Description : Au cours de la dernière décennie, les données de séquençage génétique des agents pathogènes
ont gagné en importance et contribuent désormais de façon déterminante à la détection
et à la maîtrise des flambées de maladies infectieuses, en facilitant la mise au point
de produits de diagnostic, de médicaments et de vaccins et en guidant les activités
de riposte aux flambées. L’émergence du nouveau coronavirus, par la suite désigné
« coronavirus 2 du syndrome respiratoire aigu sévère » (SARS-CoV-2), a encore accentué
l’importance des données de séquençage génétique. Plus de 280 000 séquences du génome
complet ont été partagées dans des bases de données accessibles au public au cours
de l’année qui a suivi l’identification initiale du SARS-CoV-2. L’analyse de ces données
en temps quasi réel a eu une incidence directe sur la riposte de santé publique (12-16).
Les objectifs de santé publique du séquençage génomique du SARS-CoV-2 sont présentés
dans le Tableau 1.;
Pays