L'IRM est l'examen le plus performant dans la démarche diagnostique de la sclérose en plaques. Son utilisation systématique dans le suivi des patients est réservée au domaine de la recherche clinique. » L'IRM conventionnelle, couplée à des logiciels de traitement de l'image, permet d'obtenir des mesures automatisées de la charge lésionnelle et de l'atrophie cérébrale dans le domaine de la recherche clinique.» L'évolution de la charge lésionnelle et de l'atrophie cérébrale au cours des premières années de la maladie est corrélée au handicap physique, à l'altération cognitive et à la qualité de vie des patients à moyen et long terme. » Certains travaux ont suggéré que l'évolution de l'IRM au cours de la première année suivant l'introduction d'un traitement immunomodulateur était un facteur prédictif de la réponse au traitement.