Objectifs. Décrire l'écosystème buccal et évaluer le lien entre ses maladies infectieuses et la flore microbiologique orale. La cavité buccale est le siège d'un écosystème très complexe. Elle abrite des micro-organismes divers qui constituent une entité structurale spécifique : le biofilm buccal. La bouche peut être le siège de pathologies infectieuses dont la prise en charge nécessite une connaissance de sa physiopathologie. Résultats. La distribution des bactéries dans l'écosystème buccal est tributaire de certains facteurs appelés déterminants écologiques qui sont : anatomo-histologiques (substrat dur : dent ; substrat mou : muqueuse buccale), physico-chimiques (température, potentiel redox, pH, gaz dissous...) ou nutritionnels. Nous distinguons essentiellement une flore supra-gingivale (Streptococcus sobrinus, S. mutans, S. sanguis, S. mitis, S. salivarius, Lactobacillus sp., Actinomyces sp., A. viscosus) et une flore sous-gingivale étroitement liée à la supra-gingivale composée majoritairement de micro-organismes à Gram négatif anaérobies stricts (Porphyromonas gingivalis, Prevotella intermedia, Fusobacterium nucleatum, Campylobacter rectus...). Risques infectieux et pathologie bucco-dentaire. Cet ensemble constitue une flore orale évoluant dans un état d'équilibre interrelationnel. La rupture de cet équilibre sera caractérisée par une modification de la croissance de certaines souches, la disparition de certaines espèces mais aussi l'apparition des métabolites qui seront à l'origine de processus infectieux à point de départ local. Les bactéries de la flore supra-gingivale seront à l'origine de la déminéralisation acide des tissus durs dentaires, tandis que la flore sous-gingivale engendrera des maladies parodontales. Au cours de ces dernières années, il est apparu un concept de spécificité de la maladie parodontale : chaque type de parodontopathie présente une flore sous-gingivale constituée d'une association de micro-organismes qui lui est propre. En conclusion, la carie dentaire et les maladies parodontales sont des pathologies buccodentaires infectieuses issues d'activés bactériennes d'un écosystème buccal déséquilibré. Traitement. L'efficience d'un traitement anti-infectieux devrait prendre en compte cette nouvelle cartographie microbiologique.