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À propos de la phylogénie moléculaire
https://interstices.info/a-propos-de-la-phylogenie-moleculaire/
Analyser les séquences biologiques pour reconstruire l'histoire de l'évolution des
gènes et des protéines, et à travers elle, celle des espèces, tel est le but de la
phylogénie moléculaire. C'est l'un des domaines les plus actifs de la bioinformatique.
Dans cet épisode du podcast audio, Olivier Gascuel dresse un panorama large de cette
discipline.
2023
)i( interstices
France
document sonore
proposant
approximatif
Phylogenèse
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N2-AUTOINDEXEE
Le SARS-CoV-2 : une expérience inédite de surveillance génomique mondiale
https://interstices.info/le-sars-cov-2-une-experience-inedite-de-surveillance-genomique-mondiale/
Depuis le début de la pandémie de SARS-CoV-2, la surveillance de l’évolution du génome
du virus avec son séquençage en continu est devenue un élément clé de santé publique.
En effet, le génome d’un virus est par nature très dynamique, avec une évolution qui
se manifeste par l’accumulation rapide de mutations. Disposer au fil du temps de nombreux
génomes d’origines géographiques variées est donc nécessaire pour identifier l’émergence
de variants, des lignées porteuses de mutations-clés susceptibles d’affecter la pathogénicité
et la transmissibilité du virus, voire de mener à un échappement vaccinal. Ce type
de surveillance a pu être expérimenté ces dernières années avec la grippe saisonnière,
les virus Ebola ou Zika, et a atteint une ampleur inédite avec le suivi du SARS-CoV-2.
Une telle tâche requiert des moyens de génération, d’analyse bioinformatique et de
partage des données particulièrement optimisés et ambitieux. Comment cela se passe-t-il
?
2023
)i( interstices
France
information scientifique et technique
SARS-CoV-2
génome
génomique
organisation et administration
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N3-AUTOINDEXEE
Les séquenceurs à haut débit
https://interstices.info/les-sequenceurs-a-haut-debit/
Depuis le milieu des années 2000, les séquenceurs à haut débit sont devenus un outil
indispensable à la recherche en biologie. Bientôt, ils serviront en médecine personnalisée.
Traiter les données de ces séquenceurs demande des compétences pluridisciplinaires
: connaissances biologiques, recherches théoriques en algorithmique du texte, ainsi
que des implémentations et technologies adaptées.
2023
)i( interstices
France
information patient et grand public
instabilité microsatellitaire élevée
Sortie
forme galénique à usage topique
voie topique
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N2-AUTOINDEXEE
Comprendre un processus cognitif grâce à l’analyse statistique du mouvement des yeux
https://interstices.info/comprendre-un-processus-cognitif-grace-a-lanalyse-statistique-du-mouvement-des-yeux/
Dans cet article, nous proposons une introduction à la statistique en tant que science
qui vise à analyser des données afin d’identifier des caractéristiques sous-jacentes
aux processus qui les ont produites. Pour illustrer notre propos, nous nous appuyons
sur l’exemple de l’analyse conjointe du mouvement des yeux et d’électroencéphalogrammes
(EEG) enregistrés lors d’expériences de lecture, afin d’en déduire différentes phases
cognitives. Ces phases sont mises en évidence par un modèle d’analyse de séquences
de mouvements oculaires. Une fois les phases identifiées, les données d’EEG permettent
de caractériser les connexions cérébrales spécifiques à chaque phase.
2021
)i( interstices
France
information patient et grand public
Statistiques
cognition
Statistique
cognition
mouvement
statistiques comme sujet
mouvement des yeux
mouvements oculaires
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N3-AUTOINDEXEE
À la recherche de régions codantes
https://interstices.info/a-la-recherche-de-regions-codantes/
Des centaines de génomes d'espèces vivantes, des bactéries aux gros mammifères, sont
aujourd'hui publiquement disponibles. Ces données représentent un véritable trésor
d'information et ouvrent la porte à de nombreuses et belles avancées en médecine,
en agronomie ou encore en écologie. Mais disposer d'un texte est une chose, l'interpréter
en est une autre. Heureusement, informaticiens et biologistes travaillent conjointement
à la conception d'algorithmes dédiés à l'analyse de ces milliards de lettres.
