Description : Dans le contexte de l’évolution de la pandémie de la COVID-19, un groupe de travail
représenté par la SF2H, la SFM et le réseau de virologie de l’ANRS-MIE s’est réuni
le 24/05/2023 afin de redéfinir les indications du séquençage des génomes du SARS-CoV-2
et des autres virus respiratoires (dont grippe et virus respiratoire syncytial (VRS))
à visée médicale. Le séquençage réalisé dans le cadre de la surveillance de l’évolution
des virus ne sera pas abordé. Ces recommandations font suite à une demande de différents
acteurs nationaux (laboratoires hospitaliers/ autorités de santé) de préciser ces
indications dans un contexte général de sortie de crise. La pandémie de COVID-19 a
permis de démocratiser le séquençage du SARS-CoV-2 et d’en apprécier les apports pour
la prise en charge des patients. Ces données sont applicables à d’autres virus responsables
d’infections respiratoires parfois sévères (notamment les virus de la grippe et le
VRS).;
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