Les zoonoses infectieuses (bactériennes et virales) peuvent être classées en fonction des modalités de contamination de l'homme. Certaines se transmettent presque exclusivement par morsure ou griffure : il s'agit de la rage, la maladie des griffes du chat, la pasteurellose d'inoculation et certaines infections apparentées. D'autres maladies se transmettent par contact direct ou sur un mode indirect. Les chiens et les chats, exposés à la tuberculose humaine, constituent une source de réinfection secondaire pour l'homme. La leptospirose, fréquente chez le chien, est rarement transmise à l'homme par cette espèce. L'homme est aussi exposé à certaines infections du tube digestif comme la salmonellose, la campylobactériose et la yersiniose. Un rôle des chiens et chats dans l'épidémiologie de l'hélicobactériose humaine est de plus en plus envisagé. Le chat peut aussi retransmettre à l'homme des maladies contractées en chassant des petits rongeurs sauvages, comme le cowpox, identifié dans de nombreux pays européens, ou, en Amérique du Nord, la tularémie et même la peste. Le chat est parfois cité comme source de fièvre Q pour l'homme, et le chien peut transmettre la brucellose. Le chien est enfin concerné par certaines maladies transmises à l'homme par morsure de tique, borréliose de Lyme et fièvre boutonneuse méditerranéenne en particulier. Indépendamment des mesures réglementaires auxquelles est soumise la rage, la prévention de ces zoonoses reste individuelle. Elle est fondée sur l'information des personnes possédant un chien ou un chat, une intervention rapide en cas de morsure ou griffure et une hygiène de vie raisonnée.