N3-AUTOINDEXEE Pseudo-éclosion de Mycobacterium tuberculosis due à une contamination croisée en
laboratoire : une investigation d’éclosion en épidémiologie moléculaire https://www.canada.ca/fr/sante-publique/services/rapports-publications/releve-maladies-transmissibles-canada-rmtc/numero-mensuel/2024-50/numero-12-decembre-2024/pseudo-eclosion-mycobacterium-tuberculosis-contamination-croisee-laboratoire.html Contexte : La culture mycobactérienne est effectuée de façon systématique pour diagnostiquer
la tuberculose (TB) au Canada. Mondialement, les méta-analyses suggèrent que jusqu’à
2 % des cultures positives de Mycobacterium tuberculosis sont des faux positifs en
raison d’événements de contamination croisée en laboratoire. Cinq patients provenant
d’institutions cliniques distinctes à Montréal ont été diagnostiqués avec une TB à
culture positive lorsque leurs échantillons cliniques ont été traités dans un laboratoire
centralisé de mycobactériologie. Une contamination croisée a été suspectée en raison
de la positivité de la culture chez un donneur d’organes ayant une faible probabilité
prétest de TB. Nous décrivons une pseudo-éclosion de TB due à une contamination croisée
en laboratoire et évaluons le rôle du typage conventionnel (i.e., génotypage par la
méthode des unités répétitives dispersées sur le génome mycobactérien – nombre variable
de répétions en tandem [MIRU-VNTR]) et du séquençage du génome entier (WGS) pour étayer
l’enquête. Méthodes : Les facteurs de risque épidémiologiques et les présentations
cliniques des patients ont été évalués. Les trajectoires des échantillons pré- et
per-analytiques ont été retracées afin d’identifier d’éventuels événements de contamination
croisée. Les isolats de TB ont été caractérisés par MIRU-VNTR et WGS à l’aide du séquençage
d’Oxford Nanopore Technologies (ONT). Le pipeline bioinformatique tbpore cluster (v0.7.1)
a été utilisé pour les analyses phylogénétiques. 2024 Gouvernement du Canada Canada article de périodique hybridation génétique dû à mycobacterium tuberculosis pseudo-tuberculose personnel de recherche mycobacterium tuberculosis hominis tuberculose épidémiologie moléculaire laboratoires
--- N1-VALIDE Unité INSERM 613 - génétique moléculaire et génétique épidémiologique http://www.genetic-brest.fr/ Le laboratoire génétique moléculaire et génétique épidémiologique de Brest (unité
613 INSERM), développe des thèmes de recherche pour comprendre les bases moléculaires
des maladies génétiques (mucoviscidose, hémochromatose, pancréatite chronique, retard
mental)... false N Brest France Finistère français biologie moléculaire épidémiologie moléculaire structure recherche