientifique et technique
gène
enterobacteriaceae
résistant
rigidité diffuse
colistine
aucun diagnostic
gènes
diagnostic
colistine
Microbiologie
carbapénémase
microbiologie
protéines bactériennes
bêta-Lactamases

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25/04/2025


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