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Guip1 : une interface graphique pour la planification des essais cliniques de phase I

Auteurs : Fraisse J1, Dinart D2, Tosi D1, Mauguen A3, Laghzali Y1, Touraine C1, Le Deley M-C4, Bellera C2, Mollevi C1
Affiliations : 1Institut du cancer de Montpellier (ICM), université de Montpellier, Montpellier, France2Inserm CIC1401, Module épidémiologie clinique, Institut Bergonié, Bordeaux, France3Memorial Sloan Kettering Cancer Center, New-York, États-Unis
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Date 2018 Mai, Vol 66, pp S176-S177Revue : Revue d'épidémiologie et de santé publiqueDOI : 10.1016/j.respe.2018.03.299
PM4.2
Résumé

IntroductionL’objectif principal des essais cliniques de phase I en oncologie est d’identifier le plus rapidement possible et le plus précisément la dose maximale tolérée, définie classiquement comme la dose à laquelle on observe des toxicités intolérables pour une proportion donnée de patients. Plusieurs méthodes d’escalade de dose basées sur une modélisation mathématique de la relation dose-toxicité ont été développées. Dans ce contexte, la méthode de réévaluation continue (« Continual Reassessment Method » [CRM]) introduite par O’Quickley et al. (bayésienne ou fréquentiste) a émergé dans les années 1990. Plus récemment, des variantes telles que l’« Escalation With Overdose Control » (EWOC) qui intègre en plus la contrainte éthique de minimiser la probabilité de traiter des patients à des doses excessivement élevées et les méthodes « Time To Event » (TITE-CRM et TITE-EWOC) qui prennent en compte le délai d’apparition de l’évènement pour les toxicités tardives ont été proposées. Plusieurs logiciels implémentent chacune des méthodes, cependant, aucun ne les rassemble. L’objectif de ce travail est de proposer une interface graphique conviviale et facile à utiliser qui combine l’ensemble des approches et implémente la méthode TITE-EWOC.MéthodesDifférents packages R et fonctions implémentant ces méthodes ont été sélectionnés. La fonction « crm » du package « dfcrm » pour implémenter les méthodes CRM ainsi que la fonction « titecrm » de la même librairie pour la méthode TITE-CRM. La fonction « bcrm » du package du même nom pour la méthode EWOC. Enfin, la méthode TITE-EWOC qui n’était pas disponible sous R a été programmée. Une interface graphique « GUIP1 » pour « Graphical User Interface for Phase 1 » a été réalisée sous le logiciel R en utilisant le langage de programmation TCL/TK via les packages tcltk, tkrplot et tcltk2.RésultatsAprès installation de la librairie GUIP1, l’exécution de la commande GUIP1() génère une interface permettant d’utiliser l’ensemble des cinq méthodes décrites précédemment. Une fenêtre est produite par méthode avec divers onglets permettant de renseigner les paramètres cliniques initiaux et ceux spécifiques du modèle choisi. L’interface a été développée pour à la fois réaliser des simulations et gérer un essai clinique en temps réel. Plusieurs options permettant un suivi de l’essai sont disponibles notamment, un export des résultats d’étude et/ou des simulations sous forme de tableaux (par patient et/ou par palier de dose) et de graphiques via des fichiers .pdf et .png, respectivement. Les différentes fonctionnalités seront illustrées à partir d’un exemple concret.ConclusionL’interface GUIP1 permet de réaliser des simulations et gérer des essais cliniques de phase I en utilisant des approches récentes de façon simple et conviviale avec une sauvegarde automatique des résultats. Ces méthodes d’escalade de dose sont encore sous utilisées en pratique, et, nous espérons que la création d’un tel package, actuellement en cours de dépôt sur le CRAN, favorisera et facilitera leur utilisation dans les futurs essais cliniques de phase I.

Mot-clés auteurs
GUIP1; Interface; R; Phase I;

Des descripteurs MeSH seront prochainement assignés à cet article.

 Source : Elsevier-Masson
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Citer cet article
Fraisse J, Dinart D, Tosi D, Mauguen A, Laghzali Y, Touraine C, Le Deley M-C, Bellera C, Mollevi C. Guip1 : une interface graphique pour la planification des essais cliniques de phase I. Rev Epidemiol Sante Publique. 2018 Mai;66:S176-S177.
Courriel(Nous ne répondons pas aux questions de santé personnelles).
Dernière date de mise à jour : 13/07/2018.


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