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Base de données complète et complexe des allèles RHD : RHeference

Auteurs : Floch A1, Télétchéa S2, Pirenne F1, Tournamille C1, De Brevern Alexandre G3
Affiliations : 1EFS Ile-de-France, Inserm U955 Équipe 2, institut Mondor de Recherche Biomédicale, UPEC, Labex GR-Ex, Créteil, France2CNRS UMR 6286, UFIP, Université de Nantes, Nantes, France3Inserm UMR_S 1134, Université de Paris, Université de la Réunion, INTS, Labex GR-Ex, Paris, France
Date 2019 Septembre, Vol 26, Num 3, Supplement, pp S12-S12Revue : Transfusion clinique et biologique : journal de la Société française de transfusion sanguineDOI : 10.1016/j.tracli.2019.06.266
CL-23
Résumé

Depuis la découverte des bases moléculaires du système de groupe sanguin RH dans les années 1990, des centaines d’articles rapportent régulièrement de nouveaux allèles RH ainsi que des données hétérogènes : moléculaire, sérologique.. Les listes d’allèles existantes (Tables d’allèles de l’ISBT, site internet Rhesus Base), ne sont pas exhaustives et proposent très peu de fonctionnalités. Nous avons mis en place une base de données moderne, RHeference, basée sur BioDjango, un cadre de développement web en Python, contenant toutes les connaissances relatives aux allèles RHD, sans décalage du cadre de lecture, grâce à une revue exhaustive de la littérature scientifique. RHeference recense les bases moléculaires des allèles, les nomenclatures, l’expression des antigènes RH, les alloimmunisations associées décrites, le caractère faible ou partiel de l’antigène Rh1 (D).. L’origine de chaque information est indiquée dans la fiche de l’allèle, notamment la référence bibliographique de sa première description. RHeference permet une navigation aisée par requêtes pré-calculées : à partir de données moléculaires (mutations ou au contraire absence de mutations à certaines positions), par nom, par expression antigénique, par référence bibliographique. Des liens dédiés permettent de parcourir les données de manière transversale. Avec plusieurs centaines de références et 443 allèles, RHeference permet une vue d’ensemble des connaissances actuelles sur le gène RHD et a pour vocation à devenir son portail d’entrée principal. L’évolution de la base se fera par l’intégration des données scientifiques issues de la littérature, et de nouvelles fonctionnalités en lien avec la structure 3D.

Des descripteurs MeSH seront prochainement assignés à cet article.

 Source : Elsevier-Masson
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Floch A, Télétchéa S, Pirenne F, Tournamille C, De Brevern A. Base de données complète et complexe des allèles RHD : RHeference. Transfus Clin Biol. 2019 Sep;26(3):S12-S12.
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Dernière date de mise à jour : 29/08/2019.


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