La plupart des granulomatoses (infectieuses ou non) peuvent atteindre le tube digestif. La présence d'un granulome sur une biopsie digestive est un marqueur non spécifique d'inflammation. De nombreuses affections doivent être cherchées: maladie de Crohn, tuberculose et sarcoïdose sont les plus fréquentes. D'autres causes qui ne doivent pas être ignorées sont également abordées dans cette revue : mycobactéries, sarcoïdose, histoplasmose, vascularites, syphilis, gastrite à Helicobacter pylori, maladie de Whipple, lymphomes, yersiniose, maladies granulomateuses chroniques.