Visibilité nationale des tumorothèques et cadre d'interopérabilité. 1. Principes généraux et critères standard de description des échantillons cryopréservés
Auteurs : COPIN M1, BIBEAU F2, DURAND T3, HOFMAN P4, MECHINE-NEUVILLE A5, REYRAT E6, TURLIN B7, LEROY K8Les projets de recherche, intégrant l'utilisation d'échantillons biologiques cryopréservés, nécessitent la mise à disposition, par les tumorothèques, d'annotations biologiques, anatomopathologiques et cliniques dynamiques qui correspondent à des informations structurées. La gestion des échantillons et de leurs annotations à l'échelle d'une tumorothèque nécessite la mise en place d'un système d'information performant pouvant correspondre, selon les cas, à une base de données unique ou à plusieurs bases communicantes. L'objectif de ce système est d'accéder, le plus simplement et rapidement possible, à la totalité des informations caractérisant un échantillon. La nécessité de mettre en oeuvre des projets multicentriques d'une part et l'existence de tumeurs rares d'autre part, amènent à proposer un concept de tumorothèque nationale virtuelle, reliée aux tumorothèques locales par un système d'information permettant une connaissance à jour des ressources biologiques disponibles à l'échelon national. Le groupe « Projet de mise en réseau informatisé des banques hospitalières de cellules et tissus tumoraux cryopréservés », mis en place par la Direction de l'hospitalisation et de l'organisation des soins a retenu une liste d'informations, une quarantaine au total, correspondant à des critères minimaux de description des échantillons cryopréservés, qui constituent la base d'un catalogue national informatisé. Cette liste a été complétée par le groupe de travail intercancéropôles sur les conditions d'interopérabilité des tumorothèques, mis en place par l'Institut national du cancer (INCa). L'INCa reconnaît la valeur d'expertise qui a permis de constituer ce catalogue national de données pour la réalisation de la tumorothèque virtuelle nationale et en entérine l'usage. Ce catalogue sera testé et adapté à travers des programmes nationaux d'excellence spécialisée « poumon » et « rein ».