La prescription des antidépresseurs n'est légitime que chez les patients déprimés répondant aux critères d'un état dépressif majeur, c'est-à-dire avéré. Cette prescription doit rester la plus simple possible, et les associations médicamenteuses ne doivent pas être systématiques, quels que soient les médicaments utilisés. Les doses optimales doivent être atteintes rapidement mais l'efficacité thérapeutique ne se fait sentir qu'en 2 à 4 semaines, pour atteindre son maximum en 6 à 8 semaines. La plupart des antidépresseurs possédant une activité thérapeutique voisine, le choix se fait en fonction de leur tolérance, du terrain et des résultats obtenus lors de traitements antérieurs. La prescription d'un antidépresseur demande une surveillance attentive et des visites répétées au cours des premières semaines de traitement. La durée recommandée pour le traitement d'un état dépressif majeur est de 6 mois, l'arrêt du traitement devant être progressif pour éviter l'apparition de symptômes liés à l'arrêt du médicament.