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Visibilité nationale des tumorothèques et cadre d'interopérabilité. 1. Principes généraux et critères standard de description des échantillons cryopréservés

Auteurs : COPIN M1, BIBEAU F2, DURAND T3, HOFMAN P4, MECHINE-NEUVILLE A5, REYRAT E6, TURLIN B7, LEROY K8
Affiliations : 1Service d'anatomie pathologique, Pôle biologie-pathologie, Site Eurasanté, avenue Oscar-Lambret, CHRU, 59037 Lille, France2Service d'anatomie pathologique, CLCC Montpellier, France3Direction d'information hospitalière, Centre Léon Bérard, Lyon, France
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Date 2006, Vol 93Revue : Bulletin du cancer
Résumé

Les projets de recherche, intégrant l'utilisation d'échantillons biologiques cryopréservés, nécessitent la mise à disposition, par les tumorothèques, d'annotations biologiques, anatomopathologiques et cliniques dynamiques qui correspondent à des informations structurées. La gestion des échantillons et de leurs annotations à l'échelle d'une tumorothèque nécessite la mise en place d'un système d'information performant pouvant correspondre, selon les cas, à une base de données unique ou à plusieurs bases communicantes. L'objectif de ce système est d'accéder, le plus simplement et rapidement possible, à la totalité des informations caractérisant un échantillon. La nécessité de mettre en oeuvre des projets multicentriques d'une part et l'existence de tumeurs rares d'autre part, amènent à proposer un concept de tumorothèque nationale virtuelle, reliée aux tumorothèques locales par un système d'information permettant une connaissance à jour des ressources biologiques disponibles à l'échelon national. Le groupe « Projet de mise en réseau informatisé des banques hospitalières de cellules et tissus tumoraux cryopréservés », mis en place par la Direction de l'hospitalisation et de l'organisation des soins a retenu une liste d'informations, une quarantaine au total, correspondant à des critères minimaux de description des échantillons cryopréservés, qui constituent la base d'un catalogue national informatisé. Cette liste a été complétée par le groupe de travail intercancéropôles sur les conditions d'interopérabilité des tumorothèques, mis en place par l'Institut national du cancer (INCa). L'INCa reconnaît la valeur d'expertise qui a permis de constituer ce catalogue national de données pour la réalisation de la tumorothèque virtuelle nationale et en entérine l'usage. Ce catalogue sera testé et adapté à travers des programmes nationaux d'excellence spécialisée « poumon » et « rein ».

Mot-clés auteurs
Article synthèse; Banque tissu; Cancérologie; Catalogue; Centralisation; Cryoconservation; Homme; Information; Réseau; Tumeur maligne;
 Source : PASCAL/FRANCIS INIST
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COPIN M, BIBEAU F, DURAND T, HOFMAN P, MECHINE-NEUVILLE A, REYRAT E, TURLIN B, LEROY K. Visibilité nationale des tumorothèques et cadre d'interopérabilité. 1. Principes généraux et critères standard de description des échantillons cryopréservés. Bull Cancer. 2006;93.
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Dernière date de mise à jour : 22/08/2017.


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