Article : « Comment faire ses premiers pas sur PubMed ? »

L’article de Phillipe Eveillard "Comment faire ses premiers pas sur PubMed ?" paru en avril dernier dans La Revue du praticien. Médecine générale est désormais accessible librement sur le site nephrohus :  http://www.nephrohus.org/s/spip.php?article398.

Une large place est donnée à la terminologie CISMeF. Petit bémol l’utilisation de l’accès aux ressources qui permet d’interroger PubMed à l’aide d’un terme MeSH et d’un ou plusieurs qualificatifs en français n’est pas abordée.  A essayer avec asthme par exemple.

Stratégies de recherche électroniques revues par les pairs

Je traduis (approximativement) les premières lignes d’introduction :

"La qualité des rapports d’évaluation des technologies de santé dépend de nombreux facteurs. L’un de ces facteurs est le socle de données probantes sur lequel repose l’évaluation. Ce socle est créé en réunissant l’information de nombreuses sources et en effectuant des recherches bibliographiques.[…] Aujourd’hui aucune revue de littérature n’existe pour nous dire quels éléments du processus de recherche ont le plus d’impact sur la qualité générale de l’ensemble des données probantes qui en résulte." 

Ce manque est en partie comblé par ce document en accès libre, en anglais : 

Sampson M, Mcgowan J, Lefebvre C, Moher D, Grimshaw J. PRESS: Peer Review of Electronic Search Strategies. Canadian Agency for Drugs and Technologies in Health; 2008. Available from: http://www.cadth.ca/index.php/en/publication/781.

MeSH bilingue 2008

La dernière version du MeSH traduit en français peut-être consultée sur le site de l’Inserm : http://ist.inserm.fr/basismesh/meshv08.html

Les principales modifications concernent principalement les intitulés des types de publications de MEDLINE.

Pour rappel, ces types de publications ne sont que partiellement utilisés par CISMeF qui utilise ses propres types de ressources.
Le passage au MeSH 2008 de la terminologie CISMeF est en cours.

Bibliométries

Pour ceux qui n’auraient pas vu ce commentaire, Thomson Scientific vient de répondre à la récente mise en cause des facteurs d’impact : http://scientific.thomson.com/citationimpactforum/8427045/

 A signaler également un nouvel outil, SCImago Journal & Country Rank (http://www.scimagojr.com/), qui offre de nombreuses statistiques par journaux, pays et disciplines, voir France et Médecine par exemple.

Lectures

– Après How Web 2.0 is changing medicine en décembre dernier, Dean Giustini, bibliothécaire à l’UBC (University of British Columbia) vient
d’écrire un nouvel éditorial pour le BMJ :
Web 3.0 and medicine.
La discussion sur cet article se poursuit sur le site du BMJ mais aussi sur les blogs, voir notamment le billet de David Rothman et sur le blog de Dean Giustini lui-même.

– Dans le Quotidien du médecin du 8 janvier : Du bon usage d’Internet dans le colloque singulier par Marie-Françoise De Pange (accessible après inscription).
On pourra poursuivre avec la lecture de ce rapport sur le site de l’Inserm :  WHIST Enquête web sur les habitudes de recherche d’informations liées à la santé sur Internet.

 

Etablir un lien pérenne vers un article [MàJ 16/04/08]

Les URLs des articles médicaux ont souvent une durée de vie assez limitée.

Pour être sûr que votre lien ne sera jamais en 404, vous pouvez utiliser les identifiants DOI pour obtenir des liens durables ayant cette allure : http://dx.doi.org/10.1136/bmj.39304.603762.DB.

Où les trouver ?

– Sur les sites des journaux eux-mêmes.

– Tous les articles de ScienceDirect proposent un lien de ce type (notamment pour les 45 derniers titres en  français ajoutés).

– Une manipulation sur PubMed permet également d’obtenir le DOI, il faut pour cela afficher les références au format MEDLINE ( Display >> MEDLINE). Le DOI est mentionné sur un grand nombre de titres.

Faute de DOI, vous pouvez utilisez le numéro identifiant de PubMed, le PMID, pour créer des liens stables vers PubMed sous cette forme : http://view.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/pmid. Pour cet exemple : http://view.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/17703024.

