Catégorie : Internet médical

OReFiL (Online Resource Finder for Lifesciences), une nouvelle exploitation fructueuse de MEDLINE

On mesure fréquemment la compétence d’un auteur à ses publications. Pourquoi ne pas étendre ce principe aux sites web ? C’est cette idée que des chercheurs de l’université de Tokyo ont développé pour proposer OReFiL (Online Resource Finder for Lifesciences http://orefil.dbcls.jp/).

Il s’agit d’une base de données des sites Internet et autres ressources en ligne cités dans MEDLINE et donc associés à, au moins, une publication scientifique.

Un exemple de recherche (un "nuage" de termes MeSH associés précède les résultats) :

 

L’article qui présente cet outil et la façon dont plus de 7000 URLs ont été extraites de MEDLINE est disponible en suivant ce lien : OReFiL: an online resource finder for life sciences (accès libre).

Via The Krafty Librarian

Face-à-face PubMed/Highwire Press

PubMed vs. HighWire Press: A head-to-head comparison of two medical literature search engines.
Computers in Biology and Medicine, Volume 37, Issue 9, Pages 1252-1258
T. Vanhecke, M. Barnes, J. Zimmerman, S. Shoichet

Traduction du résumé :

PubMed et HighWire Press sont tous deux des moteurs de recherche en littérature médicale disponibles gratuitement pour tous sur Internet. Nous avons mesuré la précision des réponses, le nombre de résultats, la vitesse de réponse, les fonctionnalités et les outils de recherche sur HighWire Press et PubMed en utilisant leur fonction de recherche rapide. Nous avons trouvé que l’utilisation de Highwire Press aboutissait à une probabilité plus grande de trouver l’article désiré et à un nombre plus élevé de résultats que la même recherche sur PubMed. PubMed a été plus rapide que Highwire Press à fournir les résultats quelque soient les paramètres de recherche. Il y a des différences considérables en termes de fonctionnalités de recherche entre ces deux moteurs.

Suivre l’actualité technologique internationale en médecine

Le site bulletins-electroniques.com réalisé par l’ADIT et le ministère des affaires étrangères propose une page dédiée à la médecine :

http://www.bulletins-electroniques.com/actualites/tags/medecine.php (et le flux RSS correspondant).

Ces actualités sont fournies par les Services pour la Science et la Technologie des Ambassades de France à l’étranger. Elles proviennent de 30 pays. Pour la seule journée du 26/07, pas moins de 15 nouvelles !

Suivre l’actualité de la Myologie

L’institut de Myologie (récemment indexé dans CISMeF) propose une rubrique Actualités dont la qualité mérite d’être soulignée.
Ces actualités proviennent de différentes sources et notamment de publications scientifiques. Plus d’une dizaine d’articles sont présentées chaque mois sous la forme d’un résumé didactique en français (avec un lien vers PubMed le cas échéant).
On peut consulter ces actualités sur le site par ordre chronologique, les explorer à l’aide d’un moteur de recherche, s’y abonner grâce à la Newsletter ou grâce aux flux RSS du site. Peut-on faire plus complet ?

Les groupes de discussion professionnels sont-ils des sources fiables ?

Dans son numéro de Juillet, The Journal of Pediatrics évalue un groupe de discussion professionnelle en néphrologie pédiatrique :
Who provides physicians with advice over the internet? A study of a pediatric subspecialty discussion group.

Conclusion : Les intervenants les plus actifs sont loin d’être les plus qualifiés aussi bien en termes de publications que de diplômes.

Veille 100% RSS, sources plus ou moins médicales

Voici un panorama d’outils de recherche gratuits (sans prétention d’exhaustivité) proposant leurs résultats sous forme de flux RSS. Pour réunir en une seule démarche Recherche documentaire et Veille.

Recherche bibliographique :  

PubMed
ou encore les "alternatifs" HubMed et PubMed Reader

SAPHIR
base de données du réseau SAPHIR [Swiss Automated Public Health Information Resources] 

Essais cliniques :

ClinicalTrialsFeeds.org
Les essais du site http://clinicaltrials.gov/ sous forme de flux.

[MàJ 16/11/2007] ClinicalTrials.gov propose désormais directement les résultats sous forme de flux.

Evidence Based Medicine :

http://www.tripdatabase.com/
Moteur de recherche en EBM, très nombreuses sources interrogées. Voir leur page "About Us"

Actualités médicales :  

Medworm
Recherche au sein de plus de 4000 flux médicaux anglophones

CISMeF actualités
Recherche parmi les flux d’une centaine de sites francophones

Autres :

Google Actualités, Yahoo Actualités ou Live Actualités
Permettent d’interroger une partie de la Presse accessible sur le web

Wikio
Recherche au sein d’une partie de la Presse et d’une sélection de blogs

Technorati, Bloglines ou Google Recherche de blogs
Recherche au sein des blogs

Live
Le moteur de recherche généraliste de Microsoft
Pour trier les résultats par date,  ajouter {frsh=100} à vos termes de recherche ou utiliser les options avancées.

On peut bien sûr utiliser ces flux dans son agrégateur personnel, on peut également les mettre à profit sur son site. Deux exemples :

L’Institut Gustave Roussy met en ligne sur son site une revue de presse issue de Google Actualités : http://www.igr.fr/?p_id=4

L’association de patients Rare-Cancer met en ligne des nouvelles issues de PubMed, Google, Clinical trials et Medlinx : http://news.rare-cancer.org/

Quelques nouveaux articles repérés sur PubMed

4 parutions récentes (anglophones et en accès réservé) :

– Des urologues danois réfléchissent à des stratégies de veille sur Internet
http://pmid.us/17553371

– Des spécialistes de l’informatique médicale grecs mesurent la constance et la perennité des ressources Web
http://pmid.us/17572367

– Des infirmiers texans analysent qualitativement les groupes de soutien sur Internet dédiés au cancer
http://pmid.us/17573329

– Des chercheurs rennais (France) analysent la littérature scientifique en informatique médicale et en bioinformatique
http://pmid.us/17521073

Article sur le Web sémantique : « Advancing translational research with the Semantic Web »

A lire ici : http://www.biomedcentral.com/1471-2105/8/S3/S2 

Ce nouvel article, aux 23 signatures impressionnantes, paru dans BMC Bioinformatics (accès libre) permet d’avoir une vue d’ensemble des avancées du Web sémantique dans le domaine biomédical et des activités du HCLSIG (The Semantic Web Health Care and Life Sciences Interest Group).

Le Web sémantique y est défini comme "une extension du Web actuel qui permet une navigation et une utilisation significative des ressources numériques par des procédés automatiques. ". Sa raison d’être est d’abattre les frontières de l’Information entre la Recherche et la pratique clinique ("translational research") et entre les domaines biomédicaux.

Parmi les nombreux travaux de ce groupe, les débuts de la représentation des recommandations de pratique clinique sous une forme structurée et lisible par les machines (une illustration ici).