Les tumeurs gynécologiques rassemblent un groupe hétérogène de lésions. Chaque organe du tractus génital féminin présente une pathologie tumorale avec une oncogenèse distincte. Nous rapportons ici les nouvelles avancées dans le domaine de la biologie moléculaire et de l'histogenèse des tumeurs épithéliales et des cordons sexuels de l'ovaire et des tumeurs épithéliales et mésenchymateuses utérines. Ces nouvelles découvertes scientifiques ont permis la mise en place de biomarqueurs tels que les marqueurs immunohistochimiques et tests moléculaires, qui apportent une aide considérable aux pathologistes dans leur pratique au quotidien. Ils permettent le diagnostic des différents sous-types histologiques de tumeurs gynécologiques en complément de l'examen morphologique au microscope. Enfin, ces nouveaux biomarqueurs ouvrent la voie à la mise en place de nouvelles thérapies ciblées dans un futur proche.