>La cartographie comparée est une analyse comparative de l'organisation chromosomique des génomes, qui repose sur l'exploitation de la biodiversité dans le double objectif de comprendre le fonctionnement des structures biologiques et d'en inférer l'évolution. La popularité actuelle de cette approche relève cependant d'une autre démarche, plus technique, qui résulte de la structure très particulière des connaissances actuelles sur les génomes. Le coût expérimental de l'analyse d'un génome restant très élevé, les informations disponibles sont le plus souvent concentrées sur quelques organismes « modèles » (principalement l'homme et la souris chez les mammifères). Déduire des informations sur des organismes d'intérêt, à partir de l'étude d'organismes modèles, est donc une démarche très précieuse, et la cartographie comparée entre dans ce cadre. Il faut également souligner que les comparaisons entre génomes peuvent être plus complexes et profiter des possibilités expérimentales offertes par certaines espèces. Ainsi, bien que l'homme soit l'un des organismes les mieux connus, la cartographie comparée est largement utilisée pour effectuer des allers-retours entre l'information génomique humaine et celle d'autres organismes dans lesquels l'observation, voire l'expérimentation génétique, est plus accessible. <.