L'augmentation des actes endoscopiques et des risques infectieux entraîne un intérêt particulier pour les procédures d'entretien du matériel d'endoscopie. L'objectif de cette étude était de mettre au point et de valider une méthode de prélèvement microbiologique des canaux (aspiration, biopsie, air/eau) des endoscopes souples. Un inoculum constitué de matières fécales et d'une suspension de micro-organismes (Pseudomonas aeruginosa, ou Candida albicans), à une concentration faible ou forte, a été injecté dans les canaux d'un endoscope digestif. Cinq essais ont été réalisés pour chaque micro-organisme à chacune des deux concentrations. Après incubation, un prélèvement global des canaux a été réalisé avec une solution de récupération et un dénombrement a été effectué. Une analyse de variance pour mesures répétées (ANOVA) a été réalisée sur l'ensemble des résultats. La différence moyenne mise en évidence entre les concentrations injectées et cclles récupérées est de 0,114 log (IC_95% [+0,088; + 0,140] ). Elle ne varie pas significativement suivant le type de micro-organismes (p = 0,65) et la taille des inoculums (p = 0,70). Le coefficient de variation de 0,525 (min: 0,010; max: 0,260) montre que cette méthode est reproductible. Cette technique peut donc être recommandée pour évaluer et valider les procédures d'entretien des endoscopes.