La notion de zoonose émergente ou réémergente est une question relativement complexe. Elle recouvre des agents pathogènes nouveaux ou récemment identifiés ou encore des agents pathogènes déjà connus, se manifestant dans des zones ou des espèces où on ne les avait jamais signalés auparavant. Elle recouvre également des agents zoonosiques qui avaient disparu dans certains pays pour réapparaître, le plus souvent sous forme épidémique. Beaucoup d'espèces animales, sauvages ou d'élevage, et de nombreux agents infectieux sont ainsi concernés par ce phénomène. D'une manière générale, on sera plus à même d'intervenir sur des espèces domestiques par la vaccination ou l'élimination des suspects ou contaminés, que sur les espèces sauvages, et ceci d'autant plus que ces espèces sont parfois déjà considérées comme menacées ou en voie d'extinction. La diversité des agents pathogènes, des animaux vecteurs et des populations cibles implique des profils épidémiologiques variés et des actions de surveillance et de lutte appropriées pour chaque pathologie.