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Génomique somatique et pronostic des cancers colorectaux. Discussion

Auteurs : BARRIER A1, BOELLE P2, JAECK M, BATTIN M, LEMOINE A3, FLAHAULT A2, DUDOIT S4, HUGUIER M1, ARDAILLOU M, GODEAU M, LE GALL M, JEANTEUR M1
Affiliations : 1Service de chirurgie digestive, hôpital Tenon, Paris. Université P et M Curie. 4 rue de la Chine, 75020, Paris, France2INSERM (U707). Épidémiologie. Systèmes d'information et modélisation Université P et M Curie, Paris, France3INSERM (U602). Micro-environnement et physiopathologie de la différenciation. Université Paris XI, Villejuif, France
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Date 2007, Vol 191, Num 6, pp 1091-1103Revue : Bulletin de l'Académie nationale de médecine
Résumé

Dans les cancers coliques sans métastase ganglionnaire, l'identification de nouveaux facteurs pronostiques permettrait de mieux adapter les indications d'une chimiothérapie adjuvante. Le but de ce travail était d'étudier les possibilités offertes dans ce sens par la génomique. Cinquante tissus tumoraux cryo-conservés de malades opérés depuis plus de cinq ans ont été étudiés. Vingt-cinq malades ont développé une récidive métastatique et 25 sont restés sans récidive. Des échantillons d'acide ribonucléique ont été extraits et hybridés sur des puces à oligonucléotides. Mille six cents divisions aléatoires des 50 malades, en groupes d'entraînement et de validation, ont été considérées. Pour chacune de ces divisions, un indicateur pronostique a été construit à partir du groupe d'entraînement (sélection des 30 gènes les plus différemment exprimés chez les malades ayant ou non récidivé, analyse linéaire discriminante), puis ses performances prédictives ont été évaluées sur le groupe de validation. Les performances observées pour l'ensemble des indicateurs pronostiques étaient de 76 % pour l'exactitude, de 85 % pour la sensibilité, et de 68 % pour la spécificité. Un total de 6 124 gènes ont été sélectionnés dans au moins un des 1 600 prédicteurs et 55 gènes ont été sélectionnés plus de cent fois. Les résultats de cette étude suggèrent principalement la possibilité de prédire le pronostic des cancers coliques sans métastase ganglionnaire par une approche de génomique fonctionnelle. Ils suggèrent également la grande variabilité, en terme de composition, des indicateurs pouvant être proposés.

Mot-clés auteurs
Cancer colorectal; Cancer du côlon; Expression génique; Gène; Génomique; Génétique; Homme; Pronostic;
 Source : PASCAL/FRANCIS INIST
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BARRIER A, BOELLE P, JAECK M, BATTIN M, LEMOINE A, FLAHAULT A, DUDOIT S, HUGUIER M, ARDAILLOU M, GODEAU M, LE GALL M, JEANTEUR M. Génomique somatique et pronostic des cancers colorectaux. Discussion. Bull. Acad. Natl. Med.. 2007;191(6):1091-1103.
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Dernière date de mise à jour : 23/08/2017.


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