L’analyse biochimique de base du liquide cérébrospinal (LCS) se limite à doser les protéines (protéinorachie) et le glucose (glyco- rachie) ; elle est toujours complétée par une analyse cytologique et bactériologique, tout en notant l’aspect du LCS. C’est l’examen de base pour établir le diagnostic des méningites infectieuses ou d’une hémorragie sous- arachnoïdienne. De nombreux examens biochimiques complémentaires ont été développés avec l’électrophorèse, l’étude des immunoglobulines, l’application d’index de transsudation et de synthèses intrathécales, l’isoélectrofocalisation à la recherche de bandes oligoclonales caractéristiques de la sclérose en plaques, ainsi que le développement de biomarqueurs des maladies neurologiques inflammatoires et en particulier neurodégénératives. Les protéines tau et tau-phosphorylée aident au diagnostic différentiel de la maladie d’Alzheimer. La neurosarcoïdose est diagnostiquée par l’élévation de l’activité de l’enzyme de conversion de l’angiotensine dans le LCS. Les neurotransmetteurs permettent l’étude des maladies neurologiques infantiles avec mouvements anormaux.