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Apport des technologies de séquençage haut débit en microbiologie clinique : revue
de la littérature et projet d’implantation au CHU de Rouen - CISMeF
Apport des technologies de séquençage haut débit en microbiologie clinique : revue
de la littérature et projet d’implantation au CHU de RouenDocument
Titre : Apport des technologies de séquençage haut débit en microbiologie clinique : revue
de la littérature et projet d’implantation au CHU de Rouen;
Description : Le diagnostic microbiologie est le prérequis indispensable à un traitement anti-infectieux
adapté. Les techniques de diagnostic microbiologiques sont encore grandement dépendantes
de méthodes, certes robustes, mais anciennes et qui atteignent leurs limites. Les
nouvelles méthodes de séquençages, dites « haut débit » ou NGS, permettent d’obtenir
de nouvelles données sur les prélèvements cliniques. Cependant, leur utilisation est
couteuse et complexe et nécessite un personnel qualifié pour les mettre en œuvre.
br Ce travail bibliographique a pour objectif d’inventorier ces nouvelles techniques
de séquençages, de guider la mise en place de celles-ci dans un laboratoire de microbiologie
clinique et d’aider à leur usage tant dans leurs indications que dans leur interprétation.
Celui-ci servira de base au développement de l’usage du séquençage haut débit au laboratoire
de microbiologie de l’Hôpital Charles Nicolle - CHU de Rouen.;
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