Description : En mars 2022, l’objectif du séquençage systématique des résultats de criblage C1D1
était de pouvoir identifier une potentielle co-infection Delta/Omicron. D’après les
résultats des enquêtes Flash, le variant Delta n’est plus détecté sur le territoire
national depuis S10. Cependant, des sous-lignages Omicron porteurs de mutations en
position L452 (L452R pour les sous-lignages BA.2.11, BA.4 et BA.5, L452Q pour le sous-lignage
BA.2.12.1), comme le variant Delta, ont émergé. Ainsi, les résultats de criblage C1D1
ne sont plus évocateurs de suspicion de co-infections Delta/Omicron mais en faveur
de sous-lignages d’Omicron.;