Helicobacter pyloriest l'espèce d'Helicobacter adapté à l'homme. Il occupe la niche écologique particulière qu'est l'estomac où il induit une gastrite. Chez certains, la gastrite peut évoluer vers la maladie ulcéreuse ou un cancer gastrique. Cette évolution peut être due aux facteurs de l'hôte (polymorphisme des cytokines), de la bactérie (îlot de pathogénicitécag, cytotoxine VacA) ou à des facteurs environnementaux.Le diagnostic deH. pyloripeut être réalisé par des méthodes invasives où des biopsies sont obtenues : culture, examen histologique,polymerase chain reaction(PCR) ou test rapide à l'uréase. Des méthodes non invasives ont été développées, notamment le test respiratoire à l'urée marquée, un test de grande fiabilité, particulièrement adapté pour le suivi post-traitement, mais aussi le test antigénique fécal, ainsi que la détection d'anticorps dans le sérum, la salive et l'urine. La culture est importante pour étudier la sensibilité à la clarithromycine.