[Mise à jour 16/04/2008] La norme est maintenant : http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/pmid. Pour cet exemple http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/17703024.

http://www.nlm.nih.gov/pubs/techbull/ma08/ma08_simplified_web_links.html  

 
 

Bonne année aux lecteurs du blogue. 

GoPubMed met à jour les réseaux sociaux de Medline

GoPubMed est l’une des interfaces alternatives à PubMed les plus riches.

Ce service propose maintenant des fonctions de réseau social, en identifiant les principaux auteurs correspondant à votre requête. Le système est capable de distinguer les homonymes et de retracer plusieurs affiliations successives par analyse sémantique. Le formulaire de contact laisse aussi présager que les courriers électroniques des auteurs ont été retrouvés.

Voir le communiqué de presse en français.

2 exemples :

 

Via ScienceRoll

Les facteurs d’impact mis en question

Un éditorial du Journal of Cell Biology de décembre remet fortement en question la valeur des facteurs d’impact de Thomson scientific.

Leur conclusion :

"Just as scientists would not accept the findings in a scientific paper without seeing the primary data, so should they not rely on Thomson Scientific’s impact factor, which is based on hidden data."

Rossner M, Van Epps H, Hill E. Show me the data. J Cell Biol. 2007 December;179(6):1091-1092. Available from: http://dx.doi.org/10.1083/jcb.200711140

Via The Krafty Librarian 

Les titres Elsevier Masson accessibles via Science Direct en 2008

Ces 45 titres en langue française seront accessibles via ScienceDirect début 2008 :

Annales de Chirurgie Vasculaire
Annales de Dermatologie et de Vénéréologie
Annales de Pathologie
Annales d’Endocrinologie
Annales d’Otolaryngologie et de Chirurgie Cervico-faciale
Annales Pharmaceutiques Françaises
Antibiotiques
Archives des Maladies du Coeur et des Vaisseaux – Pratique
Archives des Maladies Professionnelles et de l’Environnement
Cahiers de Nutrition et de Diététique
Douleurs
Droit, Déontologie et Soin
Éthique & Santé
Feuillets de Radiologie
Gastroentérologie Clinique et Biologique
Imagerie de la Femme
International Orthodontics
Journal de Chirurgie
Journal de Gynécologie Obstétrique et Biologie de la Reproduction
Journal de Radiologie
Journal de Réadaptation Médicale
Journal de Thérapie Comportementale et Cognitive
Journal de Traumatologie du Sport
Journal des Maladies Vasculaires
Journal Européen des Urgences
Journal Français d’Ophtalmologie
Journal of Neuroradiology
La Presse Médicale
La Revue Sage-femme
Le Pharmacien Hospitalier
Le Praticien en Anesthésie Réanimation
L’Encéphale
Médecine des Maladies Métaboliques
Médecine Palliative
Morphologie
Motricité Cérébrale
Neurochirurgie
NPG Neurologie – Psychiatrie – Gériatrie
Progrès en Urologie
Revue de Chirurgie Orthopédique et Réparatrice de l’Appareil Moteur
Revue de Pneumologie Clinique
Revue de Stomatologie et de Chirurgie Maxillo-Faciale
Revue d’Epidémiologie et de Santé Publique
Revue des Maladies Respiratoires
Revue Neurologique

Le communiqué de presse

Via Prosper

Article : « The Availability of MeSH in Vendor-Supplied Cataloguing Records, as Seen Through the Catalogue of a Canadian Academic Health Library. »

Morgan PS.
The Availability of MeSH in Vendor-Supplied Cataloguing Records, as
Seen Through the Catalogue of a Canadian Academic Health Library.
Partnership: the Canadian Journal of Library and Information Practice
and Research. 2007;2(2).
http://journal.lib.uoguelph.ca/index.php/perj/article/view/335.

Un plus d’un tableau des pratiques d’indexation avec le MeSH au Canada, on y trouvera un bon argumentaire sur l’utilité du MeSH.

Article en anglais, accessible en texte intégral.