Bien que le niveau de preuve reliant l'homocystéine plasmatique et les maladies cardio-vasculaires soit élevé, le rôle de l'homocystéine en tant que facteur de risque cardio-vasculaire causal reste controversé. Les études prospectives dans des populations à risque cardio-vasculaire élevé retrouvent généralement une relation positive entre homocystéine plasmatique et niveau de risque cardio-vasculaire. Néanmoins, les études prospectives dans des populations à risque cardio-vasculaire plus faible retrouvent soit une association plus faible soit pas d'association du tout. Il n'existe pas, à ce jour, de preuve de réversibilité du risque cardio-vasculaire attribuable à l'hyperhomocystéinémie; néanmoins, certaines études se focalisant sur des critères intermédiaires de jugement accréditent l'hypothèse d'un bénéfice lié à la réduction des taux plasmatiques d'homocystéine. Plusieurs essais d'intervention sont en cours et la réponse à la question d'un bénéfice cardio-vasculaire lié à la réduction de l'homocystéine sera disponible dans les toutes prochaines années.