Les kératites fongiques ou kératomycoses sont des infections cornéennes auxquelles il faut penser en cas de traumatisme cornéen, pathologie chronique de surface oculaire, utilisation de corticoïdes ou port de lentilles de contact. Champignons filamenteux ou levures peuvent être en cause. L’existence d’un infiltrat stromal à surface bombée et/ou à bords flous irréguliers, l’extension de l’infection en profondeur dans le stroma alors que l’épithélium cicatrise, la présence de foyers infectieux satellites, l’absence d’amélioration des lésions sous traitement antibiotique et leur aggravation sous corticoïdes doivent faire évoquer la possibilité d’une kératite fongique. Dès lors, un grattage cornéen pour examen microbiologique est souhaitable avant de débuter au plus vite un traitement médical antifongique. Le recours à différentes techniques de chirurgie cornéenne est nécessaire dans un nombre non négligeable de cas. Le pronostic des kératites fongiques est bien plus mauvais que celui des kératites bactériennes.