Différentes méthodes sont utilisées en pratique courante. Des méthodes anatomiques permettant de visualiser directement le thrombus: l'une invasive, la phlébographie, l'autre non invasive, l'échographie, très compétitive avec la précédente et qui a l'avantage d'étudier les structures avoisinantes et de fournir des renseignements fonctionnels lorsqu'elle est couplée au Doppler. Des méthodes isotopiques utilisant l'incorporation de corps radioactifs dans les facteurs de la coagulation aboutissant à la formation du thrombus tel que le test au fibrinogène marqué à l'iode 125. Des méthodes biologiques reflétant la formation et la dissolution d'un thrombus: c'est le dosage plasmatique du D-dimer, produit de dégradation spécifique de la fibrine.