Les hépadnavirus peuvent infecter un certain nombre de primates tels que chimpanzés, orangs-outans, gibbons avec des souches phylogénétiquement très proches du virus de l'hépatite B (VHB) humain. Huit génotypes différents, désignés par des lettres de A à H, sont identifiés sur des variations (supérieures à 8 %) portant sur la séquence nucléotidique de l'ensemble du génome. Répartis selon des zones géographiques précises, les génotypes influent sur l'évolution de la maladie et sur l'efficacité du traitement. Au delà des génotypes, la variabilité phénotypique du génome du VHB influence les paramètres virologiques et leur interprétation de même que les décisions thérapeutiques.