L'étude des barrières génétiques entre différentes espèces équivaut à demander comment ces espèces deviennent génétiquement isolées. La barrière génétique entre Salmonella typhimurium et Escherichia coli est essentiellement une barrière à la recombinaison. La composante structurale de cette barrière est la divergence de leur ADN génomique. Le système de réparation des mésappariements (SRM) agit comme un inhibiteur de la recombinaison interspécifique alors que le système SOS agit comme un régulateur positif inductible. Ces deux systèmes génétiques contrôlent également la stabilité génomique. En général, le SRM maintient la stabilité du génome alors que la réponse SOS augmente la variabilité génétique. Ces activités opposées permettent au SRM et au SOS de contrôler à la fois la vitesse d'accumulation du polymorphisme de l'ADN et le degré d'isolement génétique qui sont deux composantes clés de la spéciation. Des résultats récents suggèrent que ces paradigmes bactériens peuvent s'étendre à certains eucaryotes.