L'endoscopie bronchique ne se justifie, chez les nourrissons siffleurs, qu'en cas de symptomatologie sévère. L'endoscopie a donc des indications cliniques. Au cours de l'endoscopie, la réalisation d'un lavage bronchoalvéolaire est justifiée, en particulier pour rechercher des agents infectieux. Sur le liquide de lavage restant, il est logique de conduire des recherches sur les cellules et médiateurs de l'inflammation. Il a ainsi pu être montré que les macrophages des nourrissons siffleurs étaient activés, libérant des métabolites de l'acide arachidonique. Il existe également chez les nourrissons siffleurs, une augmentation des neutrophiles recueillis dans liquide de lavage, ce qui suggère que les polynucléaires neutrophiles exercent un rôle pathogène qu'il faudra explorer. L'idéal serait de recourir à des méthodes peu ou pas invasives encore difficiles à utiliser chez le nourrisson : expectoration induite, NO expiré.