Haemophilus influenzaeest un hôte saprophyte habituel du rhinopharynx: il est en effet présunt dans les fosses nasales ou dans la gorge chez près des deux tiers des enfants et presoue aussi fréquemment chez les adultes. Les souches non capsulées sont de très loin les pius fréquentes, les souches de type capsulaire b n'étant identifiées que dans 5% des prélèvements; les autres souches capsulées sont rares. La transmission s'effectue par les gouttelettes de salive ou par contact direct; elle est donc grandement facilitée par la promiscuité (familles, crèches). La colorisation est le résultat de l'adhésion d'Haemophilus influenzaeaux cellules épithéhales du nasopharynx; elle fait intervenir des facteurs d'adhésion (pili, adhésines, IgAl protéases), mais ces facteurs d'adhésion ne sont pas retrouvés pour toutes les souches. L'infection systémique est le résultat de l'invasion de l'épithélium pharyngé, volontiers facilitée par une infection virale préalable des voies aériennes supérieures. Il existe un risque de méningite chaque fois que les bactériémies atteignent un taux élevé (≥10⁵unités formant colonie [CFU]/ml). Les facteurs de risque d'infection systémique sont le jeune âge (enfant de moins de 5 ans), l'altération du système réticulo-endothélial, l'agammaglobulinémie. Le vaccin anti-Haemophilusb prévient pratiquement toutes les infections dues à ce sérotype (méningites bactériennes, épiglottites) et diminue ou supprime de façon importante la colonisation.