La surveillance des maladies et des expositions associées est un enjeu majeur en Santé-Travail, surtout pour l’identification de nouvelles menaces pour la santé des travailleurs. En complément des analyses épidémiologiques classiques, le développement de méthodes basées sur l’analyse de données existantes pourrait être un atout pour la détection précoce des maladies professionnelles. Dans ce cadre, la Mutualité sociale agricole (MSA), régime de protection sociale des travailleurs agricoles français, a souhaité développer son activité de vigilance en exploitant ses données assurantielles utilisées à des fins de remboursement de prestations de santé. En partenariat avec l’Anses, une étude pilote a été mise en place afin de développer une approche innovante de fouille de données pour rechercher sans hypothèses préalables, l’existence ou non d’un effet « type d’activité professionnelle » sur les différentes pathologies faisant l’objet d’une reconnaissance en tant qu’affection de longue durée (ALD). La population couverte par cette étude incluait plus de 2 millions de travailleurs indépendants et salariés stables dont des individus possiblement retraités depuis 2007, enregistrés au sein des données de la MSA entre 2006 et 2015. Les données médico-administratives de la MSA contiennent des informations sur les activités professionnelles, les variables socio-démographiques (âge, sexe, revenus) et les ALD, précisées via des codes CIM-10. Suite à l’accord de la CNIL, ces données ont été croisées et restructurées pour l’application de modèles logistiques et de modèles mixtes à facteurs latents. Les p-valeurs et odds ratio obtenus ont permis d’identifier des associations statistiques entre chaque combinaison d’activités professionnelles et d’ALD (ou pathologies), soumis ensuite à une expertise approfondie. À titre d’exemple, parmi les salariés stables, une association significative a été identifiée entre la maladie de Parkinson et la viticulture (p < 0,01). Les odds ratio ont montré qu’il pouvait aussi y avoir moins de déclarations d’ALD dans certaines activités professionnelles, tel que pour les artisans ruraux (OR = 0,3 [0,2–0,4]). Cette étude pilote a permis d’étudier la faisabilité et la pertinence de l’usage des données de la MSA à des fins de vigilance sanitaire chez les travailleurs agricoles. Des travaux complémentaires ont été initiés en partenariat avec Santé Publique France afin de mettre en place un proxy de l’usage des phytosanitaires. Cette approche sera aussi complétée à terme par l’identification des pathologies via la consommation médicamenteuse.