Les infections chroniques, virales ou bactériennes, sont fréquentes chez les patients atteints de bronchopneumopathie chronique obstructive. L'infection virale latente, principalement représentée par le virus respiratoire syncitial et l'adénovirus, semble être présente chez un grand nombre de patients atteints de bronchopneumopathies chroniques obstructives stables. De nombreux travaux semblent montrer un effet pro-inflammatoire, systémique et endobronchique, de cette infection virale, notamment en association avec la fumée de cigarette ou la pollution. La colonisation bactérienne, principalement représentée par l'Haemophilus influenzae, est présente chez plus du tiers des patients atteints de bronchopneumopathies chroniques obstructives stables. Les patients colonisés présentent une inflammation endobronchique et un déclin de leur fonction respiratoire plus élevés que les patients non colonisés. Ces infections chroniques jouent probablement un rôle dans l'aggravation de leur maladie en maintenant une inflammation endobronchique persistante et favorisant les exacerbations de leur maladie.