2019
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)i( interstices
France
information patient et grand public
article de périodique
recherche
Recherches
régional
Régions
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N3-AUTOINDEXEE
La simulation en radiologie interventionnelle
http://interstices.info/jcms/i_59481/la-simulation-en-radiologie-interventionnelle
2011
)i( interstices
information patient et grand public
simulation
radiologie interventionnelle
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N3-AUTOINDEXEE
Neuronavigation pour la stimulation magnétique transcranienne
http://interstices.info/neuronavigation
2008
)i( interstices
information scientifique et technique
stimulation magnétique transcrânienne
neuronavigation
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N3-AUTOINDEXEE
Stimulation électrique pour les patients paraplégiques et hémiplégique
http://interstices.info/stimulation-electrique
2008
)i( interstices
information patient et grand public
stimulation électrique
paraplégie
hémiplégie
patients
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N3-AUTOINDEXEE
L'air et le sang : les écoulements in vivo
https://interstices.info/lair-et-le-sang-les-ecoulements-in-vivo/
Pour expliquer les gênes respiratoires et prédire les ruptures d’anévrisme, la médecine
fait aujourd'hui appel à la mécanique des fluides. Système respiratoire Source : Theresa
Knott / Wikipédia Qui n’a jamais rêvé de voyager à l’intérieur du corps humain, d’observer
le mouvement de l’air dans les poumons ou encore de voir la poussée du sang gonfler
les artères au rythme des battements du cœur ? Désormais, grâce aux modélisations
informatiques, cela devient possible : elles représentent les organes, leur fonctionnement
mais aussi les fluides qui les parcourent ; elles aident au bilan diagnostique des
pathologies et au contrôle de l’efficacité des traitements.
2007
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)i( interstices
information scientifique et technique
sang
amélioration d'image radiographique
air
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N3-AUTOINDEXEE
Le coeur numérique
http://interstices.info/coeur-numerique
2007
)i( interstices
information scientifique et technique
coeur
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N3-AUTOINDEXEE
Simulation de l'opération de la cataracte
https://interstices.info/simulation-de-loperation-de-la-cataracte/
[Cet article est devenu obsolète, de par son contenu ou sa forme, il est donc archivé.]
2007
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information scientifique et technique
cataracte
procédures de chirurgie opératoire
cataracte
simulation
cataracte
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N3-AUTOINDEXEE
La neurochirurgie assistée par l'information et la connaissance
https://interstices.info/la-neurochirurgie-assistee-par-linformation-et-la-connaissance/
[Cet article est devenu obsolète, de par son contenu ou sa forme, il est donc archivé.]
2006
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)i( interstices
information scientifique et technique
neurochirurgie
Savoir
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N3-AUTOINDEXEE
Reconnaissance d'arythmies cardiaques
https://interstices.info/reconnaissance-darythmies-cardiaques/
Le cœur assure la vie : c'est lui qui alimente les différents organes du corps humain
en pompant le sang et en le refoulant dans le réseau des artères. Le battement est
dû à une onde électrique parcourant le cœur, qui à son passage provoque la contraction
des cellules musculaires cardiaques. Une arythmie correspond à une irrégularité du
parcours de cette onde résultant d'un dysfonctionnement cardiaque.
2006
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)i( interstices
information scientifique et technique
troubles du rythme cardiaque
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N3-AUTOINDEXEE
Fusion d'images : des outils au service des neurochirurgiens
https://interstices.info/fusion-dimages-des-outils-au-service-des-neurochirurgiens/
Opérer les lésions du cerveau est un des objectifs de la neurochirurgie. Une lésion
est pour le neurochirurgien une cible qu'il s'agit d'atteindre et d'enlever, tout
en préservant autant que possible les tissus fonctionnels. Or ces zones ne sont souvent
pas repérables à l'œil nu. L'imagerie peut alors apporter une aide avant et pendant
l'opération.
2006
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)i( interstices
information scientifique et technique
neurochirurgien
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N3-AUTOINDEXEE
Christian Barillot : ce que pourraient voir les chirurgiens pendant une intervention
http://interstices.info/christian-barillot
2005
)i( interstices
information scientifique et technique
christianisme
chirurgien (chirurgie générale)
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N3-AUTOINDEXEE
Simulation de chirurgie hépatique
https://interstices.info/simulation-de-chirurgie-hepatique/
L'objectif de la simulation chirurgicale est de fournir un entraînement hautement
réaliste, pour promouvoir la pratique d'interventions innovantes et moins invasives
tout en améliorant l'apprentissage du chirurgien.
2005
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)i( interstices
information scientifique et technique
chirurgie générale
simulation
Ranonculaceae
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N3-AUTOINDEXEE
Marc Thiriet : il simule les fluides de notre corps
http://interstices.info/marc-thiriet
2005
)i( interstices
information scientifique et technique
corps humain
simuliidae
simulation
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N3-AUTOINDEXEE
Recherche en marche
http://interstices.info/marche
2004
)i( interstices
information scientifique et technique
recherche
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N3-AUTOINDEXEE
Le traitement numérique des images médicales
https://interstices.info/le-traitement-numerique-des-images-medicales/
Cet exposé est une introduction didactique à la recherche sur l'analyse des images
médicales, la simulation chirurgicale et la robotique médicale. Introduction et remerciements.
Les images 3D du corps humain.Les images médicales. L’examen visuel. L’analyse des
images médicales. La salle d’opération du futur. Les classes de problèmes conclusion,
le passé et le futur
2004
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)i( interstices
information scientifique et technique
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N3-AUTOINDEXEE
Annelies Braffort : les promesses de l'informatique linguistique pour les sourds
http://interstices.info/annelies-braffort
2004
)i( interstices
information scientifique et technique
personnes malentendantes
informatique
linguistique
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