L'électrophorèse est une technique physicochimique qui sépare des constituants ionisés dans un champ électrique. Pour l'analyse des protéines et des acides nucléiques, les techniques actuelles utilisent principalement le gel d'agarose comme support de migration. En biologie clinique, l'électrophorèse est souvent semi-automatisée et fait appel à des kits commerciaux prêts à l'emploi. Développée plus récemment, la technologie capillaire permet un gain de résolution, de rapidité et d'automatisation. Des appareils permettant l'analyse des protéines du sérum humain avec une cadence élevée sont aujourd'hui disponibles sur le marché. En recherche, l'électrophorèse capillaire est aussi un outil très performant permettant, par exemple, l'analyse des produits d'amplification de l'ADN. Les développements futurs de la technologie capillaire concernent les traitements de la paroi interne du capillaire, l'amélioration de la sensibilité, le traitement informatique des données et la miniaturisation.