La résistance bactérienne, phénomène fréquent et en perpétuelle évolution, touche actuellement tous les antibiotiques. L'acquisition d'une résistance est la conséquence de mutations chromosomiques ou de l'apport de matériel génétique sous forme de plasmides ou de transposons. Les principaux mécanismes, qui peuvent être isolés ou associés, regroupent la modification de la perméabilité bactérienne, l'altération de la cible de l'agent anti-infectieux et la synthèse d'enzymes inhibant l'activité de l'antibiotique. Des micro-organismes comme Staphylococcus aureus, Streptococcus pneumoniae, Haemophilus influenzae, Pseudomonas aeruginosa et certaines entérobactéries ont développé, à des degrés divers, des résistances contre les antibiotiques initialement ou récemment introduits, ce qui pose dans certains cas de réels problèmes thérapeutiques. Le médecin prescripteur doit connaître les principaux phénotypes bactériens de résistance, ainsi que les règles d'association des antibiotiques, afin d'instituer un traitement anti-infectieux efficace qui permettra la guérison du patient et limitera toute induction de résistance ou sélection de mutants résistants.