La recherche des facteurs génétiques de la dermatite atopique est difficile en raison de plusieurs éléments: variations de la définition du phénotype, incertitude sur les meilleurs modèles génétiques, intrication de facteurs héréditaires et de facteurs d'environnement. Les études de prévalence familiale et les études de jumeaux ont mis en évidence l'importance des facteurs héréditaires. Les déterminants génétiques impliqués dans la prédisposition à la dermatite atopique sont parfois communs avec ceux de l'atopie à forme respiratoire ou de la régulation des taux d'IgE, mais sont également parfois distincts. Plusieurs études familiales ou de populations ont suggéré le rôle de gènes codant différentes protéines : sous-unité β du récepteur de haute affinité au Fc des IgE (chromosome 11), antigènes de classe II du complexe majeur d'histocompatibilité (chromosome 6), interleukine 4 (chromosome 5), sous-unité a du récepteur à l'interleukine 4 (chromosome 16), chymase mastocytaire (chromosome 14). La multiplicité des gènes en cause illustre le phénomène d'hétérogénéité génétique.