En fonction de l'émergence de la chloroquino-résistance dans l'Océan Indien, et en particulier à Madagascar, le protocole de surveillance de l'Organisation Mondiale de la Santé in vivo a été mis en place à la fin de 1985 à Mayotte. Malgré les difficultés pour réaliser les différents prélèvements, 24% des cas de paludisme ont pu être suivis de 1985 à 1987. La possibilité d'une réinfection ne pouvant être formellement exclue, l'interprétation de l'épreuve standard révèle l'existence de résistance de type R I et R II. Le maintien de ce protocole de surveillance constitue pour le moment une priorité; la chloroquine demeure cependant efficace, dans la majorité des cas.