Description : Depuis le début de la pandémie de SARS-CoV-2, la surveillance de l’évolution du génome
du virus avec son séquençage en continu est devenue un élément clé de santé publique.
En effet, le génome d’un virus est par nature très dynamique, avec une évolution qui
se manifeste par l’accumulation rapide de mutations. Disposer au fil du temps de nombreux
génomes d’origines géographiques variées est donc nécessaire pour identifier l’émergence
de variants, des lignées porteuses de mutations-clés susceptibles d’affecter la pathogénicité
et la transmissibilité du virus, voire de mener à un échappement vaccinal. Ce type
de surveillance a pu être expérimenté ces dernières années avec la grippe saisonnière,
les virus Ebola ou Zika, et a atteint une ampleur inédite avec le suivi du SARS-CoV-2.
Une telle tâche requiert des moyens de génération, d’analyse bioinformatique et de
partage des données particulièrement optimisés et ambitieux. Comment cela se passe-t-il
?;
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