Quelques nouveaux articles repérés sur PubMed

4 parutions récentes (anglophones et en accès réservé) :

– Des urologues danois réfléchissent à des stratégies de veille sur Internet
http://pmid.us/17553371

– Des spécialistes de l’informatique médicale grecs mesurent la constance et la perennité des ressources Web
http://pmid.us/17572367

– Des infirmiers texans analysent qualitativement les groupes de soutien sur Internet dédiés au cancer
http://pmid.us/17573329

– Des chercheurs rennais (France) analysent la littérature scientifique en informatique médicale et en bioinformatique
http://pmid.us/17521073

Où consulter le MeSH ?

La réponse dépend bien sûr des besoins en termes d’information.
Voici, un tableau de différents outils de consultation (en ligne et gratuits) du thésaurus MeSH (Medical Subject headings). La liste n’est certainement pas exhaustive et ne rend pas compte de tous les aspects, notamment certaines particularités d’interrogation.
Les colonnes "opérateurs booléens" et "qualificatifs" servent à décrire la possibilité de construire des équations de recherche complexes pour interroger les bases de données.
Le nom des différents éditeurs apparait au survol des liens.

Serveur Terminologie

Autres terminologies

Langues

Liens vers BDD

Opérateurs booléens

Qualificatifs

Remarques

HONselect

 

FR ENG SPA GER POR

HON, PubMed, clinical trials

Non

?

 

MeSH bilingue français-anglais

 

FR ENG

Doc’CISMeF, PubMed

Non

Non

Traduction de l’Inserm

MeSH browser

 

ENG

Non

MeSH "officiel" Annotations pour les indexeurs

MeSH database

 

ENG

PubMed

Oui

Oui*

*tirés de MEDLINE et non des règles du MeSH

Term Finder
UMLS
ENG
NLM Gateway (23 bases)
Oui
Oui
Accès : cliquer sur "Term Finder" en haut à gauche de l’écran

Terminologie CISMeF

CISMeF

FR ENG

Doc’CISMeF PubMed

Non

Oui

options de recherche : pondération et types de ressources

TermSciences

PASCAL et FRANCIS,  INRA,  BDSP, Thesaulangue, Cemagref

FR ENG SPA GER

Google, BDSP, PubMed, Scirus, Google Scholar, Inist, in-extenso.org

Non*

Non

Navigation graphique

*Interrogation avancée : choix des synonymes (OU), ajout de termes en recherche libre (ET)

Virtual Health Library

DeCS

ENG POR SPA

LILACS, MEDLINE, Cochrane Library, SciELO, ADOLEC, BBO, BDENF , DESASTRES, HISA, HOMEOINDEX, LEYES, MEDCARIB, REPIDISCA, PAHO, WHOLIS

Oui

Oui

Construction "graphique" des équations, pas d’opérateur NOT
Voir aussi Global Health Libray

Article sur le Web sémantique : « Advancing translational research with the Semantic Web »

A lire ici : http://www.biomedcentral.com/1471-2105/8/S3/S2 

Ce nouvel article, aux 23 signatures impressionnantes, paru dans BMC Bioinformatics (accès libre) permet d’avoir une vue d’ensemble des avancées du Web sémantique dans le domaine biomédical et des activités du HCLSIG (The Semantic Web Health Care and Life Sciences Interest Group).

Le Web sémantique y est défini comme "une extension du Web actuel qui permet une navigation et une utilisation significative des ressources numériques par des procédés automatiques. ". Sa raison d’être est d’abattre les frontières de l’Information entre la Recherche et la pratique clinique ("translational research") et entre les domaines biomédicaux.

Parmi les nombreux travaux de ce groupe, les débuts de la représentation des recommandations de pratique clinique sous une forme structurée et lisible par les machines (une illustration ici).

HAS et recherche de RPC

La Haute autorité de santé consacre un passage à la recherche de recommandations pour la pratique clinique dans son dernier guide méthodologique :  Méthode et processus d’adaptation des recommandations pour la pratique clinique existantes.

Voir en page 16-17 : Recherche et sélection des RPC publiées et l’annexe 2 : Liste de sites Internet répertoriant des RPC
 

Google et la santé

La santé est manifestement très présente dans les préoccupations de la société américaine.

Pour se faire une opinion de leurs conceptions idéologiques dans ce domaine on peut consulter cette déclaration de Adam Bosworth, vice-président de Google :

Putting Health into the Patient’s Hands – Consumerism and Health Care
The 2007 American Medical Informatics Association (AMIA) Spring
Congress: “Informatics Across the Spectrum”, Orlando, Florida, May, 22,
2007

et ses messages sur le blog officiel de Google.

Pallier l’absence de quelques flux RSS

Après quelques réglages, voici quelques flux proposés par le site feed43 (sans garantie de fiabilité ni de pérennité) :

Afssaps : http://feed43.com/2157320145642776.xml (page d’origine)

AFSSA : http://feed43.com/0170246357684444.xml (page d’origine)

Afsset : http://feed43.com/3823740768340774.xml (page d’origine

HAS : http://feed43.com/0183256536332605.xml (page d’origine)

Institut National Du Cancer : http://feed43.com/2684435000331008.xml (page d’origine)

OFSP : http://feed43.com/2783815526440578.xml (page d’origine)

Pour en savoir plus sur le service feed43 : La chronique d’Oliver Obst dans le dernier numéro du Jeahil, JC | Blog et David Rothman.

L’interface de PubMed légérement améliorée

A cette adresse : http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez une nouvelle version de PubMed. Les changements touchent surtout les titres des pages de résultats ce qui devrait rendre la gestion des favoris et la navigation par onglets plus agréable.

Plus d’infos : http://www.nlm.nih.gov/pubs/techbull/mj07/mj07_pubmed_url.html et http://www.nlm.nih.gov/pubs/techbull/ma07/ma07_ncbi_new_titles.html 

Site intéressant : « www.pcel.info »

Un site à visiter : http://www.pcel.info/ (Primary Care Electronic Library)

Voici une traduction (approximative) de leur texte de présentation :

 "La bibliothèque électronique a indexé et classé plus d’un millier de sites Internet du domaine des soins primaires. La qualité de chaque site a été évalué pour que vous puissiez être sûr de chercher des ressources à jour et évaluées. Les ressources ont été classées en utilisant notre propre répertoire, le MeSH (Medical Subject Headings) et SNOMED CT (Systematized Nomenclature of Medicine). Les ressources peuvent également être cherchées et parcourues par ordre alphabétique ou numérique"

 A noter également leur certification HON, un forum, MyPCEL (?) et la diffusion de leurs nouveautés via RSS (évidemment !).

On peut retrouver leur publication sur cette page : http://www.pcel.info/index.php?fuse=home.about et suivre  les publications de Simon de Lusignan (Project lead) sur PubMed.