Les onychomycoses à levures ou à moisissures sont de diagnostic difficile, car ces champignons font partie de notre flore saprophyte et leur présence en culture est fréquente et bien souvent sans lien avec l'onyxis. La certitude diagnostique repose avant tout sur un prélèvement mycologique réalisé dans de bonnes conditions. L'interprétation des résultats nécessite de confronter systématiquement l'aspect clinique des lésions avec à la fois l'examen direct et la culture. Cette rigueur limite le diagnostic par excès d'onychomycose à levure ou à moisissure.