Le génome de la plupart des virus est capable d'évoluer très rapidement conférant à ces microorganismes la propriété de s'adapter très vite à des environnements divers et inconstants. Ceci permet aussi aux virus de s'adapter à des espèces pour lesquelles ils n'étaient pas normalement pathogènes provoquant ainsi des maladies émergentes. Notre laboratoire s'intéresse à cet aspect moderne de l'épidémiologie en suivant à l'échelon moléculaire les variations de séquences qui se produisent dans le génome de plusieurs groupes viraux apparentés infectant l'homme et les animaux. Nous présenterons ici l'analyse historique documentée de quelques cas où la barrière d'espèce a été spontanément et naturellement transgressée. Nous rapporterons aussi quatre exemples de virus responsables de zoonoses avérées ou potentielles étudiées dans notre laboratoire et concernant : le virus Borna, le virus de l'Hépatite E, le virus de l'encéphalomyocardite et les coronavirus.