La kératite amibienne stromale est une affection rare mais grave qui peut entraîner des séquelles visuelles irréversibles. Son incidence a augmenté régulièrement depuis 1970 parallèlement au nombre croissant de porteurs de lentilles de contact. L'infection est liée à un mauvais entretien ou une utilisation inappropriée des lentilles de contact. De symptomatologie peu spécifique, le diagnostic est souvent posé tardivement retardant d'autant la mise sous traitement. La prise en charge repose sur l'association d'au moins deux collyres amoebicides. Parmi ceux-ci, peu sont commercialisés en France nécessitant le recours à la procédure d'obtention par ATU nominative ou la réalisation de préparations magistrales ou hospitalières par les PUI. C'est dans ce cadre qu'interviennent les pharmaciens. Le pharmacien d'officine a un rôle de conseil vis-à-vis des porteurs de lentilles de contact et d'orientation des patients se présentant pour un problème oculaire. Le pharmacien hospitalier doit vérifier l'adéquation de la prescription à la pathologie et fournir au patient les traitements qui ont un statut particulier. Officinaux et hospitaliers ont enfin un rôle important à jouer dans l'observance du traitement.