Libellé préféré : épidémiologie moléculaire;

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Pseudo-éclosion de Mycobacterium tuberculosis due à une contamination croisée en laboratoire : une investigation d’éclosion en épidémiologie moléculaire
https://www.canada.ca/fr/sante-publique/services/rapports-publications/releve-maladies-transmissibles-canada-rmtc/numero-mensuel/2024-50/numero-12-decembre-2024/pseudo-eclosion-mycobacterium-tuberculosis-contamination-croisee-laboratoire.html
Contexte : La culture mycobactérienne est effectuée de façon systématique pour diagnostiquer la tuberculose (TB) au Canada. Mondialement, les méta-analyses suggèrent que jusqu’à 2 % des cultures positives de Mycobacterium tuberculosis sont des faux positifs en raison d’événements de contamination croisée en laboratoire. Cinq patients provenant d’institutions cliniques distinctes à Montréal ont été diagnostiqués avec une TB à culture positive lorsque leurs échantillons cliniques ont été traités dans un laboratoire centralisé de mycobactériologie. Une contamination croisée a été suspectée en raison de la positivité de la culture chez un donneur d’organes ayant une faible probabilité prétest de TB. Nous décrivons une pseudo-éclosion de TB due à une contamination croisée en laboratoire et évaluons le rôle du typage conventionnel (i.e., génotypage par la méthode des unités répétitives dispersées sur le génome mycobactérien – nombre variable de répétions en tandem [MIRU-VNTR]) et du séquençage du génome entier (WGS) pour étayer l’enquête. Méthodes : Les facteurs de risque épidémiologiques et les présentations cliniques des patients ont été évalués. Les trajectoires des échantillons pré- et per-analytiques ont été retracées afin d’identifier d’éventuels événements de contamination croisée. Les isolats de TB ont été caractérisés par MIRU-VNTR et WGS à l’aide du séquençage d’Oxford Nanopore Technologies (ONT). Le pipeline bioinformatique tbpore cluster (v0.7.1) a été utilisé pour les analyses phylogénétiques.
2024
Gouvernement du Canada
Canada
article de périodique
hybridation génétique
dû à
mycobacterium tuberculosis
pseudo-tuberculose
personnel de recherche
mycobacterium tuberculosis hominis
tuberculose
épidémiologie moléculaire
laboratoires

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N1-VALIDE
Unité INSERM 613 - génétique moléculaire et génétique épidémiologique
http://www.genetic-brest.fr/
Le laboratoire génétique moléculaire et génétique épidémiologique de Brest (unité 613 INSERM), développe des thèmes de recherche pour comprendre les bases moléculaires des maladies génétiques (mucoviscidose, hémochromatose, pancréatite chronique, retard mental)...
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N
Brest
France
Finistère
français
biologie moléculaire
épidémiologie moléculaire
structure recherche

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23/06/2025


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