Mois : juin 2009

PubMed, mettre à profit les filtres de recherche personnalisés

Depuis fin mai, le service My NCBI associé à PubMed (gratuit sur inscription) permet de créer des filtres de recherche personnalisés. Ces filtres permettent d’avoir accès très rapidement à des requêtes usuelles qu’on pourra croiser en 1 clic avec la requête en cours. Voir cette page pour les détails (en anglais) : http://www.nlm.nih.gov/pubs/techbull/mj09/mj09_pm_myncbi_collections.html.


Dans cet exemple, la requête "loattrfree full text"[sb] AND French[lang] correspond à la fraction d’articles en français et en accès libre.

Pour créer des filtres correspondant aux spécialités médicales, on peut utiliser cette page : http://doccismef.chu-rouen.fr/liste_des_meta_termes_anglais.html

Une fois la requête lancée vers PubMed, il faudra consulter l’onglet "Details" et copier l’intégralité du texte de l’équation de recherche.

 

Puis coller le texte de cette équation, au sein d’un nouveau filtre de recherche.

 

Une fois activé, l’onglet correspondant apparaîtra au-dessus des résultats de recherche.

 

Dans cet exemple, le filtre permet de cibler les 20% de résultats consacrés à la cancérologie.

Comparaison CISMeF / Delicious au EAHIL Workshop 2009

Le dernier séminaire de l’association EAHIL s’est déroulé à Dublin du 2 au 5 juin dernier.
Une étude, réalisée par Valérie Durieux, doctorante à l’Université Libre de Bruxelles, en partenariat avec notre équipe, y a été présentée.
Il s’agit d’une comparaison de CISMeF et du site de Partage Delicious mettant à profit la mashup déjà présentée sur ce blog http://www.cismef.org/blog/?p=170.

[Mise à jour 27/08/2009]  Les actes sont disponibles : http://www.eahil2009.ie/scientific-programme/109-papers.html  et l’article complet est disponible à cette adresse : http://www.eahil2009.ie/images/Eahil/Images/papers/fri8/durieux_paper.pdf

Changements de PubMed

[Mise à jour du 15/06/2009] :

Les changements mentionnés dans cet article ainsi qu’un aperçu du futur design de PubMed peuvent être retrouvés en vidéo à cette adresse :

http://www.nlm.nih.gov/pubs/techbull/mj09/video/pubmed/pubmed.html

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Liste des changements de PubMed récents ou à venir.

La recherche avancée http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/advanced va devenir l’unique page pour des recherches élaborées au sein de PubMed.
Ce qui entraine logiquement la réorganisation d’autres services :

– Disparition du Single Citation Matcher http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/utils/fref.fcgi?/corehtml/query/static/citmatch.html

– Disparition des onglets Limits, Preview/Index, History, Clipboard, Details

Parmi les changements déjà effectués, on peut citer :

 

– Un changement d’ordre graphique. C’est désormais le titre des articles qui est mis en avant plutôt que les auteurs. L’icône indiquant les articles gratuits a été remplacé par une mention écrite.

 

 
La même référence, ancienne et nouvelle version

 

– De nombreuses informations complémentaires à la simple liste des résultats sont affichées :

En cas de recherche à partir d’un nom de gène des liens vers la base de données Entrez Gene sont proposés.
La colonne de droite accueillent des suggestions de recherche (plus ou moins pertinentes), des liens vers PubMed Clinical Q&A et l’historique des recherches.

 


Note : Ce billet reprend une grande partie du billet Changes to PubMed SOON du blog The Krafty Librarian.