Dans le cadre de la théorie neurodéveloppementale des schizophrénies, il est nécessaire d'établir un lien entre des facteurs étiologiques potentiels précoces et le moment de l'éclosion des symptômes, qui se situe à la fin de l'adolescence et au début de l'âge adulte. L'élagage synaptique, c'est-à-dire la disparition d'une forte proportion des synapses produites en grande quantité au cours du développement, se situe à cette même période et pourrait donc jouer un rôle causal ou déclenchant. Compte tenu des autres anomalies cérébrales et des données cliniques et épidémiologiques rapportées dans les troubles schizophréniques, les hypothèses les plus probables sont celles qui intègrent l'élagage synaptique au sein d'une perturbation plus large du développement cortical dans les zones préfrontales, temporales et limbiques, que ces perturbations soient précoces, pré- ou périnatales, ou plus tardives, survenant lors de l'adolescence. On ne peut pas non plus exclure une atteinte isolée de l'élagage synaptique dans un sous-groupe de patients schizophrènes.