L'helicobacter pylori, qui réside habituellement dans l'estomac, est incriminé dans des pathologies gastriques assez sévères. Sa transmission demeure incertaine bien que plusieurs modes aient été avancés. La cavité buccale peut représenter un réservoir secondaire permanent ou transitoire de cette bactérie. Les études montrent des résultats variables et difficilement comparables. Cette présence serait lourde de conséquences : réinfection gastrique, ulcérations aphteuses récidivantes et risque professionnel. L'éradication de ce germe au niveau buccal passe par des mesures d'hygiène orale et des soins parodontaux habituels, puisque le biofilm buccal pourrait représenter un sanctuaire pour l'hélicobacter pylori lui permettant de résister à l'antibiothérapie.