Grâce aux techniques de biologie moleculaire a haut debit (comme T analyse du profil d'expression en microarray, de l'ADN en CGH, et les méthodes de séquençage de l'ensemble du génome permettant l'analyse des mutations), il est désormais possible de caractériser le génome tumoral entier. Actuellement, aucune signature prognostique/prédictive générée sur un grand nombre de tumeurs et suffisamment validée n'est utilisable en routine dans le cancer colorectal (CRC). Un des obstacles est le manque de standardisation des méthodes et la faible concordance des différentes signatures publiées. Récemment, le score Oncotype DX^® basé sur l'expression de 13 gènes en RT-PCR au sein de prélèvements tumoraux fixés en paraffine est apparu comme prometteur en tant que marqueur pronostique des CCR de stade II. Dans un futur proche, seuls des essais de phase II ou III randomisés intégrant des signatures pronostiques/prédictives reproductibles permettront de valider l'intérêt clinique de ces marqueurs moléculaires et de les intégrer dans la prise en charge quotidienne des patients.